RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539589.5

PACSIN3-211, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene PACSIN3, Length 2,009 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-211ENST00000539589 RXFP1Q9HBX9 757 aa20.7■□□□□ 0.9
PACSIN3-211ENST00000539589 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
PACSIN3-211ENST00000539589 COMMD8Q9NX08 183 aa20.7■□□□□ 0.9
PACSIN3-211ENST00000539589 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP20.7■□□□□ 0.9
PACSIN3-211ENST00000539589 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
PACSIN3-211ENST00000539589 ETV4P43268 484 aa20.69■□□□□ 0.9
PACSIN3-211ENST00000539589 TUFMP49411 452 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
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PACSIN3-211ENST00000539589 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
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PACSIN3-211ENST00000539589 TMEM51Q9NW97 253 aa20.69■□□□□ 0.9
PACSIN3-211ENST00000539589 CLIC5Q9NZA1 410 aa20.69■□□□□ 0.9
PACSIN3-211ENST00000539589 GGT7Q9UJ14 662 aa20.69■□□□□ 0.9
PACSIN3-211ENST00000539589 RFPL1O75677 317 aa20.68■□□□□ 0.9
PACSIN3-211ENST00000539589 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
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PACSIN3-211ENST00000539589 SLC39A13Q96H72 371 aa20.68■□□□□ 0.9
PACSIN3-211ENST00000539589 AGAP3Q96P47 875 aa20.68■□□□□ 0.9
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PACSIN3-211ENST00000539589 SYBUQ9NX95 663 aa20.68■□□□□ 0.9
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PACSIN3-211ENST00000539589 TEX28O15482 410 aa20.68■□□□□ 0.9
PACSIN3-211ENST00000539589 PAGE1O75459 146 aa20.68■□□□□ 0.9
PACSIN3-211ENST00000539589 UBOX5O94941 541 aa20.68■□□□□ 0.9
PACSIN3-211ENST00000539589 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
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PACSIN3-211ENST00000539589 ZBTB17Q13105 803 aa20.68■□□□□ 0.9
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PACSIN3-211ENST00000539589 PPP2R5DQ14738 602 aa20.68■□□□□ 0.9
PACSIN3-211ENST00000539589 GALNTL6Q49A17 601 aa20.68■□□□□ 0.9
PACSIN3-211ENST00000539589 FYB2Q5VWT5 728 aa20.68■□□□□ 0.9
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PACSIN3-211ENST00000539589 RMDN2Q96LZ7 410 aa20.68■□□□□ 0.9
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PACSIN3-211ENST00000539589 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
PACSIN3-211ENST00000539589 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
PACSIN3-211ENST00000539589 MKS1Q9NXB0 559 aa20.68■□□□□ 0.9
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa20.68■□□□□ 0.9
PACSIN3-211ENST00000539589 CHD9Q3L8U1 2897 aa20.68■□□□□ 0.9
PACSIN3-211ENST00000539589 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
PACSIN3-211ENST00000539589 KCNU1A8MYU2 1149 aa20.67■□□□□ 0.9
PACSIN3-211ENST00000539589 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
PACSIN3-211ENST00000539589 CD68P34810 354 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
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PACSIN3-211ENST00000539589 OR52K1Q8NGK4 314 aa20.67■□□□□ 0.9
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PACSIN3-211ENST00000539589 TEKT5Q96M29 485 aa20.67■□□□□ 0.9
PACSIN3-211ENST00000539589 SERPINB11Q96P15 392 aa20.67■□□□□ 0.9
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PACSIN3-211ENST00000539589 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa20.67■□□□□ 0.9
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PACSIN3-211ENST00000539589 SHROOM3Q8TF72 1996 aa20.66■□□□□ 0.9
PACSIN3-211ENST00000539589 NEFHP12036 1026 aa20.66■□□□□ 0.9
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PACSIN3-211ENST00000539589 HOXC13P31276 330 aa20.66■□□□□ 0.9
PACSIN3-211ENST00000539589 SERPINB4P48594 390 aa20.66■□□□□ 0.9
PACSIN3-211ENST00000539589 FBXW10Q5XX13 1052 aa20.66■□□□□ 0.9
PACSIN3-211ENST00000539589 SPRED2Q7Z698 418 aa20.66■□□□□ 0.9
PACSIN3-211ENST00000539589 UNC5BQ8IZJ1 945 aa20.66■□□□□ 0.9
PACSIN3-211ENST00000539589 DNAAF3Q8N9W5 541 aa20.66■□□□□ 0.9
PACSIN3-211ENST00000539589 TBC1D31Q96DN5 1066 aa20.66■□□□□ 0.9
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