RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533817.5

TSTA3-216, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 3

Gene TSTA3, Length 871 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-216ENST00000533817 SIN3BO75182 1162 aa15.18■□□□□ 0.02
TSTA3-216ENST00000533817 RPP40O75818 363 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
TSTA3-216ENST00000533817 MT-CO1P00395 513 aa15.18■□□□□ 0.02
TSTA3-216ENST00000533817 SRCP12931 536 aa15.18■□□□□ 0.02
TSTA3-216ENST00000533817 NNMTP40261 264 aa15.18■□□□□ 0.02
TSTA3-216ENST00000533817 P2RY2P41231 377 aa15.18■□□□□ 0.02
TSTA3-216ENST00000533817 ARF5P84085 180 aa15.18■□□□□ 0.02
TSTA3-216ENST00000533817 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa15.18■□□□□ 0.02
TSTA3-216ENST00000533817 C9orf64Q5T6V5 341 aa15.18■□□□□ 0.02
TSTA3-216ENST00000533817 IL31Q6EBC2 164 aa15.18■□□□□ 0.02
TSTA3-216ENST00000533817 LINGO4Q6UY18 593 aa15.18■□□□□ 0.02
TSTA3-216ENST00000533817 PGBD3Q8N328 593 aa15.18■□□□□ 0.02
TSTA3-216ENST00000533817 TSC1Q92574 1164 aa15.18■□□□□ 0.02
TSTA3-216ENST00000533817 PTPRN2Q92932 1015 aa15.18■□□□□ 0.02
TSTA3-216ENST00000533817 CSPG4P5Q96PW8 444 aa15.18■□□□□ 0.02
TSTA3-216ENST00000533817 SEMA4AQ9H3S1 761 aa15.18■□□□□ 0.02
TSTA3-216ENST00000533817 LRRC19Q9H756 370 aa15.18■□□□□ 0.02
TSTA3-216ENST00000533817 FBRSQ9HAH7 460 aa15.18■□□□□ 0.02
TSTA3-216ENST00000533817 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa15.18■□□□□ 0.02
TSTA3-216ENST00000533817 CD93Q9NPY3 652 aa15.18■□□□□ 0.02
TSTA3-216ENST00000533817 NUP205Q92621 2012 aa15.17■□□□□ 0.02
TSTA3-216ENST00000533817 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa15.17■□□□□ 0.02
TSTA3-216ENST00000533817 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
TSTA3-216ENST00000533817 BTNL10A8MVZ5 291 aa15.17■□□□□ 0.02
TSTA3-216ENST00000533817 RASA4BC9J798 803 aa15.17■□□□□ 0.02
TSTA3-216ENST00000533817 K7ERQ8 282 aa15.17■□□□□ 0.02
TSTA3-216ENST00000533817 DCLK1O15075 740 aa15.17■□□□□ 0.02
TSTA3-216ENST00000533817 PJA2O43164 708 aa15.17■□□□□ 0.02
TSTA3-216ENST00000533817 DAPK3O43293 454 aa15.17■□□□□ 0.02
TSTA3-216ENST00000533817 RASA4O43374 803 aa15.17■□□□□ 0.02
TSTA3-216ENST00000533817 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
TSTA3-216ENST00000533817 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
TSTA3-216ENST00000533817 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
TSTA3-216ENST00000533817 CD160O95971 181 aa15.17■□□□□ 0.02
TSTA3-216ENST00000533817 CD48P09326 243 aa15.17■□□□□ 0.02
TSTA3-216ENST00000533817 VAV1P15498 845 aa15.17■□□□□ 0.02
TSTA3-216ENST00000533817 GJC1P36383 396 aa15.17■□□□□ 0.02
TSTA3-216ENST00000533817 PLA2G5P39877 138 aa15.17■□□□□ 0.02
TSTA3-216ENST00000533817 ARL4AP40617 200 aa15.17■□□□□ 0.02
TSTA3-216ENST00000533817 SLC1A1P43005 524 aa15.17■□□□□ 0.02
TSTA3-216ENST00000533817 NOP2P46087 812 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
TSTA3-216ENST00000533817 VAV2P52735 878 aa15.17■□□□□ 0.02
TSTA3-216ENST00000533817 CDH6P55285 790 aa15.17■□□□□ 0.02
TSTA3-216ENST00000533817 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
TSTA3-216ENST00000533817 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
TSTA3-216ENST00000533817 DLG2Q15700 870 aa15.17■□□□□ 0.02
TSTA3-216ENST00000533817 MAP7D1Q3KQU3 841 aa15.17■□□□□ 0.02
TSTA3-216ENST00000533817 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
TSTA3-216ENST00000533817 AFMIDQ63HM1 303 aa15.17■□□□□ 0.02
TSTA3-216ENST00000533817 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
TSTA3-216ENST00000533817 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
TSTA3-216ENST00000533817 TMPRSS6Q8IU80 811 aa15.17■□□□□ 0.02
TSTA3-216ENST00000533817 NPWQ8N729 165 aa15.17■□□□□ 0.02
TSTA3-216ENST00000533817 SUMF1Q8NBK3 374 aa15.17■□□□□ 0.02
TSTA3-216ENST00000533817 RLN3Q8WXF3 142 aa15.17■□□□□ 0.02
TSTA3-216ENST00000533817 HMCESQ96FZ2 354 aa15.17■□□□□ 0.02
TSTA3-216ENST00000533817 LACRTQ9GZZ8 138 aa15.17■□□□□ 0.02
TSTA3-216ENST00000533817 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
TSTA3-216ENST00000533817 ETNK2Q9NVF9 386 aa15.17■□□□□ 0.02
TSTA3-216ENST00000533817 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
TSTA3-216ENST00000533817 ACTL7AQ9Y615 435 aa15.17■□□□□ 0.02
TSTA3-216ENST00000533817 SPAG17Q6Q759 2223 aa15.16■□□□□ 0.02
TSTA3-216ENST00000533817 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
TSTA3-216ENST00000533817 KDELR3O43731 214 aa15.16■□□□□ 0.02
TSTA3-216ENST00000533817 KRT7P08729 469 aa15.16■□□□□ 0.02
TSTA3-216ENST00000533817 COMTP21964 271 aa15.16■□□□□ 0.02
TSTA3-216ENST00000533817 AMPD1P23109 780 aa15.16■□□□□ 0.02
TSTA3-216ENST00000533817 IL4RP24394 825 aa15.16■□□□□ 0.02
TSTA3-216ENST00000533817 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
TSTA3-216ENST00000533817 CLCN6P51797 869 aa15.16■□□□□ 0.02
TSTA3-216ENST00000533817 NDST2P52849 883 aa15.16■□□□□ 0.02
TSTA3-216ENST00000533817 RPS14P62263 151 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
TSTA3-216ENST00000533817 SLC20A2Q08357 652 aa15.16■□□□□ 0.02
TSTA3-216ENST00000533817 SERINC3Q13530 473 aa15.16■□□□□ 0.02
TSTA3-216ENST00000533817 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
TSTA3-216ENST00000533817 DPYSL3Q14195 570 aa15.16■□□□□ 0.02
TSTA3-216ENST00000533817 KRT81Q14533 505 aa15.16■□□□□ 0.02
TSTA3-216ENST00000533817 PARP15Q460N3 678 aa15.16■□□□□ 0.02
TSTA3-216ENST00000533817 RETSATQ6NUM9 610 aa15.16■□□□□ 0.02
TSTA3-216ENST00000533817 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa15.16■□□□□ 0.02
TSTA3-216ENST00000533817 FRMD1Q8N878 549 aa15.16■□□□□ 0.02
TSTA3-216ENST00000533817 ATP11CQ8NB49 1132 aa15.16■□□□□ 0.02
TSTA3-216ENST00000533817 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
TSTA3-216ENST00000533817 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
TSTA3-216ENST00000533817 FAM122AQ96E09 287 aa15.16■□□□□ 0.02
TSTA3-216ENST00000533817 SIPA1Q96FS4 1042 aa15.16■□□□□ 0.02
TSTA3-216ENST00000533817 FAM129BQ96TA1 746 aa15.16■□□□□ 0.02
TSTA3-216ENST00000533817 DESI2Q9BSY9 194 aa15.16■□□□□ 0.02
TSTA3-216ENST00000533817 KLHL11Q9NVR0 708 aa15.16■□□□□ 0.02
TSTA3-216ENST00000533817 DONSONQ9NYP3 566 aa15.16■□□□□ 0.02
TSTA3-216ENST00000533817 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
TSTA3-216ENST00000533817 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
TSTA3-216ENST00000533817 INVSQ9Y283 1065 aa15.16■□□□□ 0.02
TSTA3-216ENST00000533817 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa15.16■□□□□ 0.02
TSTA3-216ENST00000533817 HYOU1Q9Y4L1 999 aa15.16■□□□□ 0.02
TSTA3-216ENST00000533817 DUSP10Q9Y6W6 482 aa15.16■□□□□ 0.02
TSTA3-216ENST00000533817 USP34Q70CQ2 3546 aa15.16■□□□□ 0.02
TSTA3-216ENST00000533817 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa15.15■□□□□ 0.02
TSTA3-216ENST00000533817 PRR23AA6NEV1 266 aa15.15■□□□□ 0.02
TSTA3-216ENST00000533817 ZNF217O75362 1048 aa15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.7 ms