RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524770.5

GMDS-AS1-203, humanhuman

TSL 3

Gene GMDS-AS1, Length 565 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-203ENST00000524770 HSPH1Q92598 858 aa20.5■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-203ENST00000524770 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-203ENST00000524770 SPACA7Q96KW9 195 aa20.5■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-203ENST00000524770 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-203ENST00000524770 SPON2Q9BUD6 331 aa20.5■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-203ENST00000524770 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-203ENST00000524770 MAGEH1Q9H213 219 aa20.5■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-203ENST00000524770 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa20.5■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-203ENST00000524770 CD93Q9NPY3 652 aa20.5■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-203ENST00000524770 INVSQ9Y283 1065 aa20.5■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-203ENST00000524770 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-203ENST00000524770 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-203ENST00000524770 NUMA1Q14980 2115 aa20.5■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-203ENST00000524770 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-203ENST00000524770 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa20.49■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-203ENST00000524770 CBX4O00257 560 aa20.49■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-203ENST00000524770 DCLK1O15075 740 aa20.49■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-203ENST00000524770 VAV1P15498 845 aa20.49■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-203ENST00000524770 BCKDHBP21953 392 aa20.49■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-203ENST00000524770 ARF5P84085 180 aa20.49■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-203ENST00000524770 DPYSQ14117 519 aa20.49■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-203ENST00000524770 C9orf64Q5T6V5 341 aa20.49■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-203ENST00000524770 KBTBD6Q86V97 674 aa20.49■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-203ENST00000524770 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-203ENST00000524770 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-203ENST00000524770 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-203ENST00000524770 RAB23Q9ULC3 237 aa20.49■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-203ENST00000524770 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa20.49■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-203ENST00000524770 USP34Q70CQ2 3546 aa20.49■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-203ENST00000524770 FRYLO94915 3013 aa20.48■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-203ENST00000524770 SHROOM3Q8TF72 1996 aa20.48■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-203ENST00000524770 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa20.48■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-203ENST00000524770 H3BRJ5 948 aa20.48■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-203ENST00000524770 ZNF217O75362 1048 aa20.48■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-203ENST00000524770 MT-CO1P00395 513 aa20.48■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-203ENST00000524770 SRCP12931 536 aa20.48■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-203ENST00000524770 SSR1P43307 286 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-203ENST00000524770 HCAR3P49019 387 aa20.48■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-203ENST00000524770 HADHBP55084 474 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-203ENST00000524770 TAS2R40P59535 323 aa20.48■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-203ENST00000524770 MESDQ14696 234 aa20.48■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-203ENST00000524770 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-203ENST00000524770 LPAL2Q16609 132 aa20.48■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-203ENST00000524770 HADHQ16836 314 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-203ENST00000524770 IL31Q6EBC2 164 aa20.48■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-203ENST00000524770 LINGO4Q6UY18 593 aa20.48■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-203ENST00000524770 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-203ENST00000524770 C11orf74Q86VG3 221 aa20.48■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-203ENST00000524770 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa20.48■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-203ENST00000524770 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-203ENST00000524770 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-203ENST00000524770 PTPRN2Q92932 1015 aa20.48■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-203ENST00000524770 SIPA1Q96FS4 1042 aa20.48■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-203ENST00000524770 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-203ENST00000524770 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-203ENST00000524770 PCDH18Q9HCL0 1135 aa20.48■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-203ENST00000524770 DONSONQ9NYP3 566 aa20.48■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-203ENST00000524770 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-203ENST00000524770 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-203ENST00000524770 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa20.47■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-203ENST00000524770 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa20.47■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-203ENST00000524770 GFRA3O60609 400 aa20.47■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-203ENST00000524770 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-203ENST00000524770 GJC1P36383 396 aa20.47■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-203ENST00000524770 ARHGAP25P42331 645 aa20.47■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-203ENST00000524770 MRE11P49959 708 aa20.47■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-203ENST00000524770 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-203ENST00000524770 CLCN6P51797 869 aa20.47■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-203ENST00000524770 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-203ENST00000524770 RPS14P62263 151 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-203ENST00000524770 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-203ENST00000524770 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-203ENST00000524770 DLG2Q15700 870 aa20.47■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-203ENST00000524770 PARP15Q460N3 678 aa20.47■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-203ENST00000524770 PLK5Q496M5 336 aa20.47■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-203ENST00000524770 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-203ENST00000524770 LAIR1Q6GTX8 287 aa20.47■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-203ENST00000524770 RETSATQ6NUM9 610 aa20.47■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-203ENST00000524770 Q6ZVU0 165 aa20.47■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-203ENST00000524770 POLNQ7Z5Q5 900 aa20.47■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-203ENST00000524770 FRMD1Q8N878 549 aa20.47■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-203ENST00000524770 TSC1Q92574 1164 aa20.47■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-203ENST00000524770 HMCESQ96FZ2 354 aa20.47■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-203ENST00000524770 CYP8B1Q9UNU6 501 aa20.47■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-203ENST00000524770 TFR2Q9UP52 801 aa20.47■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-203ENST00000524770 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-203ENST00000524770 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-203ENST00000524770 RASA4BC9J798 803 aa20.46■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-203ENST00000524770 K7ERQ8 282 aa20.46■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-203ENST00000524770 RASA4O43374 803 aa20.46■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-203ENST00000524770 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-203ENST00000524770 IGLV3-19P01714 112 aa20.46■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-203ENST00000524770 ERCC2P18074 760 aa20.46■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-203ENST00000524770 ARL4AP40617 200 aa20.46■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-203ENST00000524770 GSDMDP57764 484 aa20.46■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-203ENST00000524770 PMS2CLQ68D20 193 aa20.46■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-203ENST00000524770 C22orf39Q6P5X5 142 aa20.46■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-203ENST00000524770 STK40Q8N2I9 435 aa20.46■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-203ENST00000524770 NPWQ8N729 165 aa20.46■□□□□ 0.87
GMDS-AS1-203ENST00000524770 ATP11CQ8NB49 1132 aa20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms