RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498268.1

USP34-222, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, human

TSL 3

Gene USP34, Length 497 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP34-222	ENST00000498268	C8orf82	Q6P1X6	216 aa	Predicted RBP	3.91	□□□□□ -1.78
USP34-222	ENST00000498268	IGFN1	Q86VF2	1251 aa		3.91	□□□□□ -1.78
USP34-222	ENST00000498268	TBC1D3	Q8IZP1	549 aa	Predicted RBP	3.91	□□□□□ -1.78
USP34-222	ENST00000498268	CEP76	Q8TAP6	659 aa		3.91	□□□□□ -1.78
USP34-222	ENST00000498268	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	3.91	□□□□□ -1.78
USP34-222	ENST00000498268	HDHD5	Q9BXW7	423 aa		3.91	□□□□□ -1.78
USP34-222	ENST00000498268	ZDHHC7	Q9NXF8	308 aa		3.91	□□□□□ -1.78
USP34-222	ENST00000498268	LZTS1	Q9Y250	596 aa		3.91	□□□□□ -1.78
USP34-222	ENST00000498268	RAP2C	Q9Y3L5	183 aa		3.91	□□□□□ -1.78
USP34-222	ENST00000498268	PLSCR5	A0PG75	271 aa		3.9	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	AGAP5	A6NIR3	686 aa		3.9	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	SLC38A8	A6NNN8	435 aa		3.9	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	VWA5A	O00534	786 aa		3.9	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	IGLV2-11	P01706	119 aa		3.9	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	UMOD	P07911	640 aa		3.9	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	AKT1	P31749	480 aa		3.9	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	STAT1	P42224	750 aa		3.9	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	HSPA7	P48741	367 aa		3.9	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	FMNL3	Q8IVF7	1028 aa		3.9	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	FAM185A	Q8N0U4	392 aa		3.9	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	DPP10	Q8N608	796 aa		3.9	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	OR14A16	Q8NHC5	309 aa		3.9	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	TMEM255B	Q8WV15	326 aa		3.9	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	RIPOR3	Q96MK2	946 aa		3.9	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	FIZ1	Q96SL8	496 aa		3.9	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	ACTR5	Q9H9F9	607 aa	Predicted RBP	3.9	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268		Q9N2J8	555 aa		3.9	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	PCDHGB2	Q9Y5G2	931 aa		3.9	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	PCDHA10	Q9Y5I2	948 aa		3.9	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268		A0A0A0MQY5	61 aa		3.89	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	IGLV5-52	A0A0A0MRZ9	124 aa		3.89	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268		A0A0B4J293	547 aa		3.89	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	SLC16A5	O15375	505 aa		3.89	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	SOX30	O94993	753 aa		3.89	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	UNG	P13051	313 aa	Predicted RBP	3.89	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	NPPB	P16860	134 aa		3.89	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	AMT	P48728	403 aa		3.89	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	KRTAP10-12	P60413	245 aa		3.89	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	RNASEL	Q05823	741 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	ILF3	Q12906	894 aa	Known RBP eCLIP	3.89	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	KIF19	Q2TAC6	998 aa		3.89	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	ARL6IP4	Q66PJ3	421 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	MTFR2	Q6P444	385 aa		3.89	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	ANKS1B	Q7Z6G8	1248 aa		3.89	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	FOXP4	Q8IVH2	680 aa	Predicted RBP	3.89	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	OR1N1	Q8NGS0	311 aa		3.89	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	BICD2	Q8TD16	824 aa		3.89	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	WDR60	Q8WVS4	1066 aa		3.89	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	SARG	Q9BW04	601 aa		3.89	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	FNIP2	Q9P278	1114 aa		3.89	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		3.88	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	FAM90A18P	A6NE21	464 aa		3.88	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	FAM90A16P	A6NEW6	464 aa		3.88	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	FAM90A9P	A6NNJ1	464 aa		3.88	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		3.88	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	FAM90A5P	A8MXJ8	464 aa		3.88	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	HSPB6	O14558	160 aa		3.88	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	PLA2G6	O60733	806 aa		3.88	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	SNRNP70	P08621	437 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	FAM90A15P	P0C7V4	464 aa		3.88	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	FAM90A14P	P0C7W9	464 aa		3.88	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	PRPH2	P23942	346 aa		3.88	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	NUDT6	P53370	316 aa		3.88	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	ALDH18A1	P54886	795 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	TUBA1B	P68363	451 aa		3.88	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	SF3A3	Q12874	501 aa	Known RBP eCLIP	3.88	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	SAFB	Q15424	915 aa	Known RBP eCLIP	3.88	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	ZNF569	Q5MCW4	686 aa		3.88	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	VWA5B1	Q5TIE3	1220 aa		3.88	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	HEPHL1	Q6MZM0	1159 aa		3.88	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	ZNF771	Q7L3S4	317 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	RNF144B	Q7Z419	303 aa		3.88	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	NODAL	Q96S42	347 aa		3.88	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	SPRY4	Q9C004	299 aa		3.88	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	TM7SF3	Q9NS93	570 aa		3.88	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	TMEM248	Q9NWD8	314 aa		3.88	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	DONSON	Q9NYP3	566 aa		3.88	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	CDH22	Q9UJ99	828 aa		3.88	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	SLC39A10	Q9ULF5	831 aa		3.88	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	CNTN6	Q9UQ52	1028 aa		3.88	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	LINC01553	A4QN01	128 aa		3.87	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	SAC3D1	A6NKF1	404 aa		3.87	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	HNRNPDL	O14979	420 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	NAGA	P17050	411 aa		3.87	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	HOXB9	P17482	250 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	TYK2	P29597	1187 aa		3.87	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	CYP2J2	P51589	502 aa		3.87	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	SLC39A14	Q15043	492 aa		3.87	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	MRGPRG-AS1	Q2M3A8	158 aa		3.87	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	BTBD16	Q32M84	506 aa		3.87	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	SYTL3	Q4VX76	610 aa		3.87	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	IZUMO3	Q5VZ72	239 aa		3.87	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	WBP2NL	Q6ICG8	309 aa		3.87	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	RETSAT	Q6NUM9	610 aa		3.87	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	DPP9	Q86TI2	863 aa		3.87	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	TRIM74	Q86UV6	250 aa		3.87	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	TRIM73	Q86UV7	250 aa		3.87	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		3.87	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		3.87	□□□□□ -1.79

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