RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	TLE3	Q04726	772 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	ZACN	Q401N2	412 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF394	Q53GI3	561 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	MBLAC2	Q68D91	279 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	FBXL19	Q6PCT2	694 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	NCEH1	Q6PIU2	408 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	SPACA3	Q8IXA5	215 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF276	Q8N554	614 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	RBBP8NL	Q8NC74	664 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	SAP25	Q8TEE9	199 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	HEXIM2	Q96MH2	286 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	PABPC3	Q9H361	631 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	CYP3A43	Q9HB55	503 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	SCML1	Q9UN30	329 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	CLCA2	Q9UQC9	943 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	FRMD4B	Q9Y2L6	1034 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	SHROOM3	Q8TF72	1996 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A1W2PP55	124 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	CKMT2	P17540	419 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	EPHA8	P29322	1005 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	CASP1	P29466	404 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	GALC	P54803	685 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	TMPRSS3	P57727	454 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	INCA1	Q0VD86	236 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	ILK	Q13418	452 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	TBC1D25	Q3MII6	688 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	HS1BP3	Q53T59	392 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	KDM7A	Q6ZMT4	941 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	USP30	Q70CQ3	517 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	FMNL3	Q8IVF7	1028 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC117	Q8IWD4	279 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	OXR1	Q8N573	874 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF248	Q8NDW4	579 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	SERAC1	Q96JX3	654 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	C7orf25	Q9BPX7	421 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	MMRN2	Q9H8L6	949 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	OLA1	Q9NTK5	396 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	CEP83	Q9Y592	693 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	MAST4	O15021	2626 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	KALRN	O60229	2985 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	TYW5	A2RUC4	315 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511		H3BRJ5	948 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	MID1	O15344	667 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	CPNE3	O75131	537 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	WNT1	P04628	370 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	ACPP	P15309	386 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	AFM	P43652	599 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	DAB2	P98082	770 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	RHD	Q02161	417 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	BNIP3	Q12983	259 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	CST6	Q15828	149 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	ARHGAP40	Q5TG30	622 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	ADIPOR2	Q86V24	386 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	PIGZ	Q86VD9	579 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	DHX40	Q8IX18	779 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	GALNT12	Q8IXK2	581 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM217A	Q8IXS0	508 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF557	Q8N988	423 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	OR2T34	Q8NGX1	318 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	IPO9	Q96P70	1041 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	ORAI3	Q9BRQ5	295 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	NIF3L1	Q9GZT8	377 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	RSPH9	Q9H1X1	276 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	NEUROG2	Q9H2A3	272 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	MTG2	Q9H4K7	406 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	CLMP	Q9H6B4	373 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	MAGEF1	Q9HAY2	307 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	LRRC4	Q9HBW1	653 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	DCTN4	Q9UJW0	460 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	NUMA1	Q14980	2115 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	PTPRQ	Q9UMZ3	2332 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	TLR4	O00206	839 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	IKBKB	O14920	756 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	SPTLC2	O15270	562 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	TBL1X	O60907	577 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	ZBED1	O96006	694 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	NR3C1	P04150	777 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	SLFN14	P0C7P3	912 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	SYT1	P21579	422 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	CD70	P32970	193 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	PSMD8	P48556	350 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	TKTL1	P51854	596 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	UCN	P55089	124 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	DOC2B	Q14184	412 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	SHB	Q15464	509 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	ADGRF1	Q5T601	910 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	CNNM4	Q6P4Q7	775 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	MMAA	Q8IVH4	418 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	MFN1	Q8IWA4	741 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	DDX51	Q8N8A6	666 aa	Known RBP eCLIP	11.23	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM181A	Q8N9Y4	354 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	OR14C36	Q8NHC7	312 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	ALKBH8	Q96BT7	664 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	ULBP1	Q9BZM6	244 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	BHLHE41	Q9C0J9	482 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	EXOC1	Q9NV70	894 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	SERGEF	Q9UGK8	458 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	ADAMTS1	Q9UHI8	967 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	SFMBT1	Q9UHJ3	866 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SKAP2-209	ENST00000497511	HBS1L	Q9Y450	684 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61

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