RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495350.5

CBX1-205, Transcript of chromobox 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CBX1, Length 550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-205ENST00000495350 KCNK4Q9NYG8 393 aa6.34□□□□□ -1.39
CBX1-205ENST00000495350 SALL4Q9UJQ4 1053 aa6.34□□□□□ -1.39
CBX1-205ENST00000495350 SLC25A13Q9UJS0 675 aa6.34□□□□□ -1.39
CBX1-205ENST00000495350 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa6.34□□□□□ -1.39
CBX1-205ENST00000495350 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa6.34□□□□□ -1.39
CBX1-205ENST00000495350 U3KQA8 63 aa6.34□□□□□ -1.39
CBX1-205ENST00000495350 KIF26BQ2KJY2 2108 aa6.34□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 RP1P56715 2156 aa6.33□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 YJEFN3A6XGL0 299 aa6.33□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 E7ENQ6 273 aa6.33□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 TPP1O14773 563 aa6.33□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 SPTLC2O15270 562 aa6.33□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 IGLV3-27P01718 113 aa6.33□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 APOEP02649 317 aa6.33□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 CSF2P04141 144 aa6.33□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 ANXA6P08133 673 aa6.33□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 LCP1P13796 627 aa6.33□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 CD19P15391 556 aa6.33□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 VAV1P15498 845 aa6.33□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 NME1P15531 152 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 PDGFRAP16234 1089 aa6.33□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 JUNDP17535 347 aa6.33□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 NOS2P35228 1153 aa6.33□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 UGT1A5P35504 534 aa6.33□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 CASRP41180 1078 aa6.33□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 RABIFP47224 123 aa6.33□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 NUMBP49757 651 aa6.33□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 VAMP7P51809 220 aa6.33□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 FOXK1P85037 733 aa6.33□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 SLC12A1Q13621 1099 aa6.33□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 MORC3Q14149 939 aa6.33□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 RABEP1Q15276 862 aa6.33□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 TGIF1Q15583 401 aa6.33□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 DCAF6Q58WW2 860 aa6.33□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 FSCBQ5H9T9 825 aa6.33□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 MS4A13Q5J8X5 152 aa6.33□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 ARHGAP17Q68EM7 881 aa6.33□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 OR6B2Q6IFH4 312 aa6.33□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 MSANTD2Q6P1R3 559 aa6.33□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 BORAQ6PGQ7 559 aa6.33□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 VASH2Q86V25 355 aa6.33□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 ATCAYQ86WG3 371 aa6.33□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 APCDD1Q8J025 514 aa6.33□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 LGI2Q8N0V4 545 aa6.33□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa6.33□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 CFAP52Q8N1V2 620 aa6.33□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 IQUBQ8NA54 791 aa6.33□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 BTN2A2Q8WVV5 523 aa6.33□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 TATDN2Q93075 761 aa6.33□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 AZIN2Q96A70 460 aa6.33□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 FAM131CQ96AQ9 280 aa6.33□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 PPP1R16AQ96I34 528 aa6.33□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 TMX3Q96JJ7 454 aa6.33□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 LMLNQ96KR4 655 aa6.33□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 TMEM74Q96NL1 305 aa6.33□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 SERPINB11Q96P15 392 aa6.33□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 MAGEF1Q9HAY2 307 aa6.33□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 SPASTQ9UBP0 616 aa6.33□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 PISDQ9UG56 409 aa6.33□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 ANAPC2Q9UJX6 822 aa6.33□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 TSPAN16Q9UKR8 245 aa6.33□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 ACSL6Q9UKU0 697 aa6.33□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 SARDHQ9UL12 918 aa6.33□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 DOLKQ9UPQ8 538 aa6.33□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 ICE1Q9Y2F5 2266 aa6.33□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa6.32□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 F5H5T6 163 aa6.32□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 MCF2LO15068 1137 aa6.32□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 NVLO15381 856 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 LTFP02788 710 aa6.32□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 NR3C1P04150 777 aa6.32□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 SETSIPP0DME0 302 aa6.32□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 PDCP20941 246 aa6.32□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 CD82P27701 267 aa6.32□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 GCLMP48507 274 aa6.32□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 DAOAP59103 153 aa6.32□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 CYP4F2P78329 520 aa6.32□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 KCNAB2Q13303 367 aa6.32□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 NNTQ13423 1086 aa6.32□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 FZD2Q14332 565 aa6.32□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 STK38Q15208 465 aa6.32□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 IGFBP7Q16270 282 aa6.32□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 ZNF284Q2VY69 593 aa6.32□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 PRRT3Q5FWE3 981 aa6.32□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 RABGAP1LQ5R372 815 aa6.32□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 PERM1Q5SV97 790 aa6.32□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 TMEM164Q5U3C3 297 aa6.32□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
CBX1-205ENST00000495350 NADSYN1Q6IA69 706 aa6.32□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.5 ms