RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492545.1

CTDSP1-211, Transcript of CTD small phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDSP1, Length 634 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1-211ENST00000492545 SNX10Q9Y5X0 201 aa24.27■■□□□ 1.48
CTDSP1-211ENST00000492545 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa24.26■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 A0A1W2PQC6 194 aa24.26■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 ANKRD62A6NC57 917 aa24.26■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa24.26■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 GIPC1O14908 333 aa24.26■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 CD59P13987 128 aa24.26■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 GRIA4P48058 902 aa24.26■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 CCR5P51681 352 aa24.26■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa24.26■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa24.26■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa24.26■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 AADATQ8N5Z0 425 aa24.26■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 JOSD2Q8TAC2 188 aa24.26■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 PSMB7Q99436 277 aa24.26■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 TM9SF3Q9HD45 589 aa24.26■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa24.26■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 SERGEFQ9UGK8 458 aa24.26■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 VPS51Q9UID3 782 aa24.26■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 PPM1HQ9ULR3 514 aa24.26■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 KNL1Q8NG31 2342 aa24.26■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 A0A1W2PPC4 97 aa24.25■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 TEX33O43247 280 aa24.25■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 IGHV4-34P06331 123 aa24.25■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 VAV1P15498 845 aa24.25■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 GPD1P21695 349 aa24.25■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 ETFBP38117 255 aa24.25■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 CCDC15Q0P6D6 951 aa24.25■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 CDO1Q16878 200 aa24.25■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 KLHL40Q2TBA0 621 aa24.25■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 ARTNQ5T4W7 220 aa24.25■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 ACAD10Q6JQN1 1059 aa24.25■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 RETSATQ6NUM9 610 aa24.25■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 NCEH1Q6PIU2 408 aa24.25■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 MON1BQ7L1V2 547 aa24.25■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa24.25■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 ATP11CQ8NB49 1132 aa24.25■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 NTAN1Q96AB6 310 aa24.25■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 FAM131CQ96AQ9 280 aa24.25■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 VCPIP1Q96JH7 1222 aa24.25■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 ZNF212Q9UDV6 495 aa24.25■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 FAM47DPA6NHR8 397 aa24.24■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 C10orf142B7Z368 130 aa24.24■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 SRCP12931 536 aa24.24■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 DESP17661 470 aa24.24■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 RACK1P63244 317 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 WDR59Q6PJI9 974 aa24.24■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 OR2I1PQ8NGU4 316 aa24.24■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 OR14C36Q8NHC7 312 aa24.24■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 FAM172AQ8WUF8 416 aa24.24■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 BAP1Q92560 729 aa24.24■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 SKA1Q96BD8 255 aa24.24■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 FUCA2Q9BTY2 467 aa24.24■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 EDEM3Q9BZQ6 932 aa24.24■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 GAREM1Q9H706 876 aa24.24■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa24.24■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 A0A0D9SEW6 157 aa24.23■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 A0A1B0GTH6 734 aa24.23■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 A0A1B0GVT2 93 aa24.23■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 MT-CO1P00395 513 aa24.23■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 RHOQP17081 205 aa24.23■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 PTMSP20962 102 aa24.23■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 TNFAIP3P21580 790 aa24.23■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 NUDT1P36639 197 aa24.23■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 NUMBP49757 651 aa24.23■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 ADPRHP54922 357 aa24.23■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 HDAC4P56524 1084 aa24.23■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 TPM4P67936 248 aa24.23■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 HLA-BQ31612 363 aa24.23■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 DNAJC24Q6P3W2 148 aa24.23■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 Q6ZVU0 165 aa24.23■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 ORAI3Q9BRQ5 295 aa24.23■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa24.23■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa24.22■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 DFNA5O60443 496 aa24.22■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 SNAP91O60641 907 aa24.22■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 DRD3P35462 400 aa24.22■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 MAPKAPK2P49137 400 aa24.22■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 AIF1P55008 147 aa24.22■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 BNC1Q01954 994 aa24.22■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 GNA12Q03113 381 aa24.22■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 SCAPQ12770 1279 aa24.22■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 IQCB1Q15051 598 aa24.22■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 MANEALQ5VSG8 457 aa24.22■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 TMIEQ8NEW7 156 aa24.22■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 SYT11Q9BT88 431 aa24.22■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 SPON2Q9BUD6 331 aa24.22■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 CEP44Q9C0F1 390 aa24.22■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 AIPL1Q9NZN9 384 aa24.22■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 CHD8Q9HCK8 2581 aa24.21■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 VILLO15195 856 aa24.21■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 KIF19Q2TAC6 998 aa24.21■■□□□ 1.47
CTDSP1-211ENST00000492545 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.6 ms