RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490051.1

GRB10-222, Transcript of growth factor receptor bound protein 10, human

TSL 4

Gene GRB10, Length 578 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GRB10-222	ENST00000490051	ALF	Q53S48	1182 aa		13.11	□□□□□ -0.31
GRB10-222	ENST00000490051	HES3	Q5TGS1	186 aa		13.11	□□□□□ -0.31
GRB10-222	ENST00000490051	GBP6	Q6ZN66	633 aa		13.11	□□□□□ -0.31
GRB10-222	ENST00000490051	ENOSF1	Q7L5Y1	443 aa		13.11	□□□□□ -0.31
GRB10-222	ENST00000490051	SLC47A2	Q86VL8	602 aa		13.11	□□□□□ -0.31
GRB10-222	ENST00000490051	SHC3	Q92529	594 aa		13.11	□□□□□ -0.31
GRB10-222	ENST00000490051	SKA1	Q96BD8	255 aa		13.11	□□□□□ -0.31
GRB10-222	ENST00000490051	BBC3	Q96PG8	261 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
GRB10-222	ENST00000490051	SIX2	Q9NPC8	291 aa		13.11	□□□□□ -0.31
GRB10-222	ENST00000490051	PIGV	Q9NUD9	493 aa		13.11	□□□□□ -0.31
GRB10-222	ENST00000490051	ARHGAP20	Q9P2F6	1191 aa		13.11	□□□□□ -0.31
GRB10-222	ENST00000490051	SLC12A6	Q9UHW9	1150 aa		13.11	□□□□□ -0.31
GRB10-222	ENST00000490051	ZNF559-ZNF177	A0A0A6YYI6	481 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
GRB10-222	ENST00000490051		I6L893	689 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
GRB10-222	ENST00000490051		K7ERQ8	282 aa		13.1	□□□□□ -0.31
GRB10-222	ENST00000490051	LAT	O43561	262 aa		13.1	□□□□□ -0.31
GRB10-222	ENST00000490051	DFNA5	O60443	496 aa		13.1	□□□□□ -0.31
GRB10-222	ENST00000490051	ADCY5	O95622	1261 aa		13.1	□□□□□ -0.31
GRB10-222	ENST00000490051	MT-CO1	P00395	513 aa		13.1	□□□□□ -0.31
GRB10-222	ENST00000490051	CTSL	P07711	333 aa		13.1	□□□□□ -0.31
GRB10-222	ENST00000490051	GLDC	P23378	1020 aa		13.1	□□□□□ -0.31
GRB10-222	ENST00000490051	RRM1	P23921	792 aa		13.1	□□□□□ -0.31
GRB10-222	ENST00000490051	PON1	P27169	355 aa		13.1	□□□□□ -0.31
GRB10-222	ENST00000490051	MTIF2	P46199	727 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
GRB10-222	ENST00000490051	ARRB1	P49407	418 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
GRB10-222	ENST00000490051	SULT1E1	P49888	294 aa		13.1	□□□□□ -0.31
GRB10-222	ENST00000490051	RNASE9	P60153	205 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
GRB10-222	ENST00000490051	SULT2A1	Q06520	285 aa		13.1	□□□□□ -0.31
GRB10-222	ENST00000490051	ZNF177	Q13360	481 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
GRB10-222	ENST00000490051	SLC12A1	Q13621	1099 aa		13.1	□□□□□ -0.31
GRB10-222	ENST00000490051	ACAP1	Q15027	740 aa		13.1	□□□□□ -0.31
GRB10-222	ENST00000490051	SOWAHC	Q53LP3	525 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
GRB10-222	ENST00000490051	C2CD6	Q53TS8	623 aa		13.1	□□□□□ -0.31
GRB10-222	ENST00000490051	SLC45A4	Q5BKX6	768 aa		13.1	□□□□□ -0.31
GRB10-222	ENST00000490051	EFHC1	Q5JVL4	640 aa		13.1	□□□□□ -0.31
GRB10-222	ENST00000490051	LINGO4	Q6UY18	593 aa		13.1	□□□□□ -0.31
GRB10-222	ENST00000490051	C11orf57	Q6ZUT1	292 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
GRB10-222	ENST00000490051	TFAP2D	Q7Z6R9	452 aa		13.1	□□□□□ -0.31
GRB10-222	ENST00000490051	PRPF39	Q86UA1	669 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
GRB10-222	ENST00000490051	SH2D3C	Q8N5H7	860 aa		13.1	□□□□□ -0.31
GRB10-222	ENST00000490051	GRIN3A	Q8TCU5	1115 aa		13.1	□□□□□ -0.31
GRB10-222	ENST00000490051	FEM1A	Q9BSK4	669 aa		13.1	□□□□□ -0.31
GRB10-222	ENST00000490051	RWDD2A	Q9UIY3	292 aa		13.1	□□□□□ -0.31
GRB10-222	ENST00000490051	C1QTNF3-AMACR	E9PGA6	284 aa		13.09	□□□□□ -0.31
GRB10-222	ENST00000490051	KPNA3	O00505	521 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
GRB10-222	ENST00000490051	ATP9B	O43861	1147 aa		13.09	□□□□□ -0.31
GRB10-222	ENST00000490051	ENDOD1	O94919	500 aa		13.09	□□□□□ -0.31
GRB10-222	ENST00000490051	FGFR1OP	O95684	399 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
GRB10-222	ENST00000490051	RHOC	P08134	193 aa		13.09	□□□□□ -0.31
GRB10-222	ENST00000490051	SLC2A3	P11169	496 aa		13.09	□□□□□ -0.31
GRB10-222	ENST00000490051	SRC	P12931	536 aa		13.09	□□□□□ -0.31
GRB10-222	ENST00000490051	JUP	P14923	745 aa		13.09	□□□□□ -0.31
GRB10-222	ENST00000490051	CLCN1	P35523	988 aa		13.09	□□□□□ -0.31
GRB10-222	ENST00000490051	HNF1B	P35680	557 aa		13.09	□□□□□ -0.31
GRB10-222	ENST00000490051	PLK1	P53350	603 aa		13.09	□□□□□ -0.31
GRB10-222	ENST00000490051	TAS2R38	P59533	333 aa		13.09	□□□□□ -0.31
GRB10-222	ENST00000490051	SLC6A3	Q01959	620 aa		13.09	□□□□□ -0.31
GRB10-222	ENST00000490051	SEMG2	Q02383	582 aa		13.09	□□□□□ -0.31
GRB10-222	ENST00000490051	PIP5KL1	Q5T9C9	394 aa		13.09	□□□□□ -0.31
GRB10-222	ENST00000490051	SFMBT2	Q5VUG0	894 aa		13.09	□□□□□ -0.31
GRB10-222	ENST00000490051	TAF3	Q5VWG9	929 aa		13.09	□□□□□ -0.31
GRB10-222	ENST00000490051	SLC26A9	Q7LBE3	791 aa		13.09	□□□□□ -0.31
GRB10-222	ENST00000490051	DSG4	Q86SJ6	1040 aa		13.09	□□□□□ -0.31
GRB10-222	ENST00000490051	IRF2BP1	Q8IU81	584 aa		13.09	□□□□□ -0.31
GRB10-222	ENST00000490051	PDCD7	Q8N8D1	485 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
GRB10-222	ENST00000490051	ARRDC3	Q96B67	414 aa		13.09	□□□□□ -0.31
GRB10-222	ENST00000490051	NOX5	Q96PH1	765 aa		13.09	□□□□□ -0.31
GRB10-222	ENST00000490051	PSMB7	Q99436	277 aa		13.09	□□□□□ -0.31
GRB10-222	ENST00000490051	TKTL2	Q9H0I9	626 aa		13.09	□□□□□ -0.31
GRB10-222	ENST00000490051	TNKS2	Q9H2K2	1166 aa		13.09	□□□□□ -0.31
GRB10-222	ENST00000490051	ASNSD1	Q9NWL6	643 aa		13.09	□□□□□ -0.31
GRB10-222	ENST00000490051	MPP6	Q9NZW5	540 aa		13.09	□□□□□ -0.31
GRB10-222	ENST00000490051	VPS51	Q9UID3	782 aa		13.09	□□□□□ -0.31
GRB10-222	ENST00000490051	DNAJC12	Q9UKB3	198 aa		13.09	□□□□□ -0.31
GRB10-222	ENST00000490051	PCDHGC3	Q9UN70	934 aa		13.09	□□□□□ -0.31
GRB10-222	ENST00000490051	OR51B4	Q9Y5P0	310 aa		13.09	□□□□□ -0.31
GRB10-222	ENST00000490051	HELZ2	Q9BYK8	2649 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
GRB10-222	ENST00000490051	SLC31A1	O15431	190 aa		13.08	□□□□□ -0.32
GRB10-222	ENST00000490051	FFAR2	O15552	330 aa		13.08	□□□□□ -0.32
GRB10-222	ENST00000490051	SMAD6	O43541	496 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
GRB10-222	ENST00000490051	TLX3	O43711	291 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
GRB10-222	ENST00000490051	RNGTT	O60942	597 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
GRB10-222	ENST00000490051	GLI1	P08151	1106 aa		13.08	□□□□□ -0.32
GRB10-222	ENST00000490051	ITPKB	P27987	946 aa		13.08	□□□□□ -0.32
GRB10-222	ENST00000490051	NOS2	P35228	1153 aa		13.08	□□□□□ -0.32
GRB10-222	ENST00000490051	KRT9	P35527	623 aa		13.08	□□□□□ -0.32
GRB10-222	ENST00000490051	PTK2	Q05397	1052 aa		13.08	□□□□□ -0.32
GRB10-222	ENST00000490051	TARDBP	Q13148	414 aa	Known RBP eCLIP	13.08	□□□□□ -0.32
GRB10-222	ENST00000490051	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		13.08	□□□□□ -0.32
GRB10-222	ENST00000490051	STAT4	Q14765	748 aa		13.08	□□□□□ -0.32
GRB10-222	ENST00000490051	SETMAR	Q53H47	684 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
GRB10-222	ENST00000490051	FAM102A	Q5T9C2	384 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
GRB10-222	ENST00000490051	FAM46C	Q5VWP2	391 aa		13.08	□□□□□ -0.32
GRB10-222	ENST00000490051	KANSL1	Q7Z3B3	1105 aa		13.08	□□□□□ -0.32
GRB10-222	ENST00000490051	TMPRSS12	Q86WS5	348 aa		13.08	□□□□□ -0.32
GRB10-222	ENST00000490051	MFSD2A	Q8NA29	543 aa		13.08	□□□□□ -0.32
GRB10-222	ENST00000490051	ATP11C	Q8NB49	1132 aa		13.08	□□□□□ -0.32
GRB10-222	ENST00000490051	CHST14	Q8NCH0	376 aa		13.08	□□□□□ -0.32
GRB10-222	ENST00000490051	OR7D4	Q8NG98	312 aa		13.08	□□□□□ -0.32
GRB10-222	ENST00000490051	FAM131C	Q96AQ9	280 aa		13.08	□□□□□ -0.32

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