RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484528.1

USP40-215, Transcript of ubiquitin specific peptidase 40, humanhuman

TSL 2

Gene USP40, Length 933 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP40-215ENST00000484528 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
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USP40-215ENST00000484528 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa22.14■■□□□ 1.13
USP40-215ENST00000484528 C10orf142B7Z368 130 aa22.13■■□□□ 1.13
USP40-215ENST00000484528 PCDHGA12O60330 932 aa22.13■■□□□ 1.13
USP40-215ENST00000484528 CD38P28907 300 aa22.13■■□□□ 1.13
USP40-215ENST00000484528 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
USP40-215ENST00000484528 GABRB2P47870 512 aa22.13■■□□□ 1.13
USP40-215ENST00000484528 SCAPQ12770 1279 aa22.13■■□□□ 1.13
USP40-215ENST00000484528 C5orf22Q49AR2 442 aa22.13■■□□□ 1.13
USP40-215ENST00000484528 BRMS1LQ5PSV4 323 aa22.13■■□□□ 1.13
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USP40-215ENST00000484528 TRNP1Q6NT89 227 aa22.13■■□□□ 1.13
USP40-215ENST00000484528 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa22.13■■□□□ 1.13
USP40-215ENST00000484528 DSG4Q86SJ6 1040 aa22.13■■□□□ 1.13
USP40-215ENST00000484528 MARCH9Q86YJ5 346 aa22.13■■□□□ 1.13
USP40-215ENST00000484528 SH2D3CQ8N5H7 860 aa22.13■■□□□ 1.13
USP40-215ENST00000484528 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa22.13■■□□□ 1.13
USP40-215ENST00000484528 CPA5Q8WXQ8 436 aa22.13■■□□□ 1.13
USP40-215ENST00000484528 MPP6Q9NZW5 540 aa22.13■■□□□ 1.13
USP40-215ENST00000484528 FREM2Q5SZK8 3169 aa22.13■■□□□ 1.13
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USP40-215ENST00000484528 A0A1W2PR77 199 aa22.12■■□□□ 1.13
USP40-215ENST00000484528 F8VZ95 297 aa22.12■■□□□ 1.13
USP40-215ENST00000484528 MT-CO1P00395 513 aa22.12■■□□□ 1.13
USP40-215ENST00000484528 MMEP08473 750 aa22.12■■□□□ 1.13
USP40-215ENST00000484528 SRCP12931 536 aa22.12■■□□□ 1.13
USP40-215ENST00000484528 ZNF18P17022 549 aa22.12■■□□□ 1.13
USP40-215ENST00000484528 KLK7P49862 253 aa22.12■■□□□ 1.13
USP40-215ENST00000484528 CNTN1Q12860 1018 aa22.12■■□□□ 1.13
USP40-215ENST00000484528 ZNF683Q8IZ20 524 aa22.12■■□□□ 1.13
USP40-215ENST00000484528 EPS8L1Q8TE68 723 aa22.12■■□□□ 1.13
USP40-215ENST00000484528 SLC20A1Q8WUM9 679 aa22.12■■□□□ 1.13
USP40-215ENST00000484528 NT5C3BQ969T7 300 aa22.12■■□□□ 1.13
USP40-215ENST00000484528 PSMB7Q99436 277 aa22.12■■□□□ 1.13
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USP40-215ENST00000484528 VPS51Q9UID3 782 aa22.12■■□□□ 1.13
USP40-215ENST00000484528 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
USP40-215ENST00000484528 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa22.11■■□□□ 1.13
USP40-215ENST00000484528 K7ERQ8 282 aa22.11■■□□□ 1.13
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USP40-215ENST00000484528 NOMO3P69849 1222 aa22.11■■□□□ 1.13
USP40-215ENST00000484528 SLC25A52Q3SY17 297 aa22.11■■□□□ 1.13
USP40-215ENST00000484528 AGBL4Q5VU57 503 aa22.11■■□□□ 1.13
USP40-215ENST00000484528 FAM46CQ5VWP2 391 aa22.11■■□□□ 1.13
USP40-215ENST00000484528 LINGO4Q6UY18 593 aa22.11■■□□□ 1.13
USP40-215ENST00000484528 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
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USP40-215ENST00000484528 SKA1Q96BD8 255 aa22.11■■□□□ 1.13
USP40-215ENST00000484528 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
USP40-215ENST00000484528 CFAP57Q96MR6 1250 aa22.11■■□□□ 1.13
USP40-215ENST00000484528 PPM1HQ9ULR3 514 aa22.11■■□□□ 1.13
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USP40-215ENST00000484528 FAM131BQ86XD5 332 aa22.1■■□□□ 1.13
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USP40-215ENST00000484528 KRT83P78385 493 aa22.09■■□□□ 1.13
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USP40-215ENST00000484528 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
USP40-215ENST00000484528 MSANTD4Q8NCY6 345 aa22.09■■□□□ 1.13
USP40-215ENST00000484528 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
USP40-215ENST00000484528 LMBRD1Q9NUN5 540 aa22.09■■□□□ 1.13
USP40-215ENST00000484528 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa22.09■■□□□ 1.13
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