RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 GPD1P21695 349 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 MARK3P27448 753 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 LONP1P36776 959 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 GNALP38405 381 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 NDUFV1P49821 464 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 PPP2R5CQ13362 524 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 NEDD9Q14511 834 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 PDIA5Q14554 519 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 ARHGEF6Q15052 776 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 PTPRRQ15256 657 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 UGCGQ16739 394 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 LONRF3Q496Y0 759 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 DUSP28Q4G0W2 176 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 COLEC12Q5KU26 742 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 RRAGBQ5VZM2 374 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 KRT79Q5XKE5 535 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 B3GNT9Q6UX72 402 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 CATSPER3Q86XQ3 398 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 PSD4Q8NDX1 1056 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 PIGOQ8TEQ8 1089 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 ZBTB10Q96DT7 871 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 CDHR1Q96JP9 859 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 PCYT2Q99447 389 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 TPSD1Q9BZJ3 242 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 SIK2Q9H0K1 926 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 DACT1Q9NYF0 836 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 NFASCO94856 1347 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 LINC00473A8K010 186 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 SLC16A6O15403 523 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 TRIAP1O43715 76 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 CAND2O75155 1236 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 VPS4BO75351 444 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 PROP1O75360 226 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 IL33O95760 270 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 TGFB3P10600 412 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 RARBP10826 455 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 AKR1A1P14550 325 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 STAT6P42226 847 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 SYKP43405 635 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 NXPH1P58417 271 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 MLC1Q15049 377 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 FAM153CQ494X1 144 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 PLA2G4FQ68DD2 849 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 ISM2Q6H9L7 571 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 METTL7BQ6UX53 244 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 MAEAQ7L5Y9 396 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 TLK2Q86UE8 772 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 TCEAL8Q8IYN2 117 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 ENGASEQ8NFI3 743 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 ERMNQ8TAM6 284 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 POC1BQ8TC44 478 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 SEPT1Q8WYJ6 367 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 GLG1Q92896 1179 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 CALML4Q96GE6 196 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 AK8Q96MA6 479 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 HSD17B14Q9BPX1 270 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 SENP7Q9BQF6 1050 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 LXNQ9BS40 222 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 RAB34Q9BZG1 259 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 CCSER1Q9C0I3 900 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 BLZF1Q9H2G9 400 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 WDCPQ9H6R7 721 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF302Q9NR11 478 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 HPSEQ9Y251 543 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 CENPFP49454 3210 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 WDR81Q562E7 1941 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 GOLGA6CA6NDK9 693 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 GOLGA6BA6NDN3 693 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 M0QYG6 137 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 CTAGE5O15320 804 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 SEPT4O43236 478 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 KINO60870 393 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 RFPL1O75677 317 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 URI1O94763 535 aaPredicted RBP5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 ABLIM3O94929 683 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 STBD1O95210 358 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 LGALS2P05162 132 aa5.17□□□□□ -1.58
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