RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475302.1

ITGA6-210, Transcript of integrin subunit alpha 6, humanhuman

TSL 3

Gene ITGA6, Length 577 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6-210ENST00000475302 FAXCQ5TGI0 409 aa9.9□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa9.9□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 CENPUQ71F23 418 aa9.9□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 MIB1Q86YT6 1006 aa9.9□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 TMC8Q8IU68 726 aa9.9□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 RNF135Q8IUD6 432 aa9.9□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 C7orf61Q8IZ16 206 aa9.9□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa9.9□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa9.9□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 MAML1Q92585 1016 aa9.9□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 IRF7Q92985 503 aa9.9□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 RNF34Q969K3 372 aa9.9□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 EXOC4Q96A65 974 aa9.9□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 TEKT5Q96M29 485 aa9.9□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 VAT1Q99536 393 aa9.9□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 IL12RB2Q99665 862 aa9.9□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 DHRS4Q9BTZ2 278 aa9.9□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa9.9□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 MPP6Q9NZW5 540 aa9.9□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 LGALS13Q9UHV8 139 aa9.9□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 ADAM21Q9UKJ8 722 aa9.9□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa9.9□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 DOCK4Q8N1I0 1966 aa9.9□□□□□ -0.83
ITGA6-210ENST00000475302 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa9.9□□□□□ -0.83
ITGA6-210ENST00000475302 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa9.89□□□□□ -0.83
ITGA6-210ENST00000475302 C2orf78A6NCI8 922 aa9.89□□□□□ -0.83
ITGA6-210ENST00000475302 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
ITGA6-210ENST00000475302 E7EVH7 732 aa9.89□□□□□ -0.83
ITGA6-210ENST00000475302 GOLGA8MH3BSY2 632 aa9.89□□□□□ -0.83
ITGA6-210ENST00000475302 KCNK1O00180 336 aa9.89□□□□□ -0.83
ITGA6-210ENST00000475302 MTSS1O43312 755 aa9.89□□□□□ -0.83
ITGA6-210ENST00000475302 WIPF1O43516 503 aa9.89□□□□□ -0.83
ITGA6-210ENST00000475302 ACSL4O60488 711 aa9.89□□□□□ -0.83
ITGA6-210ENST00000475302 AVILO75366 819 aa9.89□□□□□ -0.83
ITGA6-210ENST00000475302 STC2O76061 302 aa9.89□□□□□ -0.83
ITGA6-210ENST00000475302 CNTN5O94779 1100 aa9.89□□□□□ -0.83
ITGA6-210ENST00000475302 SUN1O94901 812 aa9.89□□□□□ -0.83
ITGA6-210ENST00000475302 ACSL3O95573 720 aa9.89□□□□□ -0.83
ITGA6-210ENST00000475302 CXCL14O95715 111 aa9.89□□□□□ -0.83
ITGA6-210ENST00000475302 APOEP02649 317 aa9.89□□□□□ -0.83
ITGA6-210ENST00000475302 MYZAPP0CAP1 466 aa9.89□□□□□ -0.83
ITGA6-210ENST00000475302 MLNP12872 115 aa9.89□□□□□ -0.83
ITGA6-210ENST00000475302 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
ITGA6-210ENST00000475302 GRIA1P42261 906 aa9.89□□□□□ -0.83
ITGA6-210ENST00000475302 ALDH1A3P47895 512 aa9.89□□□□□ -0.83
ITGA6-210ENST00000475302 IFNAR2P48551 515 aa9.89□□□□□ -0.83
ITGA6-210ENST00000475302 NDST2P52849 883 aa9.89□□□□□ -0.83
ITGA6-210ENST00000475302 BASP1P80723 227 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
ITGA6-210ENST00000475302 ZXDBP98169 803 aa9.89□□□□□ -0.83
ITGA6-210ENST00000475302 CDK16Q00536 496 aa9.89□□□□□ -0.83
ITGA6-210ENST00000475302 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
ITGA6-210ENST00000475302 AP1B1Q10567 949 aa9.89□□□□□ -0.83
ITGA6-210ENST00000475302 STAT4Q14765 748 aa9.89□□□□□ -0.83
ITGA6-210ENST00000475302 TERF2Q15554 542 aa9.89□□□□□ -0.83
ITGA6-210ENST00000475302 NUGGCQ68CJ6 796 aa9.89□□□□□ -0.83
ITGA6-210ENST00000475302 CYP2U1Q7Z449 544 aa9.89□□□□□ -0.83
ITGA6-210ENST00000475302 SPRED2Q7Z698 418 aa9.89□□□□□ -0.83
ITGA6-210ENST00000475302 CROCCP2Q86T23 111 aa9.89□□□□□ -0.83
ITGA6-210ENST00000475302 TDRPQ86YL5 185 aa9.89□□□□□ -0.83
ITGA6-210ENST00000475302 LRRC49Q8IUZ0 686 aa9.89□□□□□ -0.83
ITGA6-210ENST00000475302 SH2D3CQ8N5H7 860 aa9.89□□□□□ -0.83
ITGA6-210ENST00000475302 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa9.89□□□□□ -0.83
ITGA6-210ENST00000475302 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
ITGA6-210ENST00000475302 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
ITGA6-210ENST00000475302 TTC25Q96NG3 672 aa9.89□□□□□ -0.83
ITGA6-210ENST00000475302 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
ITGA6-210ENST00000475302 ZYG11BQ9C0D3 744 aa9.89□□□□□ -0.83
ITGA6-210ENST00000475302 RETREG1Q9H6L5 497 aa9.89□□□□□ -0.83
ITGA6-210ENST00000475302 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa9.89□□□□□ -0.83
ITGA6-210ENST00000475302 VPS18Q9P253 973 aa9.89□□□□□ -0.83
ITGA6-210ENST00000475302 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa9.89□□□□□ -0.83
ITGA6-210ENST00000475302 FETUBQ9UGM5 382 aa9.89□□□□□ -0.83
ITGA6-210ENST00000475302 TRHDEQ9UKU6 1024 aa9.89□□□□□ -0.83
ITGA6-210ENST00000475302 VANGL2Q9ULK5 521 aa9.89□□□□□ -0.83
ITGA6-210ENST00000475302 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
ITGA6-210ENST00000475302 ASB3Q9Y575 518 aa9.89□□□□□ -0.83
ITGA6-210ENST00000475302 OBSL1O75147 1896 aa9.89□□□□□ -0.83
ITGA6-210ENST00000475302 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
ITGA6-210ENST00000475302 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
ITGA6-210ENST00000475302 GOLGA6CA6NDK9 693 aa9.88□□□□□ -0.83
ITGA6-210ENST00000475302 HIDE1A8MVS5 230 aa9.88□□□□□ -0.83
ITGA6-210ENST00000475302 RASGRF2O14827 1237 aa9.88□□□□□ -0.83
ITGA6-210ENST00000475302 MATN3O15232 486 aa9.88□□□□□ -0.83
ITGA6-210ENST00000475302 PAPLNO95428 1278 aa9.88□□□□□ -0.83
ITGA6-210ENST00000475302 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
ITGA6-210ENST00000475302 SPATA31D3P0C874 917 aa9.88□□□□□ -0.83
ITGA6-210ENST00000475302 GOLGA6DP0CG33 693 aa9.88□□□□□ -0.83
ITGA6-210ENST00000475302 SYN1P17600 705 aa9.88□□□□□ -0.83
ITGA6-210ENST00000475302 TACR2P21452 398 aa9.88□□□□□ -0.83
ITGA6-210ENST00000475302 ELK3P41970 407 aa9.88□□□□□ -0.83
ITGA6-210ENST00000475302 MMP13P45452 471 aa9.88□□□□□ -0.83
ITGA6-210ENST00000475302 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
ITGA6-210ENST00000475302 EPHB3P54753 998 aa9.88□□□□□ -0.83
ITGA6-210ENST00000475302 EPHA5P54756 1037 aa9.88□□□□□ -0.83
ITGA6-210ENST00000475302 COG7P83436 770 aa9.88□□□□□ -0.83
ITGA6-210ENST00000475302 UBE3AQ05086 875 aa9.88□□□□□ -0.83
ITGA6-210ENST00000475302 PLD1Q13393 1074 aa9.88□□□□□ -0.83
ITGA6-210ENST00000475302 KRT71Q3SY84 523 aa9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.7 ms