RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472326.2

SGCE-210, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 2

Gene SGCE, Length 453 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-210ENST00000472326 RPS6KA3P51812 740 aa7.39□□□□□ -1.23
SGCE-210ENST00000472326 TMPRSS3P57727 454 aa7.39□□□□□ -1.23
SGCE-210ENST00000472326 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
SGCE-210ENST00000472326 C5orf22Q49AR2 442 aa7.39□□□□□ -1.23
SGCE-210ENST00000472326 ANKRD45Q5TZF3 282 aa7.39□□□□□ -1.23
SGCE-210ENST00000472326 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa7.39□□□□□ -1.23
SGCE-210ENST00000472326 GALNT7Q86SF2 657 aa7.39□□□□□ -1.23
SGCE-210ENST00000472326 TMEM57Q8N5G2 664 aa7.39□□□□□ -1.23
SGCE-210ENST00000472326 ANKRD42Q8N9B4 389 aa7.39□□□□□ -1.23
SGCE-210ENST00000472326 LRRC57Q8N9N7 239 aa7.39□□□□□ -1.23
SGCE-210ENST00000472326 SPPL3Q8TCT6 385 aa7.39□□□□□ -1.23
SGCE-210ENST00000472326 ASB5Q8WWX0 329 aa7.39□□□□□ -1.23
SGCE-210ENST00000472326 HERPUD2Q9BSE4 406 aa7.39□□□□□ -1.23
SGCE-210ENST00000472326 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
SGCE-210ENST00000472326 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
SGCE-210ENST00000472326 TBC1D14Q9P2M4 693 aa7.39□□□□□ -1.23
SGCE-210ENST00000472326 UPB1Q9UBR1 384 aa7.39□□□□□ -1.23
SGCE-210ENST00000472326 A0A0A0MQY5 61 aa7.38□□□□□ -1.23
SGCE-210ENST00000472326 C17orf100A8MU93 164 aa7.38□□□□□ -1.23
SGCE-210ENST00000472326 MDM4O15151 490 aa7.38□□□□□ -1.23
SGCE-210ENST00000472326 IRAK2O43187 625 aa7.38□□□□□ -1.23
SGCE-210ENST00000472326 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
SGCE-210ENST00000472326 POLD2P49005 469 aa7.38□□□□□ -1.23
SGCE-210ENST00000472326 MCM2P49736 904 aa7.38□□□□□ -1.23
SGCE-210ENST00000472326 AP5B1Q2VPB7 878 aa7.38□□□□□ -1.23
SGCE-210ENST00000472326 IGFN1Q86VF2 1251 aa7.38□□□□□ -1.23
SGCE-210ENST00000472326 C2CD5Q86YS7 1000 aa7.38□□□□□ -1.23
SGCE-210ENST00000472326 NSMCE1Q8WV22 266 aa7.38□□□□□ -1.23
SGCE-210ENST00000472326 LPAR1Q92633 364 aa7.38□□□□□ -1.23
SGCE-210ENST00000472326 CAMK1GQ96NX5 476 aa7.38□□□□□ -1.23
SGCE-210ENST00000472326 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
SGCE-210ENST00000472326 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
SGCE-210ENST00000472326 IFNA2P01563 188 aa7.37□□□□□ -1.23
SGCE-210ENST00000472326 HLA-DQA2P01906 255 aa7.37□□□□□ -1.23
SGCE-210ENST00000472326 HOXB2P14652 356 aa7.37□□□□□ -1.23
SGCE-210ENST00000472326 P2RX3P56373 397 aa7.37□□□□□ -1.23
SGCE-210ENST00000472326 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa7.37□□□□□ -1.23
SGCE-210ENST00000472326 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa7.37□□□□□ -1.23
SGCE-210ENST00000472326 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
SGCE-210ENST00000472326 HERC6Q8IVU3 1022 aa7.37□□□□□ -1.23
SGCE-210ENST00000472326 FAM217AQ8IXS0 508 aa7.37□□□□□ -1.23
SGCE-210ENST00000472326 PELI3Q8N2H9 469 aa7.37□□□□□ -1.23
SGCE-210ENST00000472326 DPP10Q8N608 796 aa7.37□□□□□ -1.23
SGCE-210ENST00000472326 SCAIQ8N9R8 606 aa7.37□□□□□ -1.23
SGCE-210ENST00000472326 CTDSP1Q9GZU7 261 aa7.37□□□□□ -1.23
SGCE-210ENST00000472326 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP7.37□□□□□ -1.23
SGCE-210ENST00000472326 TASP1Q9H6P5 420 aa7.37□□□□□ -1.23
SGCE-210ENST00000472326 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa7.37□□□□□ -1.23
SGCE-210ENST00000472326 GPR52Q9Y2T5 361 aa7.37□□□□□ -1.23
SGCE-210ENST00000472326 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
SGCE-210ENST00000472326 TNFSF8P32971 234 aa7.36□□□□□ -1.23
SGCE-210ENST00000472326 MVDP53602 400 aa7.36□□□□□ -1.23
SGCE-210ENST00000472326 ARL4CP56559 192 aa7.36□□□□□ -1.23
SGCE-210ENST00000472326 ARHGAP8P85298 464 aa7.36□□□□□ -1.23
SGCE-210ENST00000472326 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa7.36□□□□□ -1.23
SGCE-210ENST00000472326 ZNF549Q6P9A3 640 aa7.36□□□□□ -1.23
SGCE-210ENST00000472326 COG8Q96MW5 612 aa7.36□□□□□ -1.23
SGCE-210ENST00000472326 IFT27Q9BW83 186 aa7.36□□□□□ -1.23
SGCE-210ENST00000472326 EBF3Q9H4W6 596 aa7.36□□□□□ -1.23
SGCE-210ENST00000472326 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
SGCE-210ENST00000472326 CDH22Q9UJ99 828 aa7.36□□□□□ -1.23
SGCE-210ENST00000472326 RAP2CQ9Y3L5 183 aa7.36□□□□□ -1.23
SGCE-210ENST00000472326 FAM90A10PA6NDY2 464 aa7.35□□□□□ -1.23
SGCE-210ENST00000472326 FHL1Q13642 323 aa7.35□□□□□ -1.23
SGCE-210ENST00000472326 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
SGCE-210ENST00000472326 WASHC2DQ5SRD0 308 aa7.35□□□□□ -1.23
SGCE-210ENST00000472326 KDM1BQ8NB78 822 aa7.35□□□□□ -1.23
SGCE-210ENST00000472326 ISCA1Q9BUE6 129 aa7.35□□□□□ -1.23
SGCE-210ENST00000472326 B3GNT4Q9C0J1 378 aa7.35□□□□□ -1.23
SGCE-210ENST00000472326 ISCUQ9H1K1 167 aa7.35□□□□□ -1.23
SGCE-210ENST00000472326 RNF146Q9NTX7 359 aa7.35□□□□□ -1.23
SGCE-210ENST00000472326 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa7.35□□□□□ -1.23
SGCE-210ENST00000472326 ICKQ9UPZ9 632 aa7.35□□□□□ -1.23
SGCE-210ENST00000472326 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa7.35□□□□□ -1.23
SGCE-210ENST00000472326 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
SGCE-210ENST00000472326 TMCC1O94876 653 aa7.34□□□□□ -1.23
SGCE-210ENST00000472326 CBX6O95503 412 aa7.34□□□□□ -1.23
SGCE-210ENST00000472326 METTL18O95568 372 aa7.34□□□□□ -1.23
SGCE-210ENST00000472326 DDAH2O95865 285 aa7.34□□□□□ -1.23
SGCE-210ENST00000472326 CPA1P15085 419 aa7.34□□□□□ -1.23
SGCE-210ENST00000472326 CD72P21854 359 aa7.34□□□□□ -1.23
SGCE-210ENST00000472326 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
SGCE-210ENST00000472326 PKP1Q13835 747 aa7.34□□□□□ -1.23
SGCE-210ENST00000472326 IL13RA2Q14627 380 aa7.34□□□□□ -1.23
SGCE-210ENST00000472326 CTXN3Q4LDR2 81 aa7.34□□□□□ -1.23
SGCE-210ENST00000472326 SYTL3Q4VX76 610 aa7.34□□□□□ -1.23
SGCE-210ENST00000472326 CBWD5Q5RIA9 395 aa7.34□□□□□ -1.23
SGCE-210ENST00000472326 SH2D4BQ5SQS7 431 aa7.34□□□□□ -1.23
SGCE-210ENST00000472326 PARM1Q6UWI2 310 aa7.34□□□□□ -1.23
SGCE-210ENST00000472326 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa7.34□□□□□ -1.23
SGCE-210ENST00000472326 ANKRD44Q8N8A2 993 aa7.34□□□□□ -1.23
SGCE-210ENST00000472326 C9orf106Q8NAJ2 232 aa7.34□□□□□ -1.23
SGCE-210ENST00000472326 FAR1Q8WVX9 515 aa7.34□□□□□ -1.23
SGCE-210ENST00000472326 TRIM63Q969Q1 353 aa7.34□□□□□ -1.23
SGCE-210ENST00000472326 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
SGCE-210ENST00000472326 FRG2BQ96QU4 278 aa7.34□□□□□ -1.23
SGCE-210ENST00000472326 WACQ9BTA9 647 aa7.34□□□□□ -1.23
SGCE-210ENST00000472326 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
SGCE-210ENST00000472326 HDAC6Q9UBN7 1215 aa7.34□□□□□ -1.23
SGCE-210ENST00000472326 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
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