RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467246.5

HPS1-208, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene HPS1, Length 2,791 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-208ENST00000467246 HS3ST4Q9Y661 456 aa11.66□□□□□ -0.54
HPS1-208ENST00000467246 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa11.65□□□□□ -0.54
HPS1-208ENST00000467246 ENO4A6NNW6 628 aa11.65□□□□□ -0.54
HPS1-208ENST00000467246 KCNU1A8MYU2 1149 aa11.65□□□□□ -0.54
HPS1-208ENST00000467246 BIRC5O15392 142 aa11.65□□□□□ -0.54
HPS1-208ENST00000467246 GLRA3O75311 464 aa11.65□□□□□ -0.54
HPS1-208ENST00000467246 SNNO75324 88 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
HPS1-208ENST00000467246 TADA2AO75478 443 aa11.65□□□□□ -0.54
HPS1-208ENST00000467246 NMBRP28336 390 aa11.65□□□□□ -0.54
HPS1-208ENST00000467246 HOXC13P31276 330 aa11.65□□□□□ -0.54
HPS1-208ENST00000467246 NPY2RP49146 381 aa11.65□□□□□ -0.54
HPS1-208ENST00000467246 COG7P83436 770 aa11.65□□□□□ -0.54
HPS1-208ENST00000467246 ZBTB16Q05516 673 aa11.65□□□□□ -0.54
HPS1-208ENST00000467246 PPP2R5DQ14738 602 aa11.65□□□□□ -0.54
HPS1-208ENST00000467246 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
HPS1-208ENST00000467246 GRTP1Q5TC63 336 aa11.65□□□□□ -0.54
HPS1-208ENST00000467246 URGCPQ8TCY9 931 aa11.65□□□□□ -0.54
HPS1-208ENST00000467246 HHIPL1Q96JK4 782 aa11.65□□□□□ -0.54
HPS1-208ENST00000467246 RBBP8Q99708 897 aa11.65□□□□□ -0.54
HPS1-208ENST00000467246 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
HPS1-208ENST00000467246 CAB39LQ9H9S4 337 aa11.65□□□□□ -0.54
HPS1-208ENST00000467246 SNX15Q9NRS6 342 aa11.65□□□□□ -0.54
HPS1-208ENST00000467246 ARL8BQ9NVJ2 186 aa11.65□□□□□ -0.54
HPS1-208ENST00000467246 TMEM216Q9P0N5 145 aa11.65□□□□□ -0.54
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HPS1-208ENST00000467246 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
HPS1-208ENST00000467246 A0A1W2PQY0 241 aa11.65□□□□□ -0.54
HPS1-208ENST00000467246 E9PAM4 449 aa11.65□□□□□ -0.54
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HPS1-208ENST00000467246 CACNG3O60359 315 aa11.65□□□□□ -0.54
HPS1-208ENST00000467246 PLIN3O60664 434 aa11.65□□□□□ -0.54
HPS1-208ENST00000467246 SOAT2O75908 522 aa11.65□□□□□ -0.54
HPS1-208ENST00000467246 CDH17Q12864 832 aa11.65□□□□□ -0.54
HPS1-208ENST00000467246 NOGQ13253 232 aa11.65□□□□□ -0.54
HPS1-208ENST00000467246 STX3Q13277 289 aa11.65□□□□□ -0.54
HPS1-208ENST00000467246 BIRC2Q13490 618 aa11.65□□□□□ -0.54
HPS1-208ENST00000467246 PRPSAP1Q14558 356 aa11.65□□□□□ -0.54
HPS1-208ENST00000467246 DLG2Q15700 870 aa11.65□□□□□ -0.54
HPS1-208ENST00000467246 FSTL4Q6MZW2 842 aa11.65□□□□□ -0.54
HPS1-208ENST00000467246 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
HPS1-208ENST00000467246 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
HPS1-208ENST00000467246 NUP93Q8N1F7 819 aa11.65□□□□□ -0.54
HPS1-208ENST00000467246 ACVR1CQ8NER5 493 aa11.65□□□□□ -0.54
HPS1-208ENST00000467246 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
HPS1-208ENST00000467246 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa11.65□□□□□ -0.54
HPS1-208ENST00000467246 IL22Q9GZX6 179 aa11.65□□□□□ -0.54
HPS1-208ENST00000467246 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa11.65□□□□□ -0.54
HPS1-208ENST00000467246 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
HPS1-208ENST00000467246 DCDC2Q9UHG0 476 aa11.65□□□□□ -0.54
HPS1-208ENST00000467246 MOXD2PA6NHM9 499 aa11.64□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa11.64□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 ITM2AO43736 263 aa11.64□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 TRPA1O75762 1119 aa11.64□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 HAUS5O94927 633 aa11.64□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 GATMP50440 423 aa11.64□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 ARPP19P56211 112 aa11.64□□□□□ -0.55
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HPS1-208ENST00000467246 MBLAC2Q68D91 279 aa11.64□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 LHX8Q68G74 356 aa11.64□□□□□ -0.55
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HPS1-208ENST00000467246 KCNMB4Q86W47 210 aa11.64□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
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HPS1-208ENST00000467246 ATP2A3Q93084 1043 aa11.64□□□□□ -0.55
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HPS1-208ENST00000467246 SAR1AQ9NR31 198 aa11.64□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 HCSTQ9UBK5 93 aa11.64□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 SOX13Q9UN79 622 aa11.64□□□□□ -0.55
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HPS1-208ENST00000467246 MAGEB16A2A368 324 aa11.64□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 MATN3O15232 486 aa11.64□□□□□ -0.55
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HPS1-208ENST00000467246 SPRP35270 261 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 LIMK2P53671 638 aa11.64□□□□□ -0.55
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HPS1-208ENST00000467246 CTXN3Q4LDR2 81 aa11.64□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 STXBP5Q5T5C0 1151 aa11.64□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 FAM171A1Q5VUB5 890 aa11.64□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 ATG14Q6ZNE5 492 aa11.64□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 KDELC2Q7Z4H8 507 aa11.64□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa11.64□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 SERPINB11Q96P15 392 aa11.64□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 IL12RB2Q99665 862 aa11.64□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 GPR62Q9BZJ7 368 aa11.64□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 NMUR2Q9GZQ4 415 aa11.64□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 GLOD4Q9HC38 313 aa11.64□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 GMIPQ9P107 970 aa11.64□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 ARMCX1Q9P291 453 aa11.64□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 PATJQ8NI35 1801 aa11.64□□□□□ -0.55
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