RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435535.1

RPS3AP54-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 54, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP54, Length 734 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP54-201ENST00000435535 LAD1O00515 517 aa4.79□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 INPPL1O15357 1258 aa4.79□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC26A4O43511 780 aa4.79□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 TBCAO75347 108 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 GLUD1P00367 558 aa4.79□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 AMY1AP04745 511 aa4.79□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 CXCL8P10145 99 aa4.79□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 GYPEP15421 78 aa4.79□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 TKTP29401 623 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 CRHR1P34998 444 aa4.79□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 DDIT3P35638 169 aa4.79□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 GNALP38405 381 aa4.79□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 PRPHP41219 470 aa4.79□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 CLCN4P51793 760 aa4.79□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 CLCNKBP51801 687 aa4.79□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 PER3P56645 1201 aa4.79□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 RAC3P60763 192 aa4.79□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 DUSP2Q05923 314 aa4.79□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 RESTQ13127 1097 aa4.79□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP4.79□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 RIN1Q13671 783 aa4.79□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 PSMD5Q16401 504 aa4.79□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa4.79□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM119Q4V9L6 283 aa4.79□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa4.79□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM171A1Q5VUB5 890 aa4.79□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 CES5AQ6NT32 575 aa4.79□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 RINT1Q6NUQ1 792 aa4.79□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 CNNM3Q8NE01 707 aa4.79□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 PPP1R35Q8TAP8 253 aa4.79□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 MDM1Q8TC05 714 aa4.79□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 CCHCR1Q8TD31 782 aa4.79□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa4.79□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 SNX27Q96L92 541 aa4.79□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 RIPOR3Q96MK2 946 aa4.79□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 KLHL5Q96PQ7 755 aa4.79□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 DPYSL5Q9BPU6 564 aa4.79□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 REEP2Q9BRK0 252 aa4.79□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM175Q9BSA9 504 aa4.79□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 MEGF9Q9H1U4 602 aa4.79□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 S1PR5Q9H228 398 aa4.79□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 IKZF4Q9H2S9 585 aa4.79□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 ADAM7Q9H2U9 754 aa4.79□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 LDAHQ9H6V9 325 aa4.79□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 CLIC4Q9Y696 253 aa4.79□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 DMXL1Q9Y485 3027 aa4.79□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa4.78□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 PIEZO1Q92508 2521 aa4.78□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 DNAH14Q0VDD8 3507 aa4.78□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 UBE2QL1A1L167 161 aa4.78□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 PMS2P1A4D2B8 440 aa4.78□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM221A6NGB7 291 aa4.78□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 A6NNZ2 444 aa4.78□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 K7ERI5 159 aa4.78□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 M0R296 226 aa4.78□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 ACKR2O00590 384 aa4.78□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 PODXLO00592 558 aa4.78□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 CCL16O15467 120 aa4.78□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 ADAM12O43184 909 aa4.78□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 SGTAO43765 313 aa4.78□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 NARSO43776 548 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 CDC14BO60729 498 aa4.78□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 TADA2AO75478 443 aa4.78□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 B3GAT3O94766 335 aa4.78□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 GASTP01350 101 aa4.78□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 ALDH2P05091 517 aa4.78□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 THP07101 528 aa4.78□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 PLA2G4BP0C869 781 aa4.78□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 ALADP13716 330 aa4.78□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 CR2P20023 1033 aa4.78□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 PLA2G5P39877 138 aa4.78□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 UBA7P41226 1012 aa4.78□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 TNFSF9P41273 254 aa4.78□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 MTHFRP42898 656 aa4.78□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 BRCC3P46736 316 aa4.78□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 MCM2P49736 904 aa4.78□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 LIG4P49917 911 aa4.78□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 EFNA5P52803 228 aa4.78□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC12A3P55017 1021 aa4.78□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 VCPP55072 806 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 ARPP19P56211 112 aa4.78□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 NTHL1P78549 312 aa4.78□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 DUSP8Q13202 625 aa4.78□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 GRM3Q14832 879 aa4.78□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 NAB2Q15742 525 aa4.78□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM187BQ17R55 369 aa4.78□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa4.78□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 LIN9Q5TKA1 542 aa4.78□□□□□ -1.64
RPS3AP54-201ENST00000435535 C1orf186Q6ZWK4 172 aa4.78□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.1 ms