RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa21.54■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 IQCHQ86VS3 1027 aa21.54■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 TRIM69Q86WT6 500 aa21.54■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 XYLT1Q86Y38 959 aa21.54■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 OXR1Q8N573 874 aa21.54■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 MSANTD4Q8NCY6 345 aa21.54■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 SERAC1Q96JX3 654 aa21.54■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 SIK2Q9H0K1 926 aa21.54■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 NUP62CLQ9H1M0 184 aa21.54■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 PDCL3Q9H2J4 239 aa21.54■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa21.54■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 PKD1L2Q7Z442 2459 aa21.53■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 FAM208BQ5VWN6 2430 aa21.53■■□□□ 1.04
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LIMS1-208ENST00000428064 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa21.53■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 TBC1D3EA0A087X179 549 aa21.53■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa21.53■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 TBC1D3LB9A6J9 549 aa21.53■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 TAF4O00268 1085 aa21.53■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 CNTN5O94779 1100 aa21.53■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 TBC1D3HP0C7X1 549 aa21.53■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 SRCP12931 536 aa21.53■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 NUMBP49757 651 aa21.53■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 METAP1P53582 386 aa21.53■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 NXPH1P58417 271 aa21.53■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 DEUP1Q05D60 604 aa21.53■■□□□ 1.04
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LIMS1-208ENST00000428064 SHBQ15464 509 aa21.53■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 ACCSLQ4AC99 568 aa21.53■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 TCP11X2Q5H9J9 407 aa21.53■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa21.53■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa21.53■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 Q6ZVU0 165 aa21.53■■□□□ 1.04
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LIMS1-208ENST00000428064 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 MFSD2AQ8NA29 543 aa21.53■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 DCAF4L2Q8NA75 395 aa21.53■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa21.53■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 SAP25Q8TEE9 199 aa21.53■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 TBCBQ99426 244 aa21.53■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 PSMB7Q99436 277 aa21.53■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 MUC3BQ9H195 1237 aa21.53■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 DKK4Q9UBT3 224 aa21.53■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 FTSJ1Q9UET6 329 aa21.53■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa21.53■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 F8VZ95 297 aa21.52■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 TLR4O00206 839 aa21.52■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 WNT9AO14904 365 aa21.52■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 RHOCP08134 193 aa21.52■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 CLCN6P51797 869 aa21.52■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 IL9RQ01113 521 aa21.52■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 ALFQ53S48 1182 aa21.52■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 LRRC31Q6UY01 552 aa21.52■■□□□ 1.04
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LIMS1-208ENST00000428064 ZNF677Q86XU0 584 aa21.52■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 EPS8L1Q8TE68 723 aa21.52■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 CCDC114Q96M63 670 aa21.52■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 STK33Q9BYT3 514 aa21.52■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 PREBQ9HCU5 417 aa21.52■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM59LQ9UK28 342 aa21.52■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa21.52■■□□□ 1.04
LIMS1-208ENST00000428064 DOCK4Q8N1I0 1966 aa21.51■■□□□ 1.03
LIMS1-208ENST00000428064 MAGEC1O60732 1142 aa21.51■■□□□ 1.03
LIMS1-208ENST00000428064 RTN2O75298 545 aa21.51■■□□□ 1.03
LIMS1-208ENST00000428064 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
LIMS1-208ENST00000428064 FLT3P36888 993 aa21.51■■□□□ 1.03
LIMS1-208ENST00000428064 RXRGP48443 463 aa21.51■■□□□ 1.03
LIMS1-208ENST00000428064 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
LIMS1-208ENST00000428064 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
LIMS1-208ENST00000428064 NOMO3P69849 1222 aa21.51■■□□□ 1.03
LIMS1-208ENST00000428064 CNTN1Q12860 1018 aa21.51■■□□□ 1.03
LIMS1-208ENST00000428064 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa21.51■■□□□ 1.03
LIMS1-208ENST00000428064 ARTNQ5T4W7 220 aa21.51■■□□□ 1.03
LIMS1-208ENST00000428064 C6orf118Q5T5N4 469 aa21.51■■□□□ 1.03
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF783Q6ZMS7 281 aa21.51■■□□□ 1.03
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LIMS1-208ENST00000428064 HAPLN3Q96S86 360 aa21.51■■□□□ 1.03
LIMS1-208ENST00000428064 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
LIMS1-208ENST00000428064 VPS51Q9UID3 782 aa21.51■■□□□ 1.03
LIMS1-208ENST00000428064 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
LIMS1-208ENST00000428064 KNL1Q8NG31 2342 aa21.51■■□□□ 1.03
LIMS1-208ENST00000428064 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
LIMS1-208ENST00000428064 ITGAVP06756 1048 aa21.5■■□□□ 1.03
LIMS1-208ENST00000428064 CDK4P11802 303 aa21.5■■□□□ 1.03
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF18P17022 549 aa21.5■■□□□ 1.03
LIMS1-208ENST00000428064 CCDC15Q0P6D6 951 aa21.5■■□□□ 1.03
LIMS1-208ENST00000428064 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
LIMS1-208ENST00000428064 NEK5Q6P3R8 708 aa21.5■■□□□ 1.03
LIMS1-208ENST00000428064 ATP11CQ8NB49 1132 aa21.5■■□□□ 1.03
LIMS1-208ENST00000428064 TMIEQ8NEW7 156 aa21.5■■□□□ 1.03
LIMS1-208ENST00000428064 OR2A12Q8NGT7 310 aa21.5■■□□□ 1.03
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF212Q9UDV6 495 aa21.5■■□□□ 1.03
LIMS1-208ENST00000428064 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa21.5■■□□□ 1.03
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