RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426282.6

NUP50-AS1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUP50-AS1, Length 2,076 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 LHX8Q68G74 356 aa19.04■□□□□ 0.64
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP19.04■□□□□ 0.64
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TTC9BQ8N6N2 239 aa19.04■□□□□ 0.64
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IPMKQ8NFU5 416 aa19.04■□□□□ 0.64
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AGAP11Q8TF27 550 aa19.04■□□□□ 0.64
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 WWP1Q9H0M0 922 aa19.04■□□□□ 0.64
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