RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424089.5

POLR1A-204, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 576 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-204ENST00000424089 COX16Q9P0S2 106 aa10.28□□□□□ -0.76
POLR1A-204ENST00000424089 OR12D3Q9UGF7 316 aa10.28□□□□□ -0.76
POLR1A-204ENST00000424089 SCML2Q9UQR0 700 aa10.28□□□□□ -0.76
POLR1A-204ENST00000424089 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa10.28□□□□□ -0.76
POLR1A-204ENST00000424089 VPS13AQ96RL7 3174 aa10.28□□□□□ -0.76
POLR1A-204ENST00000424089 CACNA1GO43497 2377 aa10.28□□□□□ -0.76
POLR1A-204ENST00000424089 MAGEB16A2A368 324 aa10.27□□□□□ -0.77
POLR1A-204ENST00000424089 C2CD4DB7Z1M9 353 aa10.27□□□□□ -0.77
POLR1A-204ENST00000424089 H7C4K7 107 aa10.27□□□□□ -0.77
POLR1A-204ENST00000424089 MYO1CO00159 1063 aa10.27□□□□□ -0.77
POLR1A-204ENST00000424089 IRAK2O43187 625 aa10.27□□□□□ -0.77
POLR1A-204ENST00000424089 BANF1O75531 89 aa10.27□□□□□ -0.77
POLR1A-204ENST00000424089 ALDH1A2O94788 518 aa10.27□□□□□ -0.77
POLR1A-204ENST00000424089 SUN1O94901 812 aa10.27□□□□□ -0.77
POLR1A-204ENST00000424089 ALDH2P05091 517 aa10.27□□□□□ -0.77
POLR1A-204ENST00000424089 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
POLR1A-204ENST00000424089 VAV1P15498 845 aa10.27□□□□□ -0.77
POLR1A-204ENST00000424089 CA4P22748 312 aa10.27□□□□□ -0.77
POLR1A-204ENST00000424089 HOXC13P31276 330 aa10.27□□□□□ -0.77
POLR1A-204ENST00000424089 OR1G1P47890 313 aa10.27□□□□□ -0.77
POLR1A-204ENST00000424089 PSEN1P49768 467 aa10.27□□□□□ -0.77
POLR1A-204ENST00000424089 SLC5A3P53794 718 aa10.27□□□□□ -0.77
POLR1A-204ENST00000424089 SLC18A2Q05940 514 aa10.27□□□□□ -0.77
POLR1A-204ENST00000424089 WASHC5Q12768 1159 aa10.27□□□□□ -0.77
POLR1A-204ENST00000424089 MPP2Q14168 576 aa10.27□□□□□ -0.77
POLR1A-204ENST00000424089 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
POLR1A-204ENST00000424089 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
POLR1A-204ENST00000424089 STEAP4Q687X5 459 aa10.27□□□□□ -0.77
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF280DQ6N043 979 aa10.27□□□□□ -0.77
POLR1A-204ENST00000424089 TAC4Q86UU9 113 aa10.27□□□□□ -0.77
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF280BQ86YH2 543 aa10.27□□□□□ -0.77
POLR1A-204ENST00000424089 IGDCC3Q8IVU1 814 aa10.27□□□□□ -0.77
POLR1A-204ENST00000424089 KIAA2013Q8IYS2 634 aa10.27□□□□□ -0.77
POLR1A-204ENST00000424089 NUP93Q8N1F7 819 aa10.27□□□□□ -0.77
POLR1A-204ENST00000424089 LRRC43Q8N309 656 aa10.27□□□□□ -0.77
POLR1A-204ENST00000424089 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
POLR1A-204ENST00000424089 FLCNQ8NFG4 579 aa10.27□□□□□ -0.77
POLR1A-204ENST00000424089 MZB1Q8WU39 189 aa10.27□□□□□ -0.77
POLR1A-204ENST00000424089 CDKL2Q92772 493 aa10.27□□□□□ -0.77
POLR1A-204ENST00000424089 SERPINB11Q96P15 392 aa10.27□□□□□ -0.77
POLR1A-204ENST00000424089 TSGA13Q96PP4 275 aa10.27□□□□□ -0.77
POLR1A-204ENST00000424089 LGMNQ99538 433 aa10.27□□□□□ -0.77
POLR1A-204ENST00000424089 MAGEB5Q9BZ81 275 aa10.27□□□□□ -0.77
POLR1A-204ENST00000424089 VPS11Q9H270 941 aa10.27□□□□□ -0.77
POLR1A-204ENST00000424089 POMKQ9H5K3 350 aa10.27□□□□□ -0.77
POLR1A-204ENST00000424089 CWH43Q9H720 699 aa10.27□□□□□ -0.77
POLR1A-204ENST00000424089 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa10.27□□□□□ -0.77
POLR1A-204ENST00000424089 DZANK1Q9NVP4 752 aa10.27□□□□□ -0.77
POLR1A-204ENST00000424089 SPG21Q9NZD8 308 aa10.27□□□□□ -0.77
POLR1A-204ENST00000424089 IL37Q9NZH6 218 aa10.27□□□□□ -0.77
POLR1A-204ENST00000424089 FAM159BA6NKW6 160 aa10.26□□□□□ -0.77
POLR1A-204ENST00000424089 HIDE1A8MVS5 230 aa10.26□□□□□ -0.77
POLR1A-204ENST00000424089 TCP11X1B4DZS4 312 aa10.26□□□□□ -0.77
POLR1A-204ENST00000424089 SNX3O60493 162 aa10.26□□□□□ -0.77
POLR1A-204ENST00000424089 LRIG2O94898 1065 aa10.26□□□□□ -0.77
POLR1A-204ENST00000424089 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
POLR1A-204ENST00000424089 CREB1P16220 341 aa10.26□□□□□ -0.77
POLR1A-204ENST00000424089 PGAM1P18669 254 aa10.26□□□□□ -0.77
POLR1A-204ENST00000424089 KRT4P19013 534 aa10.26□□□□□ -0.77
POLR1A-204ENST00000424089 CCNCP24863 283 aa10.26□□□□□ -0.77
POLR1A-204ENST00000424089 EPHB2P29323 1055 aa10.26□□□□□ -0.77
POLR1A-204ENST00000424089 GARSP41250 739 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
POLR1A-204ENST00000424089 MAGEA9P43362 315 aa10.26□□□□□ -0.77
POLR1A-204ENST00000424089 IFNAR2P48551 515 aa10.26□□□□□ -0.77
POLR1A-204ENST00000424089 NRLP54845 237 aa10.26□□□□□ -0.77
POLR1A-204ENST00000424089 IFT88Q13099 833 aa10.26□□□□□ -0.77
POLR1A-204ENST00000424089 PRPSAP1Q14558 356 aa10.26□□□□□ -0.77
POLR1A-204ENST00000424089 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP10.26□□□□□ -0.77
POLR1A-204ENST00000424089 PDK4Q16654 411 aa10.26□□□□□ -0.77
POLR1A-204ENST00000424089 QPCTQ16769 361 aa10.26□□□□□ -0.77
POLR1A-204ENST00000424089 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa10.26□□□□□ -0.77
POLR1A-204ENST00000424089 SLC39A12Q504Y0 691 aa10.26□□□□□ -0.77
POLR1A-204ENST00000424089 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
POLR1A-204ENST00000424089 ATAT1Q5SQI0 421 aa10.26□□□□□ -0.77
POLR1A-204ENST00000424089 HHATQ5VTY9 493 aa10.26□□□□□ -0.77
POLR1A-204ENST00000424089 MSANTD2Q6P1R3 559 aa10.26□□□□□ -0.77
POLR1A-204ENST00000424089 TIFABQ6ZNK6 161 aa10.26□□□□□ -0.77
POLR1A-204ENST00000424089 CAPN12Q6ZSI9 719 aa10.26□□□□□ -0.77
POLR1A-204ENST00000424089 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa10.26□□□□□ -0.77
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF534Q76KX8 674 aa10.26□□□□□ -0.77
POLR1A-204ENST00000424089 PID1Q7Z2X4 250 aa10.26□□□□□ -0.77
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF567Q8N184 647 aa10.26□□□□□ -0.77
POLR1A-204ENST00000424089 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
POLR1A-204ENST00000424089 BANPQ8N9N5 519 aa10.26□□□□□ -0.77
POLR1A-204ENST00000424089 SPPL2BQ8TCT7 592 aa10.26□□□□□ -0.77
POLR1A-204ENST00000424089 MGARPQ8TDB4 240 aa10.26□□□□□ -0.77
POLR1A-204ENST00000424089 HASPINQ8TF76 798 aa10.26□□□□□ -0.77
POLR1A-204ENST00000424089 EDEM1Q92611 657 aa10.26□□□□□ -0.77
POLR1A-204ENST00000424089 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa10.26□□□□□ -0.77
POLR1A-204ENST00000424089 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
POLR1A-204ENST00000424089 MKS1Q9NXB0 559 aa10.26□□□□□ -0.77
POLR1A-204ENST00000424089 CLIC5Q9NZA1 410 aa10.26□□□□□ -0.77
POLR1A-204ENST00000424089 MOCS1Q9NZB8 636 aa10.26□□□□□ -0.77
POLR1A-204ENST00000424089 ADAM28Q9UKQ2 775 aa10.26□□□□□ -0.77
POLR1A-204ENST00000424089 TTLL3Q9Y4R7 772 aa10.26□□□□□ -0.77
POLR1A-204ENST00000424089 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa10.26□□□□□ -0.77
POLR1A-204ENST00000424089 MYO15AQ9UKN7 3530 aa10.26□□□□□ -0.77
POLR1A-204ENST00000424089 FAM92AA1XBS5 289 aa10.25□□□□□ -0.77
POLR1A-204ENST00000424089 CARNS1A5YM72 827 aa10.25□□□□□ -0.77
POLR1A-204ENST00000424089 CCT8L1PA6NM43 557 aa10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.4 ms