RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 CERS2Q96G23 380 aa3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 SNX27Q96L92 541 aa3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 HHIPQ96QV1 700 aa3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 TTC1Q99614 292 aa3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 SPATC1LQ9H0A9 340 aa3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 ZBTB26Q9HCK0 441 aa3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 CRTAC1Q9NQ79 661 aa3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 PACSIN3Q9UKS6 424 aa3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 TMCO1Q9UM00 188 aa3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 PTPRDP23468 1912 aa3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 KANSL1LA0AUZ9 987 aa3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 ASPDHA6ND91 283 aa3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 RNF103O00237 685 aa3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 USP2O75604 605 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 STK10O94804 968 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 AP2A1O95782 977 aa3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 MLH1P40692 756 aa3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC26A2P50443 739 aa3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 COPAP53621 1224 aa3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 PLCB3Q01970 1234 aa3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 ADGRE1Q14246 886 aa3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 STXBP2Q15833 593 aa3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 MICALL2Q8IY33 904 aa3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 DEFB107AQ8IZN7 70 aa3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 HSFY1Q96LI6 401 aa3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM233B4DJY2 109 aa3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 NDC80O14777 642 aa3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 AXIN1O15169 862 aa3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 RALBP11234 206 aa3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 ATP6V1B2P21281 511 aa3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 KIAA2013Q8IYS2 634 aa3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 PDPRQ8NCN5 879 aa3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 KCTD13Q8WZ19 329 aa3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 PKP2Q99959 881 aa3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 CDH19Q9H159 772 aa3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 TUBB1Q9H4B7 451 aa3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 ACTL8Q9H568 366 aa3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 GGA3Q9NZ52 723 aa3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 TMOD2Q9NZR1 351 aa3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 AP4E1Q9UPM8 1137 aa3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 MEIS3P2A8K0S8 358 aa3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 PGM3O95394 542 aa3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 RAG1P15918 1043 aa3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 PGAM1P18669 254 aa3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 PIK3R1P27986 724 aa3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 ABCG1P45844 678 aa3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 BIRC2Q13490 618 aa3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 MGAT5BQ3V5L5 792 aa3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 PLPP6Q8IY26 295 aa3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 DCUN1D1Q96GG9 259 aa3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 TEKT5Q96M29 485 aa3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 APOL6Q9BWW8 343 aa3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 CAB39LQ9H9S4 337 aa3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 MORF4L1Q9UBU8 362 aa3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 ADAM28Q9UKQ2 775 aa3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 FZD10Q9ULW2 581 aa3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 A0A0J9YVX5 310 aa3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 M0QYV0 167 aa3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 OPHN1O60890 802 aa3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 INSRRP14616 1297 aa3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 KCNE1P15382 129 aa3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 CXCR3P49682 368 aa3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 FYB2Q5VWT5 728 aa3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 C3orf58Q8NDZ4 430 aa3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 OR13J1Q8NGT2 312 aa3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 UBA3Q8TBC4 463 aa3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 FKBP10Q96AY3 582 aa3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 MAN1C1Q9NR34 630 aa3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 CHRAC1Q9NRG0 131 aa3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 GTSE1Q9NYZ3 720 aa3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 A0A087WZ62 844 aa3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 TRIM13O60858 407 aa3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 CAPN15O75808 1086 aa3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 GNAO1P09471 354 aa3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 MPSTP25325 297 aa3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 DNAJB1P25685 340 aa3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 NR2C2P49116 596 aa3.7□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.3 ms