RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409189.7

CCL20-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 839 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-202ENST00000409189 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa6.9□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa6.9□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa6.9□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 HARSP12081 509 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 PRLRP16471 622 aa6.9□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 KLRC1P26715 233 aa6.9□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 ACOT2P49753 483 aa6.9□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 HADHBP55084 474 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 BPIFB4P59827 614 aa6.9□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
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CCL20-202ENST00000409189 BIRC3Q13489 604 aa6.9□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 TDGQ13569 410 aa6.9□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 CUL2Q13617 745 aa6.9□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 SLC10A6Q3KNW5 377 aa6.9□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 TAF2Q6P1X5 1199 aa6.9□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa6.9□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 H2AFVQ71UI9 128 aa6.9□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 RHOT2Q8IXI1 618 aa6.9□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 SYCE1Q8N0S2 351 aa6.9□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 KLHL36Q8N4N3 616 aa6.9□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 SLC30A5Q8TAD4 765 aa6.9□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
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CCL20-202ENST00000409189 SEMA4DQ92854 862 aa6.9□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 SCLT1Q96NL6 688 aa6.9□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 ADPGKQ9BRR6 497 aa6.9□□□□□ -1.3
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CCL20-202ENST00000409189 IFT122Q9HBG6 1241 aa6.9□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
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CCL20-202ENST00000409189 CA14Q9ULX7 337 aa6.9□□□□□ -1.3
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CCL20-202ENST00000409189 SAR1BQ9Y6B6 198 aa6.9□□□□□ -1.3
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CCL20-202ENST00000409189 CTAGE15A4D2H0 777 aa6.89□□□□□ -1.31
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CCL20-202ENST00000409189 ANKRD62A6NC57 917 aa6.89□□□□□ -1.31
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CCL20-202ENST00000409189 AXLP30530 894 aa6.89□□□□□ -1.31
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CCL20-202ENST00000409189 PDE11AQ9HCR9 933 aa6.89□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 GPR27Q9NS67 375 aa6.89□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 RNF14Q9UBS8 474 aa6.89□□□□□ -1.31
CCL20-202ENST00000409189 GTF3C4Q9UKN8 822 aa6.89□□□□□ -1.31
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