RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 SERPINB11Q96P15 392 aa19.84■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 DUSP23Q9BVJ7 150 aa19.84■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 MIS12Q9H081 205 aa19.84■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 EVA1BQ9NVM1 165 aa19.84■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 DNAJC28Q9NX36 388 aa19.84■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa19.84■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP19.83■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 CPED1A4D0V7 1026 aa19.83■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 MCF2LO15068 1137 aa19.83■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 CASC3O15234 703 aaKnown RBP19.83■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF18P17022 549 aa19.83■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP19.83■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 PLK1P53350 603 aa19.83■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 SULT2A1Q06520 285 aa19.83■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF284Q2VY69 593 aa19.83■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa19.83■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 LCLAT1Q6UWP7 414 aa19.83■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 Q6ZVU0 165 aa19.83■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 CLEC14AQ86T13 490 aa19.83■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP19.83■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP19.83■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 WDR70Q9NW82 654 aa19.83■□□□□ 0.77
HOXD12-201ENST00000404162 PTPN13Q12923 2485 aa19.83■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa19.83■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP19.82■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 ATP9BO43861 1147 aa19.82■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 BNIP3LO60238 219 aa19.82■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 TNFSF15O95150 251 aa19.82■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 RPL13P26373 211 aaKnown RBP19.82■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 AKT2P31751 481 aa19.82■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 ME1P48163 572 aa19.82■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP19.82■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 NNTQ13423 1086 aa19.82■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP19.82■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 DLG2Q15700 870 aa19.82■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 CBWD6Q4V339 395 aa19.82■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 CBWD3Q5JTY5 395 aa19.82■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 CBWD5Q5RIA9 395 aa19.82■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP19.82■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 ERICH6BQ5W0A0 696 aa19.82■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 OR6B2Q6IFH4 312 aa19.82■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 Q6ZSR6 202 aa19.82■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa19.82■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 TAC4Q86UU9 113 aa19.82■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 HORMAD1Q86X24 394 aa19.82■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP19.82■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 UBR7Q8N806 425 aa19.82■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP19.82■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP19.82■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 GRAMD1AQ96CP6 724 aa19.82■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 ALG14Q96F25 216 aa19.82■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 IFT43Q96FT9 208 aa19.82■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP19.82■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 ZSWIM1Q9BR11 485 aa19.82■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 STARD5Q9NSY2 213 aa19.82■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP19.82■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP19.82■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 RNF103O00237 685 aa19.81■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 ALOX15BO15296 676 aa19.81■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 ITGB6P18564 788 aa19.81■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 VASPP50552 380 aaPredicted RBP19.81■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP19.81■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 NUCB2P80303 420 aa19.81■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP19.81■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 SYPL2Q5VXT5 272 aa19.81■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP19.81■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP19.81■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 NEK5Q6P3R8 708 aa19.81■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 ATG14Q6ZNE5 492 aa19.81■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP19.81■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 ARL14Q8N4G2 192 aa19.81■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP19.81■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 OR52K2Q8NGK3 314 aa19.81■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 BMFQ96LC9 184 aa19.81■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 KIAA1257Q9ULG3 409 aa19.81■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP19.8■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 SUV39H1O43463 412 aa19.8■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 CALCAP01258 141 aa19.8■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 CTSLP07711 333 aa19.8■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP19.8■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 PERM1Q5SV97 790 aa19.8■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP19.8■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 EXTL1Q92935 676 aa19.8■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 HSFY1Q96LI6 401 aa19.8■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 SLC25A13Q9UJS0 675 aa19.8■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 F5H5T6 163 aa19.79■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 M0QYV0 167 aa19.79■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP19.79■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 FBXO21O94952 628 aa19.79■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 APOEP02649 317 aa19.79■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 CSF2P04141 144 aa19.79■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 PRR29P0C7W0 189 aa19.79■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP19.79■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 LRMPQ12912 555 aa19.79■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 FZD2Q14332 565 aa19.79■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 CNGA2Q16280 664 aa19.79■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 ZCWPW2Q504Y3 356 aa19.79■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 SEL1L3Q68CR1 1132 aa19.79■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP19.79■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 FAM149B1Q96BN6 582 aa19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49 ms