RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393386.6

PTPRZ1-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type Z1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRZ1, Length 8,175 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1-201ENST00000393386 CD274Q9NZQ7 290 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRZ1-201ENST00000393386 UPB1Q9UBR1 384 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRZ1-201ENST00000393386 IRGMA1A4Y4 181 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRZ1-201ENST00000393386 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
PTPRZ1-201ENST00000393386 IPO13O94829 963 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
PTPRZ1-201ENST00000393386 SRGNP10124 158 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRZ1-201ENST00000393386 ABCG1P45844 678 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRZ1-201ENST00000393386 LSM3P62310 102 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
PTPRZ1-201ENST00000393386 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
PTPRZ1-201ENST00000393386 FBXW8Q8N3Y1 598 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRZ1-201ENST00000393386 DMRTB1Q96MA1 342 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRZ1-201ENST00000393386 EYA3Q99504 573 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRZ1-201ENST00000393386 TRIM62Q9BVG3 475 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRZ1-201ENST00000393386 PLA2G12BQ9BX93 195 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRZ1-201ENST00000393386 RIBC2Q9H4K1 309 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRZ1-201ENST00000393386 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
PTPRZ1-201ENST00000393386 SETD4Q9NVD3 440 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRZ1-201ENST00000393386 EXD2Q9NVH0 621 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRZ1-201ENST00000393386 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
PTPRZ1-201ENST00000393386 AP4B1Q9Y6B7 739 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRZ1-201ENST00000393386 STK36Q9NRP7 1315 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRZ1-201ENST00000393386 LAMB1P07942 1786 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRZ1-201ENST00000393386 FREM3P0C091 2139 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRZ1-201ENST00000393386 H3BN98 237 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRZ1-201ENST00000393386 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRZ1-201ENST00000393386 STX16O14662 325 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRZ1-201ENST00000393386 VPS4BO75351 444 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRZ1-201ENST00000393386 CBX6O95503 412 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRZ1-201ENST00000393386 NR3C1P04150 777 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRZ1-201ENST00000393386 PSAPP07602 524 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRZ1-201ENST00000393386 ITGA2BP08514 1039 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRZ1-201ENST00000393386 SLC5A3P53794 718 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRZ1-201ENST00000393386 POU4F1Q01851 419 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRZ1-201ENST00000393386 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP5.61□□□□□ -1.51
PTPRZ1-201ENST00000393386 PTK6Q13882 451 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRZ1-201ENST00000393386 ANKDD1AQ495B1 522 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRZ1-201ENST00000393386 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRZ1-201ENST00000393386 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
PTPRZ1-201ENST00000393386 EFHBQ8N7U6 833 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRZ1-201ENST00000393386 ANKS1AQ92625 1134 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRZ1-201ENST00000393386 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
PTPRZ1-201ENST00000393386 REEP1Q9H902 201 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRZ1-201ENST00000393386 UCKL1Q9NWZ5 548 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRZ1-201ENST00000393386 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRZ1-201ENST00000393386 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRZ1-201ENST00000393386 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP5.61□□□□□ -1.51
PTPRZ1-201ENST00000393386 SPTLC1O15269 473 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRZ1-201ENST00000393386 RP2O75695 350 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRZ1-201ENST00000393386 PRH1P02810 166 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRZ1-201ENST00000393386 STAT3P40763 770 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRZ1-201ENST00000393386 VAMP7P51809 220 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRZ1-201ENST00000393386 GALNT3Q14435 633 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRZ1-201ENST00000393386 ZNF234Q14588 700 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRZ1-201ENST00000393386 STRIP1Q5VSL9 837 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRZ1-201ENST00000393386 LINC00523Q86TU6 105 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRZ1-201ENST00000393386 CD302Q8IX05 232 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRZ1-201ENST00000393386 CLYBLQ8N0X4 340 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRZ1-201ENST00000393386 PNMA1Q8ND90 353 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRZ1-201ENST00000393386 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
PTPRZ1-201ENST00000393386 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRZ1-201ENST00000393386 SPIRE2Q8WWL2 714 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRZ1-201ENST00000393386 ARL5BQ96KC2 179 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRZ1-201ENST00000393386 C8orf48Q96LL4 319 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRZ1-201ENST00000393386 KLHL5Q96PQ7 755 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRZ1-201ENST00000393386 CDRT15Q96T59 188 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRZ1-201ENST00000393386 NAT9Q9BTE0 207 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRZ1-201ENST00000393386 ADI1Q9BV57 179 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRZ1-201ENST00000393386 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
PTPRZ1-201ENST00000393386 PKP3Q9Y446 797 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRZ1-201ENST00000393386 NEDD4P46934 1319 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRZ1-201ENST00000393386 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
PTPRZ1-201ENST00000393386 SVILO95425 2214 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRZ1-201ENST00000393386 PCNX2A6NKB5 2137 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRZ1-201ENST00000393386 RGL2O15211 777 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRZ1-201ENST00000393386 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
PTPRZ1-201ENST00000393386 OIP5O43482 229 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRZ1-201ENST00000393386 ENTPD5O75356 428 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRZ1-201ENST00000393386 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
PTPRZ1-201ENST00000393386 NOS3P29474 1203 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRZ1-201ENST00000393386 GYG1P46976 350 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRZ1-201ENST00000393386 TRIM32Q13049 653 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRZ1-201ENST00000393386 ZBTB6Q15916 424 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRZ1-201ENST00000393386 PLEKHG6Q3KR16 790 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRZ1-201ENST00000393386 FAXCQ5TGI0 409 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRZ1-201ENST00000393386 ERAP2Q6P179 960 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRZ1-201ENST00000393386 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
PTPRZ1-201ENST00000393386 C18orf8Q96DM3 657 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRZ1-201ENST00000393386 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
PTPRZ1-201ENST00000393386 PIGSQ96S52 555 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRZ1-201ENST00000393386 TMLHEQ9NVH6 421 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRZ1-201ENST00000393386 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
PTPRZ1-201ENST00000393386 GLS2Q9UI32 602 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRZ1-201ENST00000393386 VANGL2Q9ULK5 521 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRZ1-201ENST00000393386 GINS2Q9Y248 185 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRZ1-201ENST00000393386 MED12LQ86YW9 2145 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRZ1-201ENST00000393386 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRZ1-201ENST00000393386 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRZ1-201ENST00000393386 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
PTPRZ1-201ENST00000393386 KCNA5P22460 613 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRZ1-201ENST00000393386 YWHAQP27348 245 aa5.61□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.5 ms