RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380221.7

TRAPPC10-202, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC10, Length 1,763 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-202ENST00000380221 MAFKO60675 156 aa28.37■■■□□ 2.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 STIP1P31948 543 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 PLTPP55058 493 aa28.37■■■□□ 2.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 GNA12Q03113 381 aa28.37■■■□□ 2.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 CDH18Q13634 790 aa28.37■■■□□ 2.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 PARP15Q460N3 678 aa28.37■■■□□ 2.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZDHHC24Q6UX98 284 aa28.37■■■□□ 2.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF354CQ86Y25 554 aa28.37■■■□□ 2.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 MFSD6LQ8IWD5 586 aa28.37■■■□□ 2.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 HTR3CQ8WXA8 447 aa28.37■■■□□ 2.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 E2F7Q96AV8 911 aa28.37■■■□□ 2.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 BBS2Q9BXC9 721 aa28.37■■■□□ 2.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 BRD8Q9H0E9 1235 aa28.37■■■□□ 2.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 ARHGAP42A6NI28 874 aa28.36■■■□□ 2.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 GRM2Q14416 872 aa28.36■■■□□ 2.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 OTOP3Q7RTS5 596 aa28.36■■■□□ 2.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 CCDC89Q8N998 374 aa28.36■■■□□ 2.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 OR7D4Q8NG98 312 aa28.36■■■□□ 2.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 HLA-CQ95604 372 aa28.36■■■□□ 2.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 ELSPBP1Q96BH3 223 aa28.36■■■□□ 2.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 ILVBLA1L0T0 632 aa28.35■■■□□ 2.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 CFAP69A5D8W1 941 aa28.35■■■□□ 2.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 PENKP01210 267 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 ADCY8P40145 1251 aa28.35■■■□□ 2.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 VPS41P49754 854 aa28.35■■■□□ 2.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 CALCOCO2Q13137 446 aa28.35■■■□□ 2.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 DHCR24Q15392 516 aa28.35■■■□□ 2.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 RNF43Q68DV7 783 aa28.35■■■□□ 2.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 CCDC13Q8IYE1 715 aa28.35■■■□□ 2.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 FBXO25Q8TCJ0 367 aa28.35■■■□□ 2.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 SNF8Q96H20 258 aa28.35■■■□□ 2.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 FMO2Q99518 471 aa28.35■■■□□ 2.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 MAGEH1Q9H213 219 aa28.35■■■□□ 2.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 EBF3Q9H4W6 596 aa28.35■■■□□ 2.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 SEPT10Q9P0V9 454 aa28.35■■■□□ 2.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 WHRNQ9P202 907 aa28.35■■■□□ 2.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 EPS15L1Q9UBC2 864 aa28.35■■■□□ 2.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 CHD5Q8TDI0 1954 aa28.35■■■□□ 2.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 KCNK1O00180 336 aa28.34■■■□□ 2.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 ARSAP15289 507 aa28.34■■■□□ 2.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 CCNCP24863 283 aa28.34■■■□□ 2.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 IVDP26440 423 aa28.34■■■□□ 2.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 FCHO2Q0JRZ9 810 aa28.34■■■□□ 2.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 SERINC3Q13530 473 aa28.34■■■□□ 2.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 ART4Q93070 314 aa28.34■■■□□ 2.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 TSGA13Q96PP4 275 aa28.34■■■□□ 2.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 FAM83CQ9BQN1 747 aa28.34■■■□□ 2.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 VIPAS39Q9H9C1 493 aa28.34■■■□□ 2.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 HPCAL4Q9UM19 191 aa28.34■■■□□ 2.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 CYP17A1P05093 508 aa28.34■■■□□ 2.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 TYRP14679 529 aa28.34■■■□□ 2.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 LRRC49Q8IUZ0 686 aa28.34■■■□□ 2.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 CCHCR1Q8TD31 782 aa28.34■■■□□ 2.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 RTP4Q96DX8 246 aa28.34■■■□□ 2.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 CEP41Q9BYV8 373 aa28.34■■■□□ 2.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 MUC3BQ9H195 1237 aa28.34■■■□□ 2.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 J3KR12 359 aa28.33■■■□□ 2.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 PSMC3P17980 439 aa28.33■■■□□ 2.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 ITIH2P19823 946 aa28.33■■■□□ 2.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 IL31Q6EBC2 164 aa28.33■■■□□ 2.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 FIBINQ8TAL6 211 aa28.33■■■□□ 2.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 SPON2Q9BUD6 331 aa28.33■■■□□ 2.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 FAM129AQ9BZQ8 928 aa28.33■■■□□ 2.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 MARK1Q9P0L2 795 aa28.33■■■□□ 2.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 ECI2O75521 394 aa28.32■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF33AQ06730 810 aa28.32■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 TNK2Q07912 1038 aa28.32■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 WASHC5Q12768 1159 aa28.32■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 YAF2Q8IY57 180 aa28.32■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 MREGQ8N565 214 aa28.32■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 PCDH9Q9HC56 1237 aa28.32■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 NUMBLQ9Y6R0 609 aa28.32■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 CSKP41240 450 aa28.32■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 MTSS1LQ765P7 747 aa28.32■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 NAT16Q8N8M0 369 aa28.32■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 CCDC110Q8TBZ0 833 aa28.32■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 ATP2A3Q93084 1043 aa28.32■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 FEM1AQ9BSK4 669 aa28.32■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 SP110Q9HB58 689 aa28.32■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 ATP13A1Q9HD20 1204 aa28.32■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 FAM53CQ9NYF3 392 aa28.32■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 RNF103O00237 685 aa28.31■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 GLDCP23378 1020 aa28.31■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 RPL22P35268 128 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 LMAN2Q12907 356 aa28.31■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF783Q6ZMS7 281 aa28.31■■■□□ 2.12
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