RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376959.6

KCNC3-201, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene KCNC3, Length 5,447 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3-201ENST00000376959 SNAPC2Q13487 334 aa22.64■■□□□ 1.22
KCNC3-201ENST00000376959 C16orf46Q6P387 395 aa22.64■■□□□ 1.22
KCNC3-201ENST00000376959 RAET1EQ8TD07 263 aa22.64■■□□□ 1.22
KCNC3-201ENST00000376959 OPTCQ9UBM4 332 aa22.64■■□□□ 1.22
KCNC3-201ENST00000376959 ITGA11Q9UKX5 1188 aa22.64■■□□□ 1.22
KCNC3-201ENST00000376959 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa22.64■■□□□ 1.22
KCNC3-201ENST00000376959 COX7A2P14406 83 aa22.64■■□□□ 1.21
KCNC3-201ENST00000376959 ITGB6P18564 788 aa22.64■■□□□ 1.21
KCNC3-201ENST00000376959 PLK1P53350 603 aa22.64■■□□□ 1.21
KCNC3-201ENST00000376959 ARCQ7LC44 396 aa22.64■■□□□ 1.21
KCNC3-201ENST00000376959 HERC6Q8IVU3 1022 aa22.64■■□□□ 1.21
KCNC3-201ENST00000376959 CHST7Q9NS84 486 aa22.64■■□□□ 1.21
KCNC3-201ENST00000376959 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
KCNC3-201ENST00000376959 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
KCNC3-201ENST00000376959 DRD4P21917 467 aa22.64■■□□□ 1.21
KCNC3-201ENST00000376959 BCAP31P51572 246 aa22.64■■□□□ 1.21
KCNC3-201ENST00000376959 ACSM2AQ08AH3 577 aa22.64■■□□□ 1.21
KCNC3-201ENST00000376959 ACSM2BQ68CK6 577 aa22.64■■□□□ 1.21
KCNC3-201ENST00000376959 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa22.64■■□□□ 1.21
KCNC3-201ENST00000376959 PRKAR1AP10644 381 aa22.64■■□□□ 1.21
KCNC3-201ENST00000376959 SAPCD2Q86UD0 394 aa22.64■■□□□ 1.21
KCNC3-201ENST00000376959 FAM20CQ8IXL6 584 aa22.64■■□□□ 1.21
KCNC3-201ENST00000376959 C4orf19Q8IY42 314 aa22.64■■□□□ 1.21
KCNC3-201ENST00000376959 TCF12Q99081 682 aa22.64■■□□□ 1.21
KCNC3-201ENST00000376959 PDCD10Q9BUL8 212 aa22.64■■□□□ 1.21
KCNC3-201ENST00000376959 ZNF446Q9NWS9 450 aa22.64■■□□□ 1.21
KCNC3-201ENST00000376959 NDUFB5O43674 189 aa22.63■■□□□ 1.21
KCNC3-201ENST00000376959 ABHD2P08910 425 aa22.63■■□□□ 1.21
KCNC3-201ENST00000376959 TSHRP16473 764 aa22.63■■□□□ 1.21
KCNC3-201ENST00000376959 HNMTP50135 292 aa22.63■■□□□ 1.21
KCNC3-201ENST00000376959 MTA1Q13330 715 aa22.63■■□□□ 1.21
KCNC3-201ENST00000376959 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP22.63■■□□□ 1.21
KCNC3-201ENST00000376959 SAMD3Q8N6K7 520 aa22.63■■□□□ 1.21
KCNC3-201ENST00000376959 FBXO28Q9NVF7 368 aa22.63■■□□□ 1.21
KCNC3-201ENST00000376959 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
KCNC3-201ENST00000376959 OPLAHO14841 1288 aa22.63■■□□□ 1.21
KCNC3-201ENST00000376959 CHADO15335 359 aa22.63■■□□□ 1.21
KCNC3-201ENST00000376959 OR6A2O95222 327 aa22.63■■□□□ 1.21
KCNC3-201ENST00000376959 ARP10275 920 aa22.63■■□□□ 1.21
KCNC3-201ENST00000376959 S100A1P23297 94 aa22.63■■□□□ 1.21
KCNC3-201ENST00000376959 MBOAT7Q96N66 472 aa22.63■■□□□ 1.21
KCNC3-201ENST00000376959 MAPRE3Q9UPY8 281 aa22.63■■□□□ 1.21
KCNC3-201ENST00000376959 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
KCNC3-201ENST00000376959 AP4B1Q9Y6B7 739 aa22.63■■□□□ 1.21
KCNC3-201ENST00000376959 FAM86B2P0C5J1 330 aa22.63■■□□□ 1.21
KCNC3-201ENST00000376959 AMPD1P23109 780 aa22.63■■□□□ 1.21
KCNC3-201ENST00000376959 POLD2P49005 469 aa22.63■■□□□ 1.21
KCNC3-201ENST00000376959 SPESP1Q6UW49 350 aa22.63■■□□□ 1.21
KCNC3-201ENST00000376959 CCDC3Q9BQI4 270 aa22.63■■□□□ 1.21
KCNC3-201ENST00000376959 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
KCNC3-201ENST00000376959 TSPAN16Q9UKR8 245 aa22.63■■□□□ 1.21
KCNC3-201ENST00000376959 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
KCNC3-201ENST00000376959 UBE2Q2LH0YL09 131 aa22.63■■□□□ 1.21
KCNC3-201ENST00000376959 RAMP2O60895 175 aa22.63■■□□□ 1.21
KCNC3-201ENST00000376959 OR56A5P0C7T3 313 aa22.63■■□□□ 1.21
KCNC3-201ENST00000376959 GPSM1Q86YR5 675 aa22.63■■□□□ 1.21
KCNC3-201ENST00000376959 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
KCNC3-201ENST00000376959 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa22.63■■□□□ 1.21
KCNC3-201ENST00000376959 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa22.63■■□□□ 1.21
KCNC3-201ENST00000376959 GPR182O15218 404 aa22.62■■□□□ 1.21
KCNC3-201ENST00000376959 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
KCNC3-201ENST00000376959 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa22.62■■□□□ 1.21
KCNC3-201ENST00000376959 TCAIMQ8N3R3 496 aa22.62■■□□□ 1.21
KCNC3-201ENST00000376959 PANX3Q96QZ0 392 aa22.62■■□□□ 1.21
KCNC3-201ENST00000376959 ADAM28Q9UKQ2 775 aa22.62■■□□□ 1.21
KCNC3-201ENST00000376959 PTPN3P26045 913 aa22.62■■□□□ 1.21
KCNC3-201ENST00000376959 SLC15A2Q16348 729 aa22.62■■□□□ 1.21
KCNC3-201ENST00000376959 SLC9A7Q96T83 725 aa22.62■■□□□ 1.21
KCNC3-201ENST00000376959 NDNQ99608 321 aa22.62■■□□□ 1.21
KCNC3-201ENST00000376959 CRB1P82279 1406 aa22.62■■□□□ 1.21
KCNC3-201ENST00000376959 TTLL13PA6NNM8 815 aa22.62■■□□□ 1.21
KCNC3-201ENST00000376959 KCNT2Q6UVM3 1135 aa22.62■■□□□ 1.21
KCNC3-201ENST00000376959 VPS35Q96QK1 796 aa22.62■■□□□ 1.21
KCNC3-201ENST00000376959 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
KCNC3-201ENST00000376959 UMPSP11172 480 aa22.62■■□□□ 1.21
KCNC3-201ENST00000376959 CLCN3P51790 818 aa22.62■■□□□ 1.21
KCNC3-201ENST00000376959 PPP4CP60510 307 aa22.62■■□□□ 1.21
KCNC3-201ENST00000376959 ARMC8Q8IUR7 673 aa22.62■■□□□ 1.21
KCNC3-201ENST00000376959 PTGFRNQ9P2B2 879 aa22.62■■□□□ 1.21
KCNC3-201ENST00000376959 SERPINA6P08185 405 aa22.61■■□□□ 1.21
KCNC3-201ENST00000376959 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
KCNC3-201ENST00000376959 CASP5P51878 434 aa22.61■■□□□ 1.21
KCNC3-201ENST00000376959 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
KCNC3-201ENST00000376959 TAF8Q7Z7C8 310 aa22.61■■□□□ 1.21
KCNC3-201ENST00000376959 RACGAP1Q9H0H5 632 aa22.61■■□□□ 1.21
KCNC3-201ENST00000376959 SHBGP04278 402 aa22.61■■□□□ 1.21
KCNC3-201ENST00000376959 NAA20P61599 178 aa22.61■■□□□ 1.21
KCNC3-201ENST00000376959 PARP6Q2NL67 630 aa22.61■■□□□ 1.21
KCNC3-201ENST00000376959 RFX4Q33E94 735 aa22.61■■□□□ 1.21
KCNC3-201ENST00000376959 TOR4AQ9NXH8 423 aa22.61■■□□□ 1.21
KCNC3-201ENST00000376959 SERPINA1P01009 418 aa22.61■■□□□ 1.21
KCNC3-201ENST00000376959 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
KCNC3-201ENST00000376959 RETSATQ6NUM9 610 aa22.61■■□□□ 1.21
KCNC3-201ENST00000376959 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
KCNC3-201ENST00000376959 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
KCNC3-201ENST00000376959 KLHL32Q96NJ5 620 aa22.61■■□□□ 1.21
KCNC3-201ENST00000376959 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
KCNC3-201ENST00000376959 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa22.61■■□□□ 1.21
KCNC3-201ENST00000376959 PLCL1Q15111 1095 aa22.61■■□□□ 1.21
KCNC3-201ENST00000376959 COX4I2Q96KJ9 171 aa22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.1 ms