RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372904.7

TTPAL-202, Transcript of alpha tocopherol transfer protein like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTPAL, Length 6,234 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAL-202ENST00000372904 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa10.21□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 TMEM161AQ9NX61 479 aa10.21□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 SUN2Q9UH99 717 aa10.21□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 HAO1Q9UJM8 370 aa10.21□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 CRYL1Q9Y2S2 319 aa10.21□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 ATAD5Q96QE3 1844 aa10.21□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa10.2□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa10.2□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 CCL16O15467 120 aa10.2□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 LRIG2O94898 1065 aa10.2□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 UPP1Q16831 310 aa10.2□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 CCDC142Q17RM4 750 aa10.2□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 PCID2Q5JVF3 399 aa10.2□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 CERS2Q96G23 380 aa10.2□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 CRTAC1Q9NQ79 661 aa10.2□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 KLC4Q9NSK0 619 aa10.2□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 A0A096LPK6 155 aa10.2□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 SLC1A6P48664 564 aa10.2□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 KAT6AQ92794 2004 aa10.2□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 PIGVQ9NUD9 493 aa10.2□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 BEST1O76090 585 aa10.2□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 PIRTP0C851 137 aa10.2□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 ZNF567Q8N184 647 aa10.2□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 TTC30BQ8N4P2 665 aa10.2□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 FBXO22Q8NEZ5 403 aa10.2□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 TRIM54Q9BYV2 358 aa10.2□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 ACOT9Q9Y305 439 aa10.2□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 SERPINB4P48594 390 aa10.2□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 PRMT2P55345 433 aa10.2□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 AGMOQ6ZNB7 445 aa10.2□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 BPIFA1Q9NP55 256 aa10.2□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 SPG21Q9NZD8 308 aa10.2□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa10.2□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa10.2□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 SLC38A8A6NNN8 435 aa10.2□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 C9IYK1 514 aa10.2□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 APOA4P06727 396 aa10.2□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 ZNF280BQ86YH2 543 aa10.2□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 SNX31Q8N9S9 440 aa10.2□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 SMOQ99835 787 aa10.2□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 ASAH2Q9NR71 780 aa10.2□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 SEPT3Q9UH03 358 aa10.2□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 SUPT7LO94864 414 aa10.19□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 TBX18O95935 607 aa10.19□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 GABRR2P28476 465 aa10.19□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 TLE2Q04725 743 aa10.19□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 DPYSL2Q16555 572 aa10.19□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 GLIS1Q8NBF1 620 aa10.19□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 ZBTB18Q99592 522 aa10.19□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 SEMA3CQ99985 751 aa10.19□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 DNAJB4Q9UDY4 337 aa10.19□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 RAD54BQ9Y620 910 aa10.19□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 MAP3K7O43318 606 aa10.19□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 STAU1O95793 577 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 HMOX2P30519 316 aa10.19□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 ITGA9Q13797 1035 aa10.19□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa10.19□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 CCDC149Q6ZUS6 474 aa10.19□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 AUTS2Q8WXX7 1259 aa10.19□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 BTN2A3PQ96KV6 586 aa10.19□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 ACSS3Q9H6R3 686 aa10.19□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 RGS18Q9NS28 235 aa10.19□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 DTLQ9NZJ0 730 aa10.19□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa10.19□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 STK25O00506 426 aa10.19□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 TRIM16O95361 564 aa10.19□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 FMO4P31512 558 aa10.19□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 PTPN7P35236 360 aa10.19□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 SCTRP47872 440 aa10.19□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 MOGSQ13724 837 aa10.19□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 HMCESQ96FZ2 354 aa10.19□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 NDNQ99608 321 aa10.19□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 AIM2O14862 343 aa10.19□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 LAG3P18627 525 aa10.19□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 SERPINB5P36952 375 aa10.19□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 CDK16Q00536 496 aa10.19□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 GTF2H3Q13889 308 aa10.19□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 TCEAL1Q15170 157 aa10.19□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 TAF11Q15544 211 aa10.19□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 TRIM60Q495X7 471 aa10.19□□□□□ -0.78
TTPAL-202ENST00000372904 LRRC8BQ6P9F7 803 aa10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms