RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369838.5

SH3BGRL2-201, Transcript of SH3 domain binding glutamate rich protein like 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BGRL2, Length 4,653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRL2-201ENST00000369838 ASXL3Q9C0F0 2248 aa12.27□□□□□ -0.45
SH3BGRL2-201ENST00000369838 TBC1D4O60343 1298 aa12.27□□□□□ -0.45
SH3BGRL2-201ENST00000369838 C1RP00736 705 aa12.27□□□□□ -0.45
SH3BGRL2-201ENST00000369838 APODP05090 189 aa12.27□□□□□ -0.45
SH3BGRL2-201ENST00000369838 SKOR1P84550 965 aa12.27□□□□□ -0.45
SH3BGRL2-201ENST00000369838 TGM3Q08188 693 aa12.27□□□□□ -0.45
SH3BGRL2-201ENST00000369838 DMC1Q14565 340 aa12.27□□□□□ -0.45
SH3BGRL2-201ENST00000369838 VSTM1Q6UX27 236 aa12.27□□□□□ -0.45
SH3BGRL2-201ENST00000369838 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP12.27□□□□□ -0.45
SH3BGRL2-201ENST00000369838 KCNMB4Q86W47 210 aa12.27□□□□□ -0.45
SH3BGRL2-201ENST00000369838 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.45
SH3BGRL2-201ENST00000369838 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP12.27□□□□□ -0.45
SH3BGRL2-201ENST00000369838 SHC3Q92529 594 aa12.27□□□□□ -0.45
SH3BGRL2-201ENST00000369838 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.45
SH3BGRL2-201ENST00000369838 COL4A1P02462 1669 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BGRL2-201ENST00000369838 NOL4O94818 638 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BGRL2-201ENST00000369838 GNRH1P01148 92 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BGRL2-201ENST00000369838 CATP04040 527 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
SH3BGRL2-201ENST00000369838 MLNP12872 115 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BGRL2-201ENST00000369838 CYP2A7P20853 494 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BGRL2-201ENST00000369838 KDELR1P24390 212 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BGRL2-201ENST00000369838 KRT20P35900 424 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BGRL2-201ENST00000369838 SERPINB8P50452 374 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BGRL2-201ENST00000369838 LRRC36Q1X8D7 754 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BGRL2-201ENST00000369838 C2orf27AQ580R0 203 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BGRL2-201ENST00000369838 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BGRL2-201ENST00000369838 NEPROQ6NW34 567 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BGRL2-201ENST00000369838 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
SH3BGRL2-201ENST00000369838 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
SH3BGRL2-201ENST00000369838 BCAS3Q9H6U6 928 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BGRL2-201ENST00000369838 PCDH9Q9HC56 1237 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BGRL2-201ENST00000369838 ARL15Q9NXU5 204 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BGRL2-201ENST00000369838 ZBTB14O43829 449 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BGRL2-201ENST00000369838 GLRA3O75311 464 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BGRL2-201ENST00000369838 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP12.26□□□□□ -0.45
SH3BGRL2-201ENST00000369838 UGT2B4P06133 528 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BGRL2-201ENST00000369838 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
SH3BGRL2-201ENST00000369838 LILRA4P59901 499 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BGRL2-201ENST00000369838 CNTN1Q12860 1018 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BGRL2-201ENST00000369838 SAPCD2Q86UD0 394 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BGRL2-201ENST00000369838 SLC26A11Q86WA9 606 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BGRL2-201ENST00000369838 C1orf127Q8N9H9 656 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BGRL2-201ENST00000369838 INPP5DQ92835 1189 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BGRL2-201ENST00000369838 GRAMD1AQ96CP6 724 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BGRL2-201ENST00000369838 RIPOR3Q96MK2 946 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BGRL2-201ENST00000369838 PANX3Q96QZ0 392 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BGRL2-201ENST00000369838 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP12.26□□□□□ -0.45
SH3BGRL2-201ENST00000369838 ARHGEF4Q9NR80 690 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BGRL2-201ENST00000369838 INSL6Q9Y581 213 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BGRL2-201ENST00000369838 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
SH3BGRL2-201ENST00000369838 MYBPHLA2RUH7 354 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BGRL2-201ENST00000369838 BTN3A1O00481 513 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BGRL2-201ENST00000369838 SERPINI2O75830 405 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BGRL2-201ENST00000369838 STBD1O95210 358 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BGRL2-201ENST00000369838 RBP1P09455 135 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BGRL2-201ENST00000369838 CCNB1P14635 433 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BGRL2-201ENST00000369838 PSMB4P28070 264 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BGRL2-201ENST00000369838 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
SH3BGRL2-201ENST00000369838 LSP1P33241 339 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BGRL2-201ENST00000369838 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP12.26□□□□□ -0.45
SH3BGRL2-201ENST00000369838 ANKS6Q68DC2 871 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BGRL2-201ENST00000369838 KCNV2Q8TDN2 545 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BGRL2-201ENST00000369838 ELMO1Q92556 727 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BGRL2-201ENST00000369838 NRBF2Q96F24 287 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BGRL2-201ENST00000369838 ABCG8Q9H221 673 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BGRL2-201ENST00000369838 MANSC1Q9H8J5 431 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BGRL2-201ENST00000369838 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP12.26□□□□□ -0.45
SH3BGRL2-201ENST00000369838 NDE1Q9NXR1 346 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BGRL2-201ENST00000369838 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP12.26□□□□□ -0.456e-8■■□□□ 13.9
SH3BGRL2-201ENST00000369838 KLHL3Q9UH77 587 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BGRL2-201ENST00000369838 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
SH3BGRL2-201ENST00000369838 PTPRJQ12913 1337 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BGRL2-201ENST00000369838 PER2O15055 1255 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BGRL2-201ENST00000369838 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP12.26□□□□□ -0.45
SH3BGRL2-201ENST00000369838 GJA1P17302 382 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BGRL2-201ENST00000369838 ICAM3P32942 547 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BGRL2-201ENST00000369838 NR2C2P49116 596 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BGRL2-201ENST00000369838 CCNG1P51959 295 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BGRL2-201ENST00000369838 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP12.26□□□□□ -0.45
SH3BGRL2-201ENST00000369838 RABGGTBP53611 331 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BGRL2-201ENST00000369838 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP12.26□□□□□ -0.45
SH3BGRL2-201ENST00000369838 PGS1Q32NB8 556 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BGRL2-201ENST00000369838 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BGRL2-201ENST00000369838 RASAL3Q86YV0 1011 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BGRL2-201ENST00000369838 OR52K1Q8NGK4 314 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BGRL2-201ENST00000369838 OR14C36Q8NHC7 312 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BGRL2-201ENST00000369838 DTX3LQ8TDB6 740 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BGRL2-201ENST00000369838 OR8D1Q8WZ84 308 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BGRL2-201ENST00000369838 FAM162AQ96A26 154 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BGRL2-201ENST00000369838 ERP27Q96DN0 273 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BGRL2-201ENST00000369838 LGMNQ99538 433 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BGRL2-201ENST00000369838 THTPAQ9BU02 230 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BGRL2-201ENST00000369838 ACAT2Q9BWD1 397 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BGRL2-201ENST00000369838 PRKD2Q9BZL6 878 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BGRL2-201ENST00000369838 PARVBQ9HBI1 364 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BGRL2-201ENST00000369838 GDF3Q9NR23 364 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BGRL2-201ENST00000369838 CHST7Q9NS84 486 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BGRL2-201ENST00000369838 RNF186Q9NXI6 227 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BGRL2-201ENST00000369838 SNX5Q9Y5X3 404 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BGRL2-201ENST00000369838 MYH10P35580 1976 aa12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35 ms