RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368916.1

GABPB2-201, Transcript of GA binding protein transcription factor subunit beta 2, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene GABPB2, Length 1,680 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB2-201ENST00000368916 TM4SF1P30408 202 aa7.58□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 MAGEA12P43365 314 aa7.58□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 HLCSP50747 726 aa7.58□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 BMXP51813 675 aa7.58□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 NDST2P52849 883 aa7.58□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 THOP1P52888 689 aa7.58□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 GDF10P55107 478 aa7.58□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 CDKL1Q00532 357 aa7.58□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 CDC20Q12834 499 aa7.58□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 MERTKQ12866 999 aa7.58□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 IKQ13123 557 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 PHKG1Q16816 387 aa7.58□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 SLC36A3Q495N2 470 aa7.58□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 C6orf10Q5SRN2 563 aa7.58□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa7.58□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 ATAD3BQ5T9A4 648 aa7.58□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 MROH9Q5TGP6 573 aa7.58□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa7.58□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 FAM45BPQ6NSW5 357 aa7.58□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 NANOGP8Q6NSW7 305 aa7.58□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 TATDN1Q6P1N9 297 aa7.58□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 SLC2A7Q6PXP3 512 aa7.58□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 UNC5AQ6ZN44 842 aa7.58□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa7.58□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 ITIH5Q86UX2 942 aa7.58□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 LACC1Q8IV20 430 aa7.58□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 PIK3C3Q8NEB9 887 aa7.58□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 FAM45AQ8TCE6 357 aa7.58□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 CHAC2Q8WUX2 184 aa7.58□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 AFG1LQ8WV93 481 aa7.58□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 CCDC126Q96EE4 140 aa7.58□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 IL22Q9GZX6 179 aa7.58□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 COA1Q9GZY4 146 aa7.58□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 LRRC4Q9HBW1 653 aa7.58□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 VTA1Q9NP79 307 aa7.58□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 DIABLOQ9NR28 239 aa7.58□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 GMIPQ9P107 970 aa7.58□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 KLHL3Q9UH77 587 aa7.58□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 CCPG1Q9ULG6 757 aa7.58□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 CARD8Q9Y2G2 431 aa7.58□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa7.58□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa7.57□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 H7C0C1 242 aa7.57□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 CYB561D2O14569 222 aa7.57□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 SLC16A4O15374 487 aa7.57□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 LRCH4O75427 683 aa7.57□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 KATNA1O75449 491 aa7.57□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 ERBB2P04626 1255 aa7.57□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 GPIP06744 558 aa7.57□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 POLBP06746 335 aa7.57□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 PGAM1P18669 254 aa7.57□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 FASP25445 335 aa7.57□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 NPTX2P47972 431 aa7.57□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 ATP5OP48047 213 aa7.57□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 ATP4BP51164 291 aa7.57□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 GTF2IP78347 998 aa7.57□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 GHRHRQ02643 423 aa7.57□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 NIPAL4Q0D2K0 466 aa7.57□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 GALNT2Q10471 571 aa7.57□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 NFATC3Q12968 1075 aa7.57□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 SEMA5AQ13591 1074 aa7.57□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 PDK1Q15118 436 aa7.57□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 VPS72Q15906 364 aa7.57□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa7.57□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 SPANXN3Q5MJ09 141 aa7.57□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 TUBA3EQ6PEY2 450 aa7.57□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 TTC23LQ6PF05 361 aa7.57□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 ARMCX6Q7L4S7 300 aa7.57□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 ERMP1Q7Z2K6 904 aa7.57□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa7.57□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 TXNRD3Q86VQ6 643 aa7.57□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 SNX32Q86XE0 403 aa7.57□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 LRRC49Q8IUZ0 686 aa7.57□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 IGDCC3Q8IVU1 814 aa7.57□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 C10orf107Q8IVU9 208 aa7.57□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 LILRA2Q8N149 483 aa7.57□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 SFRP1Q8N474 314 aa7.57□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 FAM47BQ8NA70 645 aa7.57□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 ANKRD52Q8NB46 1076 aa7.57□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 PRR7Q8TB68 274 aa7.57□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 SLC7A14Q8TBB6 771 aa7.57□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 CALML6Q8TD86 181 aa7.57□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms