RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362817.1

RNU1-38P-201, Transcript of RNA, U1 small nuclear 38, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU1-38P, Length 144 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU1-38P-201ENST00000362817 LCLAT1Q6UWP7 414 aa7.82□□□□□ -1.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 BHLHA9Q7RTU4 235 aa7.82□□□□□ -1.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 SCD5Q86SK9 330 aa7.82□□□□□ -1.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 PIGZQ86VD9 579 aa7.82□□□□□ -1.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 YAF2Q8IY57 180 aa7.82□□□□□ -1.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 AOPEPQ8N6M6 819 aa7.82□□□□□ -1.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 TMEM105Q8N8V8 129 aa7.82□□□□□ -1.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 TMEM52Q8NDY8 209 aa7.82□□□□□ -1.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 NUP43Q8NFH3 380 aa7.82□□□□□ -1.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 UBA3Q8TBC4 463 aa7.82□□□□□ -1.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 SH3RF2Q8TEC5 729 aa7.82□□□□□ -1.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 FAM81BQ96LP2 452 aa7.82□□□□□ -1.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 PTCHD1Q96NR3 888 aa7.82□□□□□ -1.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 BPIFA3Q9BQP9 254 aa7.82□□□□□ -1.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 PLCD4Q9BRC7 762 aa7.82□□□□□ -1.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 VPS16Q9H269 839 aa7.82□□□□□ -1.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 MFSD1Q9H3U5 465 aa7.82□□□□□ -1.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 TBC1D17Q9HA65 648 aa7.82□□□□□ -1.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 KIF9Q9HAQ2 790 aa7.82□□□□□ -1.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 NMUR1Q9HB89 426 aa7.82□□□□□ -1.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 ACP6Q9NPH0 428 aa7.82□□□□□ -1.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 IGSF5Q9NSI5 407 aa7.82□□□□□ -1.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa7.82□□□□□ -1.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP7.82□□□□□ -1.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 KANSL1LA0AUZ9 987 aa7.81□□□□□ -1.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 SYCE3A1L190 88 aa7.81□□□□□ -1.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 TCAF2A6NFQ2 919 aa7.81□□□□□ -1.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 PES1O00541 588 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 AURKAO14965 403 aa7.81□□□□□ -1.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 TBX18O95935 607 aa7.81□□□□□ -1.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 KRT5P13647 590 aa7.81□□□□□ -1.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 CD72P21854 359 aa7.81□□□□□ -1.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 KLK7P49862 253 aa7.81□□□□□ -1.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 TUBP50607 506 aa7.81□□□□□ -1.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 PDE6CP51160 858 aa7.81□□□□□ -1.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 CLCN5P51795 746 aa7.81□□□□□ -1.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 COPB1P53618 953 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 MTF1Q14872 753 aa7.81□□□□□ -1.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 FXNQ16595 210 aa7.81□□□□□ -1.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 ARHGAP44Q17R89 818 aa7.81□□□□□ -1.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 HECTD3Q5T447 861 aa7.81□□□□□ -1.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa7.81□□□□□ -1.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 TRIM68Q6AZZ1 485 aa7.81□□□□□ -1.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 TPRG1Q6ZUI0 275 aa7.81□□□□□ -1.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 CCDC186Q7Z3E2 898 aa7.81□□□□□ -1.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 PJA1Q8NG27 643 aa7.81□□□□□ -1.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 TTC8Q8TAM2 541 aa7.81□□□□□ -1.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 SLC35F5Q8WV83 523 aa7.81□□□□□ -1.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 SHC3Q92529 594 aa7.81□□□□□ -1.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 JMJD8Q96S16 334 aa7.81□□□□□ -1.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 HPS4Q9NQG7 708 aa7.81□□□□□ -1.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 GKN1Q9NS71 199 aa7.81□□□□□ -1.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 GTSE1Q9NYZ3 720 aa7.81□□□□□ -1.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 HESX1Q9UBX0 185 aa7.81□□□□□ -1.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 SUSD2Q9UGT4 822 aa7.81□□□□□ -1.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 DNAJC12Q9UKB3 198 aa7.81□□□□□ -1.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 CPQQ9Y646 472 aa7.81□□□□□ -1.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 M0QYV0 167 aa7.8□□□□□ -1.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 TLR5O60602 858 aa7.8□□□□□ -1.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 DCNP07585 359 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 SETSIPP0DME0 302 aa7.8□□□□□ -1.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 RARGP13631 454 aa7.8□□□□□ -1.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 ATP1A3P13637 1013 aa7.8□□□□□ -1.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 GLULP15104 373 aa7.8□□□□□ -1.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 IFNGR1P15260 489 aa7.8□□□□□ -1.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 ARSAP15289 507 aa7.8□□□□□ -1.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 PTMSP20962 102 aa7.8□□□□□ -1.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 USP8P40818 1118 aa7.8□□□□□ -1.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 GPD2P43304 727 aa7.8□□□□□ -1.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 RGS7P49802 495 aa7.8□□□□□ -1.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 SEPHS1P49903 392 aa7.8□□□□□ -1.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 TKTL1P51854 596 aa7.8□□□□□ -1.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 SLC8A3P57103 927 aa7.8□□□□□ -1.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 YBX1P67809 324 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 FZD5Q13467 585 aa7.8□□□□□ -1.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 RUNX3Q13761 415 aa7.8□□□□□ -1.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 IQCB1Q15051 598 aa7.8□□□□□ -1.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 STILQ15468 1287 aa7.8□□□□□ -1.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa7.8□□□□□ -1.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 PM20D1Q6GTS8 502 aa7.8□□□□□ -1.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 PMF1Q6P1K2 205 aa7.8□□□□□ -1.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 DENND1BQ6P3S1 775 aa7.8□□□□□ -1.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZNF852Q6ZMS4 543 aa7.8□□□□□ -1.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa7.8□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms