RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359863.8

TRRAP-202, Transcript of transformation/transcription domain associated protein, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRRAP, Length 12,677 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRRAP-202ENST00000359863 NAMPTP43490 491 aa7.4□□□□□ -1.23
TRRAP-202ENST00000359863 ARFIP1P53367 373 aa7.4□□□□□ -1.23
TRRAP-202ENST00000359863 SMTNL2Q2TAL5 461 aa7.4□□□□□ -1.23
TRRAP-202ENST00000359863 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.23
TRRAP-202ENST00000359863 IL31Q6EBC2 164 aa7.4□□□□□ -1.23
TRRAP-202ENST00000359863 SFRP1Q8N474 314 aa7.4□□□□□ -1.23
TRRAP-202ENST00000359863 EMC1Q8N766 993 aa7.4□□□□□ -1.23
TRRAP-202ENST00000359863 MKL1Q969V6 931 aa7.4□□□□□ -1.23
TRRAP-202ENST00000359863 TMEM79Q9BSE2 394 aa7.4□□□□□ -1.23
TRRAP-202ENST00000359863 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP7.4□□□□□ -1.23
TRRAP-202ENST00000359863 TRPS1Q9UHF7 1281 aa7.4□□□□□ -1.23
TRRAP-202ENST00000359863 THRBP10828 461 aa7.4□□□□□ -1.23
TRRAP-202ENST00000359863 TSHRP16473 764 aa7.4□□□□□ -1.23
TRRAP-202ENST00000359863 CYP2B6P20813 491 aa7.4□□□□□ -1.23
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TRRAP-202ENST00000359863 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.23
TRRAP-202ENST00000359863 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa7.4□□□□□ -1.23
TRRAP-202ENST00000359863 ACMSDQ8TDX5 336 aa7.4□□□□□ -1.23
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TRRAP-202ENST00000359863 DYRK1BQ9Y463 629 aa7.4□□□□□ -1.23
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TRRAP-202ENST00000359863 HIST1H2ABP04908 130 aa7.39□□□□□ -1.23
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TRRAP-202ENST00000359863 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa7.39□□□□□ -1.23
TRRAP-202ENST00000359863 FAM81AQ8TBF8 368 aa7.39□□□□□ -1.23
TRRAP-202ENST00000359863 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
TRRAP-202ENST00000359863 HIST1H2ACQ93077 130 aa7.39□□□□□ -1.23
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TRRAP-202ENST00000359863 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
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TRRAP-202ENST00000359863 PACS1Q6VY07 963 aa7.39□□□□□ -1.23
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TRRAP-202ENST00000359863 IFNGP01579 166 aa7.39□□□□□ -1.23
TRRAP-202ENST00000359863 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
TRRAP-202ENST00000359863 THPOP40225 353 aa7.39□□□□□ -1.23
TRRAP-202ENST00000359863 SLC26A3P40879 764 aa7.39□□□□□ -1.23
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TRRAP-202ENST00000359863 CHID1Q9BWS9 393 aa7.39□□□□□ -1.23
TRRAP-202ENST00000359863 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
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TRRAP-202ENST00000359863 PLET1Q6UQ28 207 aa7.39□□□□□ -1.23
TRRAP-202ENST00000359863 PAMR1Q6UXH9 720 aa7.39□□□□□ -1.23
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TRRAP-202ENST00000359863 CAVIN3Q969G5 261 aa7.39□□□□□ -1.23
TRRAP-202ENST00000359863 SENP2Q9HC62 589 aa7.39□□□□□ -1.23
TRRAP-202ENST00000359863 CCNB2O95067 398 aa7.39□□□□□ -1.23
TRRAP-202ENST00000359863 CTDNEP1O95476 244 aa7.39□□□□□ -1.23
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TRRAP-202ENST00000359863 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
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TRRAP-202ENST00000359863 PNPLA8Q9NP80 782 aa7.39□□□□□ -1.23
TRRAP-202ENST00000359863 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa7.39□□□□□ -1.23
TRRAP-202ENST00000359863 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
TRRAP-202ENST00000359863 BBIP1A8MTZ0 92 aa7.39□□□□□ -1.23
TRRAP-202ENST00000359863 EPN2O95208 641 aa7.39□□□□□ -1.23
TRRAP-202ENST00000359863 GEMP55040 296 aa7.39□□□□□ -1.23
TRRAP-202ENST00000359863 TGFB2P61812 414 aa7.39□□□□□ -1.23
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