RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356331.9

SH3BP2-201, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 9,211 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-201ENST00000356331 C12orf56Q8IXR9 622 aa10.79□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 PEX5LQ8IYB4 626 aa10.79□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF671Q8TAW3 534 aa10.79□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP10.79□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP10.79□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 APOL5Q9BWW9 433 aa10.79□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 MEMO1Q9Y316 297 aa10.79□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 DISP1Q96F81 1524 aa10.79□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 INPP4BO15327 924 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 MAGEA2P43356 314 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 GSSP48637 474 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 HKDC1Q2TB90 917 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 IL31Q6EBC2 164 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 RIT2Q99578 217 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 IL25Q9H293 177 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 LRIG2O94898 1065 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 TDP2O95551 362 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 SERPINF2P08697 491 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 AMPD2Q01433 879 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 A0A0G2JPF8 293 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 SGTAO43765 313 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 CAPN15O75808 1086 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 ETS1P14921 441 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 DCKP27707 260 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 NMT1P30419 496 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 PGS1Q32NB8 556 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 PYHIN1Q6K0P9 492 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 TRIM2Q9C040 744 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 ROGDIQ9GZN7 287 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 CPVLQ9H3G5 476 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 PIF1Q9H611 641 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 CMTM6Q9NX76 183 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 VANGL2Q9ULK5 521 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 ABCC3O15438 1527 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 QSOX1O00391 747 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 PRMT3O60678 531 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 NPY2RP49146 381 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 ACVR2BQ13705 512 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 AUHQ13825 339 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 IQCKQ8N0W5 287 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 SIN3BO75182 1162 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 ITGAVP06756 1048 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 BNIP1Q12981 228 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 PAGE2BQ5JRK9 111 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 TMEM126BQ8IUX1 230 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 FBXL16Q8N461 479 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 THRSPQ92748 146 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 TAMM41Q96BW9 452 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 TMEM47Q9BQJ4 181 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 DYRK1BQ9Y463 629 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 ERBB2P04626 1255 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 F8A1P23610 371 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 BST2Q10589 180 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 DLG1Q12959 904 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 DGKDQ16760 1214 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 FAM196AQ6ZSG2 479 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF341Q9BYN7 854 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 SPEF1Q9Y4P9 236 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 TULP3O75386 442 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 CYP2A7P20853 494 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 ZBTB6Q15916 424 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 DDI2Q5TDH0 399 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 CRYL1Q9Y2S2 319 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 AGRPO00253 132 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 KPNA6O60684 536 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 CDH17Q12864 832 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 TCEA2Q15560 299 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 SWI5Q1ZZU3 235 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 AGKQ53H12 422 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 NT5DC3Q86UY8 548 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 CD101Q93033 1021 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 KIF12Q96FN5 646 aa10.77□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 TMEM2Q9UHN6 1383 aa10.77□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 GSC2O15499 205 aa10.77□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms