RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348333.7

TNFRSF25-201, Transcript of TNF receptor superfamily member 25, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TNFRSF25, Length 1,119 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF25-201ENST00000348333 OR7D4Q8NG98 312 aa23.33■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 OSGEPQ9NPF4 335 aa23.33■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 TM7SF3Q9NS93 570 aa23.33■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 VPS51Q9UID3 782 aa23.33■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa23.33■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa23.33■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa23.32■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 RNF103O00237 685 aa23.32■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 BNIP3LO60238 219 aa23.32■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 SRGAP2O75044 1071 aa23.32■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 KRT37O76014 449 aa23.32■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 CER1O95813 267 aa23.32■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 WNT1P04628 370 aa23.32■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 C1QTNF9P0C862 333 aa23.32■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 SRCP12931 536 aa23.32■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 UNGP13051 313 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 GOT1P17174 413 aa23.32■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 GRIA4P48058 902 aa23.32■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 VASPP50552 380 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 ST3GAL2Q16842 350 aa23.32■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 CCDC14Q49A88 953 aa23.32■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 LINGO4Q6UY18 593 aa23.32■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 NEK11Q8NG66 645 aa23.32■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 OR2T34Q8NGX1 318 aa23.32■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 OR14C36Q8NHC7 312 aa23.32■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 RXFP2Q8WXD0 754 aa23.32■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 C1orf74Q96LT6 269 aa23.32■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 A0A1W2PPC4 97 aa23.31■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 CBFA2T3O75081 653 aa23.31■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 RTN2O75298 545 aa23.31■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 ENDOD1O94919 500 aa23.31■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 MBD3O95983 291 aa23.31■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 RRM1P23921 792 aa23.31■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 ARCQ7LC44 396 aa23.31■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 OR8D1Q8WZ84 308 aa23.31■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 ERGIC2Q96RQ1 377 aa23.31■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 KLK13Q9UKR3 277 aa23.31■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa23.31■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 HS3ST2Q9Y278 367 aa23.31■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 BTBD3Q9Y2F9 522 aa23.31■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa23.3■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 LRRC10BA6NIK2 292 aa23.3■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 LRRC72A6NJI9 287 aa23.3■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 C2CD4BA6NLJ0 364 aa23.3■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 H0Y8X5 98 aa23.3■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 CTSLP07711 333 aa23.3■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 IL9RQ01113 521 aa23.3■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa23.3■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 IL27RAQ6UWB1 636 aa23.3■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 LRRC31Q6UY01 552 aa23.3■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa23.3■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 FAM131CQ96AQ9 280 aa23.3■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 HAPLN3Q96S86 360 aa23.3■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 PPM1HQ9ULR3 514 aa23.3■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa23.3■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 ACTL7AQ9Y615 435 aa23.3■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 TEX33O43247 280 aa23.29■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 ZNF883P0CG24 379 aa23.29■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 OR1E1P30953 314 aa23.29■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 CTSKP43235 329 aa23.29■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 CNTN1Q12860 1018 aa23.29■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 TEAD4Q15561 434 aa23.29■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 ANO6Q4KMQ2 910 aa23.29■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa23.29■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 AGBL4Q5VU57 503 aa23.29■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 TRIM72Q6ZMU5 477 aa23.29■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa23.29■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 PNPLA1Q8N8W4 532 aa23.29■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 DCAF4L2Q8NA75 395 aa23.29■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 ATP11CQ8NB49 1132 aa23.29■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa23.29■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 PPP1R9BQ96SB3 815 aa23.29■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 NDFIP2Q9NV92 336 aa23.29■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 NEU3Q9UQ49 428 aa23.29■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa23.29■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 FAM72CH0Y354 149 aa23.28■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 MCF2LO15068 1137 aa23.28■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 RACK1P63244 317 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 FAM72AQ5TYM5 149 aa23.28■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 FAM72DQ6L9T8 149 aa23.28■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 LRSAM1Q6UWE0 723 aa23.28■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 FAM72BQ86X60 149 aa23.28■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 DRC7Q8IY82 874 aa23.28■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 CCDC185Q8N715 623 aa23.28■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 CHST14Q8NCH0 376 aa23.28■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 OR2A12Q8NGT7 310 aa23.28■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 TNKS2Q9H2K2 1166 aa23.28■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 ADAM22Q9P0K1 906 aa23.28■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 IGF2RP11717 2491 aa23.27■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 ZMPSTE24O75844 475 aa23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.1 ms