RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341935.9

CCR6-201, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 4,018 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-201ENST00000341935 ASIC3Q9UHC3 531 aa6.21□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa6.21□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 CCL16O15467 120 aa6.21□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 SMIM24O75264 130 aa6.21□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 C1RP00736 705 aa6.21□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 OAS1P00973 400 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 ERCC2P18074 760 aa6.21□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 HOXC13P31276 330 aa6.21□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 XRCC4Q13426 336 aa6.21□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP6.21□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 PPM1LQ5SGD2 360 aa6.21□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 MANEALQ5VSG8 457 aa6.21□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 SDE2Q6IQ49 451 aa6.21□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 TMC8Q8IU68 726 aa6.21□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 UNC45BQ8IWX7 931 aa6.21□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 GLIS1Q8NBF1 620 aa6.21□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 CCHCR1Q8TD31 782 aa6.21□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 BTN2A3PQ96KV6 586 aa6.21□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 FERD3LQ96RJ6 166 aa6.21□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 IL21Q9HBE4 155 aa6.21□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 E9PAM4 449 aa6.2□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 MAP3K6O95382 1288 aa6.2□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 FAM153BP0C7A2 387 aa6.2□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa6.2□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 IVDP26440 423 aa6.2□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 EPHB2P29323 1055 aa6.2□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 ADCY8P40145 1251 aa6.2□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 PLEKHG6Q3KR16 790 aa6.2□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 FAM153CQ494X1 144 aa6.2□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 MS4A13Q5J8X5 152 aa6.2□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 CEP128Q6ZU80 1094 aa6.2□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 RTL10Q7L3V2 364 aa6.2□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 FAM71DQ8N9W8 422 aa6.2□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 SLC22A17Q8WUG5 538 aa6.2□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 ART4Q93070 314 aa6.2□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 OLFM3Q96PB7 478 aa6.2□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP6.2□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 LRRC3Q9BY71 257 aa6.2□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 PIF1Q9H611 641 aa6.2□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 CERS4Q9HA82 394 aa6.2□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 MAN1C1Q9NR34 630 aa6.2□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa6.2□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 WHRNQ9P202 907 aa6.2□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 FAM153AQ9UHL3 310 aa6.2□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 MSRAQ9UJ68 235 aa6.2□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 WDR37Q9Y2I8 494 aa6.2□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 RAD54BQ9Y620 910 aa6.2□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 HACD1B0YJ81 288 aa6.2□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 DDX5P17844 614 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 RAB30Q15771 203 aa6.2□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 NUGGCQ68CJ6 796 aa6.2□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 EMBQ6PCB8 327 aa6.2□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 ZDHHC24Q6UX98 284 aa6.2□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 CHPFQ8IZ52 775 aa6.2□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 CCDC33Q8N5R6 958 aa6.2□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 CAVIN3Q969G5 261 aa6.2□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 PLD4Q96BZ4 506 aa6.2□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 TSC22D3Q99576 134 aa6.2□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 DRC3Q9H069 523 aa6.2□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 RNF38Q9H0F5 515 aa6.2□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 PCDH9Q9HC56 1237 aa6.2□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 HELZP42694 1942 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 CHUKO15111 745 aa6.2□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 SUPT3HO75486 399 aa6.2□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 EPCAMP16422 314 aa6.2□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 ITIH2P19823 946 aa6.2□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 RBL1P28749 1068 aa6.2□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 VPS41P49754 854 aa6.2□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 KCNQ1P51787 676 aa6.2□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 PLTPP55058 493 aa6.2□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 P3H1Q32P28 736 aa6.2□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 SLC45A4Q5BKX6 768 aa6.2□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 PPP2R2DQ66LE6 453 aa6.2□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 ZNF683Q8IZ20 524 aa6.2□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 LRRN4Q8WUT4 740 aa6.2□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 RTP4Q96DX8 246 aa6.2□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 FAM129AQ9BZQ8 928 aa6.2□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa6.2□□□□□ -1.42
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