RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000336128.11

ZNF548-201, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene ZNF548, Length 2,115 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-201ENST00000336128 DNAJB2P25686 324 aa12.7□□□□□ -0.38
ZNF548-201ENST00000336128 IL9RQ01113 521 aa12.7□□□□□ -0.38
ZNF548-201ENST00000336128 NIPAL4Q0D2K0 466 aa12.7□□□□□ -0.38
ZNF548-201ENST00000336128 SLC1A5Q15758 541 aa12.7□□□□□ -0.38
ZNF548-201ENST00000336128 ANO4Q32M45 955 aa12.7□□□□□ -0.38
ZNF548-201ENST00000336128 SPANXN3Q5MJ09 141 aa12.7□□□□□ -0.38
ZNF548-201ENST00000336128 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa12.7□□□□□ -0.38
ZNF548-201ENST00000336128 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP12.7□□□□□ -0.38
ZNF548-201ENST00000336128 BANPQ8N9N5 519 aa12.7□□□□□ -0.38
ZNF548-201ENST00000336128 SPATA22Q8NHS9 363 aa12.7□□□□□ -0.38
ZNF548-201ENST00000336128 TTC17Q96AE7 1141 aa12.7□□□□□ -0.38
ZNF548-201ENST00000336128 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
ZNF548-201ENST00000336128 MYEOVQ96EZ4 313 aa12.7□□□□□ -0.38
ZNF548-201ENST00000336128 MYRFLQ96LU7 910 aa12.7□□□□□ -0.38
ZNF548-201ENST00000336128 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
ZNF548-201ENST00000336128 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa12.7□□□□□ -0.38
ZNF548-201ENST00000336128 ZNF212Q9UDV6 495 aa12.7□□□□□ -0.38
ZNF548-201ENST00000336128 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
ZNF548-201ENST00000336128 PRRG1O14668 218 aa12.69□□□□□ -0.38
ZNF548-201ENST00000336128 COCHO43405 550 aa12.69□□□□□ -0.38
ZNF548-201ENST00000336128 ACSL4O60488 711 aa12.69□□□□□ -0.38
ZNF548-201ENST00000336128 ANXA9O76027 345 aa12.69□□□□□ -0.38
ZNF548-201ENST00000336128 NEBLO76041 1014 aa12.69□□□□□ -0.38
ZNF548-201ENST00000336128 PEX11BO96011 259 aa12.69□□□□□ -0.38
ZNF548-201ENST00000336128 NPY2RP49146 381 aa12.69□□□□□ -0.38
ZNF548-201ENST00000336128 SERPINB9P50453 376 aa12.69□□□□□ -0.38
ZNF548-201ENST00000336128 BMPR2Q13873 1038 aa12.69□□□□□ -0.38
ZNF548-201ENST00000336128 VEPH1Q14D04 833 aa12.69□□□□□ -0.38
ZNF548-201ENST00000336128 TAF12Q16514 161 aa12.69□□□□□ -0.38
ZNF548-201ENST00000336128 LGSNQ5TDP6 509 aa12.69□□□□□ -0.38
ZNF548-201ENST00000336128 CES3Q6UWW8 571 aa12.69□□□□□ -0.38
ZNF548-201ENST00000336128 OTOP2Q7RTS6 562 aa12.69□□□□□ -0.38
ZNF548-201ENST00000336128 RASSF3Q86WH2 238 aa12.69□□□□□ -0.38
ZNF548-201ENST00000336128 LGI2Q8N0V4 545 aa12.69□□□□□ -0.38
ZNF548-201ENST00000336128 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP12.69□□□□□ -0.38
ZNF548-201ENST00000336128 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
ZNF548-201ENST00000336128 IL23AQ9NPF7 189 aa12.69□□□□□ -0.38
ZNF548-201ENST00000336128 DOCK4Q8N1I0 1966 aa12.69□□□□□ -0.38
ZNF548-201ENST00000336128 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
ZNF548-201ENST00000336128 F5H5T6 163 aa12.68□□□□□ -0.38
ZNF548-201ENST00000336128 POLBP06746 335 aa12.68□□□□□ -0.38
ZNF548-201ENST00000336128 FOXN2P32314 431 aa12.68□□□□□ -0.38
ZNF548-201ENST00000336128 PPM1AP35813 382 aa12.68□□□□□ -0.38
ZNF548-201ENST00000336128 MAPKAPK2P49137 400 aa12.68□□□□□ -0.38
ZNF548-201ENST00000336128 GEMP55040 296 aa12.68□□□□□ -0.38
ZNF548-201ENST00000336128 SLC18A2Q05940 514 aa12.68□□□□□ -0.38
ZNF548-201ENST00000336128 TWF1Q12792 350 aa12.68□□□□□ -0.38
ZNF548-201ENST00000336128 NAB1Q13506 487 aa12.68□□□□□ -0.38
ZNF548-201ENST00000336128 CERCAMQ5T4B2 595 aa12.68□□□□□ -0.38
ZNF548-201ENST00000336128 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
ZNF548-201ENST00000336128 HHATQ5VTY9 493 aa12.68□□□□□ -0.38
ZNF548-201ENST00000336128 KLHDC10Q6PID8 442 aa12.68□□□□□ -0.38
ZNF548-201ENST00000336128 LINC00523Q86TU6 105 aa12.68□□□□□ -0.38
ZNF548-201ENST00000336128 IPMKQ8NFU5 416 aa12.68□□□□□ -0.38
ZNF548-201ENST00000336128 CDKL2Q92772 493 aa12.68□□□□□ -0.38
ZNF548-201ENST00000336128 FATE1Q969F0 183 aa12.68□□□□□ -0.38
ZNF548-201ENST00000336128 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
ZNF548-201ENST00000336128 APOPT1Q96IL0 206 aa12.68□□□□□ -0.38
ZNF548-201ENST00000336128 SEC16BQ96JE7 1060 aa12.68□□□□□ -0.38
ZNF548-201ENST00000336128 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
ZNF548-201ENST00000336128 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa12.68□□□□□ -0.38
ZNF548-201ENST00000336128 TBL1YQ9BQ87 522 aa12.68□□□□□ -0.38
ZNF548-201ENST00000336128 FICDQ9BVA6 458 aa12.68□□□□□ -0.38
ZNF548-201ENST00000336128 SP110Q9HB58 689 aa12.68□□□□□ -0.38
ZNF548-201ENST00000336128 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
ZNF548-201ENST00000336128 SLC17A6Q9P2U8 582 aa12.68□□□□□ -0.38
ZNF548-201ENST00000336128 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa12.68□□□□□ -0.38
ZNF548-201ENST00000336128 J3KR12 359 aa12.68□□□□□ -0.38
ZNF548-201ENST00000336128 AP3B1O00203 1094 aa12.68□□□□□ -0.38
ZNF548-201ENST00000336128 ATP9BO43861 1147 aa12.68□□□□□ -0.38
ZNF548-201ENST00000336128 RAMP2O60895 175 aa12.68□□□□□ -0.38
ZNF548-201ENST00000336128 KRT38O76015 456 aa12.68□□□□□ -0.38
ZNF548-201ENST00000336128 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
ZNF548-201ENST00000336128 PYGBP11216 843 aa12.68□□□□□ -0.38
ZNF548-201ENST00000336128 TPH1P17752 444 aa12.68□□□□□ -0.38
ZNF548-201ENST00000336128 SLC6A4P31645 630 aa12.68□□□□□ -0.38
ZNF548-201ENST00000336128 ELF1P32519 619 aa12.68□□□□□ -0.38
ZNF548-201ENST00000336128 SLC11A2P49281 568 aa12.68□□□□□ -0.38
ZNF548-201ENST00000336128 NEK3P51956 506 aa12.68□□□□□ -0.38
ZNF548-201ENST00000336128 MGAT5Q09328 741 aa12.68□□□□□ -0.38
ZNF548-201ENST00000336128 CDH17Q12864 832 aa12.68□□□□□ -0.38
ZNF548-201ENST00000336128 C5orf22Q49AR2 442 aa12.68□□□□□ -0.38
ZNF548-201ENST00000336128 LVRNQ6Q4G3 990 aa12.68□□□□□ -0.38
ZNF548-201ENST00000336128 SH2D5Q6ZV89 423 aa12.68□□□□□ -0.38
ZNF548-201ENST00000336128 ZNF354CQ86Y25 554 aa12.68□□□□□ -0.38
ZNF548-201ENST00000336128 TCEAL8Q8IYN2 117 aa12.68□□□□□ -0.38
ZNF548-201ENST00000336128 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa12.68□□□□□ -0.38
ZNF548-201ENST00000336128 PLD4Q96BZ4 506 aa12.68□□□□□ -0.38
ZNF548-201ENST00000336128 MTBPQ96DY7 904 aa12.68□□□□□ -0.38
ZNF548-201ENST00000336128 GRID1Q9ULK0 1009 aa12.68□□□□□ -0.38
ZNF548-201ENST00000336128 ZBBXA8MT70 800 aa12.67□□□□□ -0.38
ZNF548-201ENST00000336128 TM9SF1O15321 606 aa12.67□□□□□ -0.38
ZNF548-201ENST00000336128 LPXNO60711 386 aa12.67□□□□□ -0.38
ZNF548-201ENST00000336128 USP1O94782 785 aa12.67□□□□□ -0.38
ZNF548-201ENST00000336128 TAC1P20366 129 aa12.67□□□□□ -0.38
ZNF548-201ENST00000336128 CCNFP41002 786 aa12.67□□□□□ -0.38
ZNF548-201ENST00000336128 HARS2P49590 506 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
ZNF548-201ENST00000336128 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
ZNF548-201ENST00000336128 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
ZNF548-201ENST00000336128 PARP15Q460N3 678 aa12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms