RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335007.9

PPP1CC-201, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit gamma, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PPP1CC, Length 2,559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CC-201ENST00000335007 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
PPP1CC-201ENST00000335007 TRIM64CA6NLI5 447 aa20.61■□□□□ 0.89
PPP1CC-201ENST00000335007 IL18RAPO95256 599 aa20.61■□□□□ 0.89
PPP1CC-201ENST00000335007 GRIA4P48058 902 aa20.61■□□□□ 0.89
PPP1CC-201ENST00000335007 PSME3P61289 254 aa20.61■□□□□ 0.89
PPP1CC-201ENST00000335007 PFKPQ01813 784 aa20.61■□□□□ 0.89
PPP1CC-201ENST00000335007 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
PPP1CC-201ENST00000335007 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
PPP1CC-201ENST00000335007 MTX3Q5HYI7 312 aa20.61■□□□□ 0.89
PPP1CC-201ENST00000335007 LCLAT1Q6UWP7 414 aa20.61■□□□□ 0.89
PPP1CC-201ENST00000335007 CES3Q6UWW8 571 aa20.61■□□□□ 0.89
PPP1CC-201ENST00000335007 C1orf127Q8N9H9 656 aa20.61■□□□□ 0.89
PPP1CC-201ENST00000335007 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
PPP1CC-201ENST00000335007 EFHD1Q9BUP0 239 aa20.61■□□□□ 0.89
PPP1CC-201ENST00000335007 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
PPP1CC-201ENST00000335007 NRBP2Q9NSY0 501 aa20.61■□□□□ 0.89
PPP1CC-201ENST00000335007 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
PPP1CC-201ENST00000335007 HESX1Q9UBX0 185 aa20.61■□□□□ 0.89
PPP1CC-201ENST00000335007 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
PPP1CC-201ENST00000335007 TSPAN16Q9UKR8 245 aa20.61■□□□□ 0.89
PPP1CC-201ENST00000335007 PSME4Q14997 1843 aa20.6■□□□□ 0.89
PPP1CC-201ENST00000335007 YDJCA8MPS7 323 aa20.6■□□□□ 0.89
PPP1CC-201ENST00000335007 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP20.6■□□□□ 0.893e-9■■□□□ 12.1
PPP1CC-201ENST00000335007 SLC7A1P30825 629 aa20.6■□□□□ 0.89
PPP1CC-201ENST00000335007 CDH15P55291 814 aa20.6■□□□□ 0.89
PPP1CC-201ENST00000335007 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
PPP1CC-201ENST00000335007 MPP3Q13368 585 aa20.6■□□□□ 0.89
PPP1CC-201ENST00000335007 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa20.6■□□□□ 0.89
PPP1CC-201ENST00000335007 HERC6Q8IVU3 1022 aa20.6■□□□□ 0.89
PPP1CC-201ENST00000335007 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
PPP1CC-201ENST00000335007 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
PPP1CC-201ENST00000335007 MARK4Q96L34 752 aa20.6■□□□□ 0.89
PPP1CC-201ENST00000335007 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
PPP1CC-201ENST00000335007 ANLNQ9NQW6 1124 aa20.6■□□□□ 0.89
PPP1CC-201ENST00000335007 ZNF232Q9UNY5 417 aa20.6■□□□□ 0.89
PPP1CC-201ENST00000335007 C2P06681 752 aa20.6■□□□□ 0.89
PPP1CC-201ENST00000335007 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
PPP1CC-201ENST00000335007 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
PPP1CC-201ENST00000335007 ZNF12P17014 697 aa20.6■□□□□ 0.89
PPP1CC-201ENST00000335007 CYP3A5P20815 502 aa20.6■□□□□ 0.89
PPP1CC-201ENST00000335007 SP2Q02086 613 aa20.6■□□□□ 0.89
PPP1CC-201ENST00000335007 GRAMD4Q6IC98 578 aa20.6■□□□□ 0.89
PPP1CC-201ENST00000335007 FAM47BQ8NA70 645 aa20.6■□□□□ 0.89
PPP1CC-201ENST00000335007 TNIP2Q8NFZ5 429 aa20.6■□□□□ 0.89
PPP1CC-201ENST00000335007 CSPG4P5Q96PW8 444 aa20.6■□□□□ 0.89
PPP1CC-201ENST00000335007 SLC29A1Q99808 456 aa20.6■□□□□ 0.89
PPP1CC-201ENST00000335007 CIB1Q99828 191 aa20.6■□□□□ 0.89
PPP1CC-201ENST00000335007 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa20.6■□□□□ 0.89
PPP1CC-201ENST00000335007 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa20.6■□□□□ 0.89
PPP1CC-201ENST00000335007 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
PPP1CC-201ENST00000335007 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
PPP1CC-201ENST00000335007 RGS7P49802 495 aa20.59■□□□□ 0.89
PPP1CC-201ENST00000335007 SLC5A3P53794 718 aa20.59■□□□□ 0.89
PPP1CC-201ENST00000335007 SLC6A3Q01959 620 aa20.59■□□□□ 0.89
PPP1CC-201ENST00000335007 RELAQ04206 551 aa20.59■□□□□ 0.89
PPP1CC-201ENST00000335007 FAM83AQ86UY5 434 aa20.59■□□□□ 0.89
PPP1CC-201ENST00000335007 NLGN1Q8N2Q7 840 aa20.59■□□□□ 0.89
PPP1CC-201ENST00000335007 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP20.59■□□□□ 0.89
PPP1CC-201ENST00000335007 ATG4CQ96DT6 458 aa20.59■□□□□ 0.89
PPP1CC-201ENST00000335007 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa20.59■□□□□ 0.89
PPP1CC-201ENST00000335007 UNC93B1Q9H1C4 597 aa20.59■□□□□ 0.89
PPP1CC-201ENST00000335007 LRRC40Q9H9A6 602 aa20.59■□□□□ 0.89
PPP1CC-201ENST00000335007 CAB39LQ9H9S4 337 aa20.59■□□□□ 0.89
PPP1CC-201ENST00000335007 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
PPP1CC-201ENST00000335007 INIPQ9NRY2 104 aa20.59■□□□□ 0.89
PPP1CC-201ENST00000335007 GGA3Q9NZ52 723 aa20.59■□□□□ 0.89
PPP1CC-201ENST00000335007 AP4E1Q9UPM8 1137 aa20.59■□□□□ 0.89
PPP1CC-201ENST00000335007 PARP14Q460N5 1801 aa20.59■□□□□ 0.89
PPP1CC-201ENST00000335007 TANC1Q9C0D5 1861 aa20.59■□□□□ 0.89
PPP1CC-201ENST00000335007 TIMM44O43615 452 aa20.59■□□□□ 0.89
PPP1CC-201ENST00000335007 MAFO75444 373 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
PPP1CC-201ENST00000335007 ITGB3P05106 788 aa20.59■□□□□ 0.89
PPP1CC-201ENST00000335007 ATICP31939 592 aa20.59■□□□□ 0.89
PPP1CC-201ENST00000335007 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
PPP1CC-201ENST00000335007 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa20.59■□□□□ 0.89
PPP1CC-201ENST00000335007 PBXIP1Q96AQ6 731 aa20.59■□□□□ 0.89
PPP1CC-201ENST00000335007 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
PPP1CC-201ENST00000335007 THAP11Q96EK4 314 aa20.59■□□□□ 0.89
PPP1CC-201ENST00000335007 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
PPP1CC-201ENST00000335007 CLEC11AQ9Y240 323 aa20.59■□□□□ 0.89
PPP1CC-201ENST00000335007 RNF103O00237 685 aa20.58■□□□□ 0.89
PPP1CC-201ENST00000335007 CABYRO75952 493 aa20.58■□□□□ 0.89
PPP1CC-201ENST00000335007 PFKMP08237 780 aa20.58■□□□□ 0.89
PPP1CC-201ENST00000335007 CXCL8P10145 99 aa20.58■□□□□ 0.89
PPP1CC-201ENST00000335007 DLG2Q15700 870 aa20.58■□□□□ 0.89
PPP1CC-201ENST00000335007 KIZQ2M2Z5 673 aa20.58■□□□□ 0.89
PPP1CC-201ENST00000335007 NHSL2Q5HYW2 709 aa20.58■□□□□ 0.89
PPP1CC-201ENST00000335007 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa20.58■□□□□ 0.89
PPP1CC-201ENST00000335007 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
PPP1CC-201ENST00000335007 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
PPP1CC-201ENST00000335007 TSNARE1Q96NA8 513 aa20.58■□□□□ 0.89
PPP1CC-201ENST00000335007 PCDHAC1Q9H158 963 aa20.58■□□□□ 0.89
PPP1CC-201ENST00000335007 HACD3Q9P035 362 aa20.58■□□□□ 0.89
PPP1CC-201ENST00000335007 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa20.58■□□□□ 0.89
PPP1CC-201ENST00000335007 KIAA1257Q9ULG3 409 aa20.58■□□□□ 0.89
PPP1CC-201ENST00000335007 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa20.58■□□□□ 0.88
PPP1CC-201ENST00000335007 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa20.58■□□□□ 0.88
PPP1CC-201ENST00000335007 HEATR9A2RTY3 570 aa20.58■□□□□ 0.88
PPP1CC-201ENST00000335007 NFICP08651 508 aa20.58■□□□□ 0.88
PPP1CC-201ENST00000335007 PSMB4P28070 264 aa20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51 ms