RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328024.10

RAB11B-201, Transcript of RAB11B, member RAS oncogene family, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAB11B, Length 1,751 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11B-201ENST00000328024 CDC23Q9UJX2 597 aa20.64■□□□□ 0.9
RAB11B-201ENST00000328024 PLA2G4CQ9UP65 541 aa20.64■□□□□ 0.9
RAB11B-201ENST00000328024 H3BRJ5 948 aa20.64■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 DCLK1O15075 740 aa20.64■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 SPOPO43791 374 aa20.64■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 ZMPSTE24O75844 475 aa20.64■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 NUBP1P53384 320 aa20.64■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 KRT81Q14533 505 aa20.64■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 ELF2Q15723 593 aa20.64■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 ZNF569Q5MCW4 686 aa20.64■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 LRRC38Q5VT99 294 aa20.64■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 ZNF783Q6ZMS7 281 aa20.64■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 TP53INP2Q8IXH6 220 aa20.64■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa20.64■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 NPWQ8N729 165 aa20.64■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 KCTD6Q8NC69 237 aa20.64■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 HHIPQ96QV1 700 aa20.64■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 SPON2Q9BUD6 331 aa20.64■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 CARD6Q9BX69 1037 aa20.64■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 TSGA10Q9BZW7 698 aa20.64■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 VPS51Q9UID3 782 aa20.64■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 ACTL7AQ9Y615 435 aa20.64■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 DAPK3O43293 454 aa20.63■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 KRT86O43790 486 aa20.63■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 MT-CO1P00395 513 aa20.63■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 ASLP04424 464 aa20.63■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 HOXB2P14652 356 aa20.63■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 KDELR1P24390 212 aa20.63■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 ARL4AP40617 200 aa20.63■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 MARCKSL1P49006 195 aa20.63■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 TCF15Q12870 199 aa20.63■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa20.63■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 EOGTQ5NDL2 527 aa20.63■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 RHOT1Q8IXI2 618 aa20.63■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 KRT35Q92764 455 aa20.63■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 LRRC19Q9H756 370 aa20.63■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa20.63■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 RAMP2O60895 175 aa20.62■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 CD160O95971 181 aa20.62■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 PXNP49023 591 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 ARF5P84085 180 aa20.62■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa20.62■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 LINGO4Q6UY18 593 aa20.62■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa20.62■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 DCAF4L2Q8NA75 395 aa20.62■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 PCDH19Q8TAB3 1148 aa20.62■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 HMCESQ96FZ2 354 aa20.62■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 MAGEH1Q9H213 219 aa20.62■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 ATP13A1Q9HD20 1204 aa20.62■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 OGFRQ9NZT2 677 aa20.62■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 SLC8A2Q9UPR5 921 aa20.62■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 NUP205Q92621 2012 aa20.62■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 TTC34A8MYJ7 566 aa20.62■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 K7ERQ8 282 aa20.62■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 NPC1O15118 1278 aa20.62■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 PALMO75781 387 aa20.62■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 PDK2Q15119 407 aa20.62■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 AFMIDQ63HM1 303 aa20.62■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 FAF2Q96CS3 445 aa20.62■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 CALN1Q9BXU9 219 aa20.62■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 SLC39A8Q9C0K1 460 aa20.62■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa20.62■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 GUCA1BQ9UMX6 200 aa20.62■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 RASA4BC9J798 803 aa20.61■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 CBX4O00257 560 aa20.61■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 RASA4O43374 803 aa20.61■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 TUBBP07437 444 aa20.61■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 SULT2A1Q06520 285 aa20.61■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa20.61■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa20.61■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 IL31Q6EBC2 164 aa20.61■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 SDE2Q6IQ49 451 aa20.61■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 PQLC3Q8N755 202 aa20.61■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 FBXO4Q9UKT5 387 aa20.61■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 LRRD1A4D1F6 860 aa20.6■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 H0Y858 1186 aa20.6■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 ATP8B1O43520 1251 aa20.6■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 EPHX1P07099 455 aa20.6■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 SP9P0CG40 484 aa20.6■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 VAV1P15498 845 aa20.6■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa20.6■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 LEKR1Q6ZMV7 388 aa20.6■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 NT5DC3Q86UY8 548 aa20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23 ms