RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311008.15

SPNS1-201, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 2,208 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-201ENST00000311008 GPAMQ9HCL2 828 aa19.94■□□□□ 0.78
SPNS1-201ENST00000311008 PNPOQ9NVS9 261 aa19.94■□□□□ 0.78
SPNS1-201ENST00000311008 CACNG4Q9UBN1 327 aa19.94■□□□□ 0.78
SPNS1-201ENST00000311008 IGHA2P01877 340 aa19.94■□□□□ 0.78
SPNS1-201ENST00000311008 CYP11A1P05108 521 aa19.94■□□□□ 0.78
SPNS1-201ENST00000311008 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
SPNS1-201ENST00000311008 SKIP12755 728 aa19.94■□□□□ 0.78
SPNS1-201ENST00000311008 SCNN1GP51170 649 aa19.94■□□□□ 0.78
SPNS1-201ENST00000311008 COPAP53621 1224 aa19.94■□□□□ 0.78
SPNS1-201ENST00000311008 SESN3P58005 492 aa19.94■□□□□ 0.78
SPNS1-201ENST00000311008 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
SPNS1-201ENST00000311008 FSCBQ5H9T9 825 aa19.94■□□□□ 0.78
SPNS1-201ENST00000311008 TRIM68Q6AZZ1 485 aa19.94■□□□□ 0.78
SPNS1-201ENST00000311008 TAC4Q86UU9 113 aa19.94■□□□□ 0.78
SPNS1-201ENST00000311008 LZTR1Q8N653 840 aa19.94■□□□□ 0.78
SPNS1-201ENST00000311008 FBXO27Q8NI29 283 aa19.94■□□□□ 0.78
SPNS1-201ENST00000311008 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
SPNS1-201ENST00000311008 NMRAL1Q9HBL8 299 aa19.94■□□□□ 0.78
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF195O14628 629 aa19.93■□□□□ 0.78
SPNS1-201ENST00000311008 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP19.93■□□□□ 0.78
SPNS1-201ENST00000311008 TRIM13O60858 407 aa19.93■□□□□ 0.78
SPNS1-201ENST00000311008 C2P06681 752 aa19.93■□□□□ 0.78
SPNS1-201ENST00000311008 CPOXP36551 454 aa19.93■□□□□ 0.78
SPNS1-201ENST00000311008 POLD2P49005 469 aa19.93■□□□□ 0.78
SPNS1-201ENST00000311008 RAB27AP51159 221 aa19.93■□□□□ 0.78
SPNS1-201ENST00000311008 HK2P52789 917 aa19.93■□□□□ 0.78
SPNS1-201ENST00000311008 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP19.93■□□□□ 0.78
SPNS1-201ENST00000311008 ANO4Q32M45 955 aa19.93■□□□□ 0.78
SPNS1-201ENST00000311008 BRMS1LQ5PSV4 323 aa19.93■□□□□ 0.78
SPNS1-201ENST00000311008 METTL21CQ5VZV1 264 aa19.93■□□□□ 0.78
SPNS1-201ENST00000311008 AGMOQ6ZNB7 445 aa19.93■□□□□ 0.78
SPNS1-201ENST00000311008 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP19.93■□□□□ 0.78
SPNS1-201ENST00000311008 VPS39Q96JC1 886 aa19.93■□□□□ 0.78
SPNS1-201ENST00000311008 TSNARE1Q96NA8 513 aa19.93■□□□□ 0.78
SPNS1-201ENST00000311008 HAPLN3Q96S86 360 aa19.93■□□□□ 0.78
SPNS1-201ENST00000311008 CHRAC1Q9NRG0 131 aa19.93■□□□□ 0.78
SPNS1-201ENST00000311008 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP19.93■□□□□ 0.78
SPNS1-201ENST00000311008 CASTOR2A6NHX0 329 aa19.92■□□□□ 0.78
SPNS1-201ENST00000311008 ANXA9O76027 345 aa19.92■□□□□ 0.78
SPNS1-201ENST00000311008 HSPA4LO95757 839 aa19.92■□□□□ 0.78
SPNS1-201ENST00000311008 PRDX6P30041 224 aa19.92■□□□□ 0.78
SPNS1-201ENST00000311008 AP2B1P63010 937 aa19.92■□□□□ 0.78
SPNS1-201ENST00000311008 UGP2Q16851 508 aa19.92■□□□□ 0.78
SPNS1-201ENST00000311008 CFAP157Q5JU67 520 aa19.92■□□□□ 0.78
SPNS1-201ENST00000311008 MAVSQ7Z434 540 aa19.92■□□□□ 0.78
SPNS1-201ENST00000311008 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP19.92■□□□□ 0.78
SPNS1-201ENST00000311008 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP19.92■□□□□ 0.78
SPNS1-201ENST00000311008 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP19.92■□□□□ 0.78
SPNS1-201ENST00000311008 LPPQ93052 612 aa19.92■□□□□ 0.78
SPNS1-201ENST00000311008 GPR22Q99680 433 aa19.92■□□□□ 0.78
SPNS1-201ENST00000311008 CDH19Q9H159 772 aa19.92■□□□□ 0.78
SPNS1-201ENST00000311008 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP19.92■□□□□ 0.78
SPNS1-201ENST00000311008 SLC7A8Q9UHI5 535 aa19.92■□□□□ 0.78
SPNS1-201ENST00000311008 TLK1Q9UKI8 766 aa19.92■□□□□ 0.78
SPNS1-201ENST00000311008 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP19.92■□□□□ 0.78
SPNS1-201ENST00000311008 LRCH1Q9Y2L9 728 aa19.92■□□□□ 0.78
SPNS1-201ENST00000311008 ARHGEF37A1IGU5 675 aa19.92■□□□□ 0.78
SPNS1-201ENST00000311008 G3V2L1 256 aa19.92■□□□□ 0.78
SPNS1-201ENST00000311008 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP19.92■□□□□ 0.78
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF623O75123 536 aa19.92■□□□□ 0.78
SPNS1-201ENST00000311008 FKBP6O75344 327 aa19.92■□□□□ 0.78
SPNS1-201ENST00000311008 IGLV3-25P01717 112 aa19.92■□□□□ 0.78
SPNS1-201ENST00000311008 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP19.92■□□□□ 0.78
SPNS1-201ENST00000311008 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP19.92■□□□□ 0.78
SPNS1-201ENST00000311008 C1orf146Q5VVC0 180 aa19.92■□□□□ 0.78
SPNS1-201ENST00000311008 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa19.92■□□□□ 0.78
SPNS1-201ENST00000311008 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP19.92■□□□□ 0.78
SPNS1-201ENST00000311008 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa19.92■□□□□ 0.78
SPNS1-201ENST00000311008 RTP3Q9BQQ7 232 aa19.92■□□□□ 0.78
SPNS1-201ENST00000311008 RHOJQ9H4E5 214 aa19.92■□□□□ 0.78
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF358Q9NW07 568 aa19.92■□□□□ 0.78
SPNS1-201ENST00000311008 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa19.92■□□□□ 0.78
SPNS1-201ENST00000311008 MAP3K7O43318 606 aa19.91■□□□□ 0.78
SPNS1-201ENST00000311008 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP19.91■□□□□ 0.78
SPNS1-201ENST00000311008 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP19.91■□□□□ 0.78
SPNS1-201ENST00000311008 PCID2Q5JVF3 399 aa19.91■□□□□ 0.78
SPNS1-201ENST00000311008 TNS4Q8IZW8 715 aa19.91■□□□□ 0.78
SPNS1-201ENST00000311008 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP19.91■□□□□ 0.78
SPNS1-201ENST00000311008 FCRL5Q96RD9 977 aa19.91■□□□□ 0.78
SPNS1-201ENST00000311008 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa19.91■□□□□ 0.78
SPNS1-201ENST00000311008 CHRNA1P02708 482 aa19.91■□□□□ 0.78
SPNS1-201ENST00000311008 COL6A2P12110 1019 aa19.91■□□□□ 0.78
SPNS1-201ENST00000311008 BDNFP23560 247 aa19.91■□□□□ 0.78
SPNS1-201ENST00000311008 ABL2P42684 1182 aa19.91■□□□□ 0.78
SPNS1-201ENST00000311008 GNASQ5JWF2 1037 aa19.91■□□□□ 0.78
SPNS1-201ENST00000311008 AAGABQ6PD74 315 aa19.91■□□□□ 0.78
SPNS1-201ENST00000311008 EPGNQ6UW88 154 aa19.91■□□□□ 0.78
SPNS1-201ENST00000311008 ATPAF2Q8N5M1 289 aa19.91■□□□□ 0.78
SPNS1-201ENST00000311008 DTX3LQ8TDB6 740 aa19.91■□□□□ 0.78
SPNS1-201ENST00000311008 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP19.91■□□□□ 0.78
SPNS1-201ENST00000311008 NRG4Q8WWG1 115 aa19.91■□□□□ 0.78
SPNS1-201ENST00000311008 AZIN2Q96A70 460 aa19.91■□□□□ 0.78
SPNS1-201ENST00000311008 PANX3Q96QZ0 392 aa19.91■□□□□ 0.78
SPNS1-201ENST00000311008 SNX10Q9Y5X0 201 aa19.91■□□□□ 0.78
SPNS1-201ENST00000311008 DOCK3Q8IZD9 2030 aa19.9■□□□□ 0.78
SPNS1-201ENST00000311008 NMBRP28336 390 aa19.9■□□□□ 0.78
SPNS1-201ENST00000311008 ARRB2P32121 409 aa19.9■□□□□ 0.78
SPNS1-201ENST00000311008 CSRP3P50461 194 aa19.9■□□□□ 0.78
SPNS1-201ENST00000311008 KLC1Q07866 573 aa19.9■□□□□ 0.78
SPNS1-201ENST00000311008 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.2 ms