RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297979.9

C9orf3-202, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf3, Length 2,820 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-202ENST00000297979 ZBP1Q9H171 429 aa14.56□□□□□ -0.08
C9orf3-202ENST00000297979 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
C9orf3-202ENST00000297979 INSL5Q9Y5Q6 135 aa14.56□□□□□ -0.08
C9orf3-202ENST00000297979 CACNG3O60359 315 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf3-202ENST00000297979 TACR2P21452 398 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf3-202ENST00000297979 PPP3CCP48454 512 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf3-202ENST00000297979 EPHB3P54753 998 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf3-202ENST00000297979 FPGSQ05932 587 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf3-202ENST00000297979 ANO4Q32M45 955 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf3-202ENST00000297979 OR52K1Q8NGK4 314 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf3-202ENST00000297979 SMC6Q96SB8 1091 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf3-202ENST00000297979 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
C9orf3-202ENST00000297979 NAT9Q9BTE0 207 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf3-202ENST00000297979 LRRC40Q9H9A6 602 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf3-202ENST00000297979 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf3-202ENST00000297979 F5H5T6 163 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf3-202ENST00000297979 PSMD3O43242 534 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf3-202ENST00000297979 LILRB3O75022 631 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf3-202ENST00000297979 LINC00271P0C7V0 271 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf3-202ENST00000297979 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
C9orf3-202ENST00000297979 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
C9orf3-202ENST00000297979 CTSAP10619 480 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf3-202ENST00000297979 PGAM1P18669 254 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf3-202ENST00000297979 HARS2P49590 506 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
C9orf3-202ENST00000297979 SEC24CP53992 1094 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf3-202ENST00000297979 CRADDP78560 199 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf3-202ENST00000297979 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf3-202ENST00000297979 CTAGE3PQ8IX95 158 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf3-202ENST00000297979 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf3-202ENST00000297979 ANKRD42Q8N9B4 389 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf3-202ENST00000297979 ARNTL2Q8WYA1 636 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf3-202ENST00000297979 BADQ92934 168 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf3-202ENST00000297979 PLD4Q96BZ4 506 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf3-202ENST00000297979 HMCESQ96FZ2 354 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf3-202ENST00000297979 ZBED2Q9BTP6 218 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf3-202ENST00000297979 RXFP1Q9HBX9 757 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf3-202ENST00000297979 CASS4Q9NQ75 786 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf3-202ENST00000297979 SYBUQ9NX95 663 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf3-202ENST00000297979 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
C9orf3-202ENST00000297979 ZNF212Q9UDV6 495 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf3-202ENST00000297979 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf3-202ENST00000297979 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa14.54□□□□□ -0.08
C9orf3-202ENST00000297979 GMNCA6NCL1 334 aa14.54□□□□□ -0.08
C9orf3-202ENST00000297979 ANKRD33BA6NCL7 494 aa14.54□□□□□ -0.08
C9orf3-202ENST00000297979 ACSL4O60488 711 aa14.54□□□□□ -0.08
C9orf3-202ENST00000297979 USP12O75317 370 aa14.54□□□□□ -0.08
C9orf3-202ENST00000297979 CA8P35219 290 aa14.54□□□□□ -0.08
C9orf3-202ENST00000297979 SLC11A2P49281 568 aa14.54□□□□□ -0.08
C9orf3-202ENST00000297979 OLIG2Q13516 323 aa14.54□□□□□ -0.08
C9orf3-202ENST00000297979 C16orf87Q6PH81 154 aa14.54□□□□□ -0.08
C9orf3-202ENST00000297979 OTOP3Q7RTS5 596 aa14.54□□□□□ -0.08
C9orf3-202ENST00000297979 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
C9orf3-202ENST00000297979 SLC26A11Q86WA9 606 aa14.54□□□□□ -0.08
C9orf3-202ENST00000297979 LRRC6Q86X45 466 aa14.54□□□□□ -0.08
C9orf3-202ENST00000297979 PPM1NQ8N819 430 aa14.54□□□□□ -0.08
C9orf3-202ENST00000297979 PHC3Q8NDX5 983 aa14.54□□□□□ -0.08
C9orf3-202ENST00000297979 FATE1Q969F0 183 aa14.54□□□□□ -0.08
C9orf3-202ENST00000297979 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
C9orf3-202ENST00000297979 KIF9Q9HAQ2 790 aa14.54□□□□□ -0.08
C9orf3-202ENST00000297979 GLOD4Q9HC38 313 aa14.54□□□□□ -0.08
C9orf3-202ENST00000297979 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa14.54□□□□□ -0.08
C9orf3-202ENST00000297979 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
C9orf3-202ENST00000297979 INSL6Q9Y581 213 aa14.54□□□□□ -0.08
C9orf3-202ENST00000297979 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
C9orf3-202ENST00000297979 NDUFAB1O14561 156 aa14.54□□□□□ -0.08
C9orf3-202ENST00000297979 NEBLO76041 1014 aa14.54□□□□□ -0.08
C9orf3-202ENST00000297979 MAPKAPK2P49137 400 aa14.54□□□□□ -0.08
C9orf3-202ENST00000297979 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa14.54□□□□□ -0.08
C9orf3-202ENST00000297979 CYS1Q717R9 158 aa14.54□□□□□ -0.08
C9orf3-202ENST00000297979 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
C9orf3-202ENST00000297979 LGI2Q8N0V4 545 aa14.54□□□□□ -0.08
C9orf3-202ENST00000297979 DNAAF3Q8N9W5 541 aa14.54□□□□□ -0.08
C9orf3-202ENST00000297979 MGARPQ8TDB4 240 aa14.54□□□□□ -0.08
C9orf3-202ENST00000297979 MZB1Q8WU39 189 aa14.54□□□□□ -0.08
C9orf3-202ENST00000297979 PSMG2Q969U7 264 aa14.54□□□□□ -0.08
C9orf3-202ENST00000297979 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
C9orf3-202ENST00000297979 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa14.54□□□□□ -0.08
C9orf3-202ENST00000297979 FCRL5Q96RD9 977 aa14.54□□□□□ -0.08
C9orf3-202ENST00000297979 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP14.54□□□□□ -0.081e-10■■■□□ 17.4
C9orf3-202ENST00000297979 SAMD15Q9P1V8 674 aa14.54□□□□□ -0.08
C9orf3-202ENST00000297979 A0A1W2PPM1 405 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf3-202ENST00000297979 FAM47DPA6NHR8 397 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf3-202ENST00000297979 FAM159BA6NKW6 160 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf3-202ENST00000297979 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
C9orf3-202ENST00000297979 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP14.53□□□□□ -0.082e-7■■■■□ 25.5
C9orf3-202ENST00000297979 OAS1P00973 400 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
C9orf3-202ENST00000297979 HLA-DQB2P05538 268 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf3-202ENST00000297979 MPP2Q14168 576 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf3-202ENST00000297979 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
C9orf3-202ENST00000297979 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
C9orf3-202ENST00000297979 MYEOVQ96EZ4 313 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf3-202ENST00000297979 CCDC134Q9H6E4 229 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf3-202ENST00000297979 SMYD2Q9NRG4 433 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf3-202ENST00000297979 UBP1Q9NZI7 540 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf3-202ENST00000297979 BFARQ9NZS9 450 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf3-202ENST00000297979 SUN2Q9UH99 717 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf3-202ENST00000297979 ZNF180Q9UJW8 692 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf3-202ENST00000297979 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
C9orf3-202ENST00000297979 RAMP2O60895 175 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf3-202ENST00000297979 ANXA9O76027 345 aa14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.6 ms