RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297316.4

SOX17-201, Transcript of SRY-box 17, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SOX17, Length 2,342 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX17-201ENST00000297316 OAS1P00973 400 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
SOX17-201ENST00000297316 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
SOX17-201ENST00000297316 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP21.8■■□□□ 1.08
SOX17-201ENST00000297316 CASC4Q6P4E1 433 aa21.8■■□□□ 1.08
SOX17-201ENST00000297316 C7orf61Q8IZ16 206 aa21.8■■□□□ 1.08
SOX17-201ENST00000297316 CCDC197Q8NCU1 140 aa21.8■■□□□ 1.08
SOX17-201ENST00000297316 NACA2Q9H009 215 aa21.8■■□□□ 1.08
SOX17-201ENST00000297316 RNF38Q9H0F5 515 aa21.8■■□□□ 1.08
SOX17-201ENST00000297316 GKN1Q9NS71 199 aa21.8■■□□□ 1.08
SOX17-201ENST00000297316 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
SOX17-201ENST00000297316 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa21.8■■□□□ 1.08
SOX17-201ENST00000297316 SNX3O60493 162 aa21.8■■□□□ 1.08
SOX17-201ENST00000297316 MAFKO60675 156 aa21.8■■□□□ 1.08
SOX17-201ENST00000297316 MT-ND3P03897 115 aa21.8■■□□□ 1.08
SOX17-201ENST00000297316 CNPP09543 421 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
SOX17-201ENST00000297316 NFKB1P19838 968 aa21.8■■□□□ 1.08
SOX17-201ENST00000297316 BMPR2Q13873 1038 aa21.8■■□□□ 1.08
SOX17-201ENST00000297316 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
SOX17-201ENST00000297316 TAF12Q16514 161 aa21.8■■□□□ 1.08
SOX17-201ENST00000297316 TEX44Q53QW1 395 aa21.8■■□□□ 1.08
SOX17-201ENST00000297316 STEAP4Q687X5 459 aa21.8■■□□□ 1.08
SOX17-201ENST00000297316 LVRNQ6Q4G3 990 aa21.8■■□□□ 1.08
SOX17-201ENST00000297316 ATPAF2Q8N5M1 289 aa21.8■■□□□ 1.08
SOX17-201ENST00000297316 CNTD1Q8N815 330 aa21.8■■□□□ 1.08
SOX17-201ENST00000297316 OR52K1Q8NGK4 314 aa21.8■■□□□ 1.08
SOX17-201ENST00000297316 TCP10LQ8TDR4 215 aa21.8■■□□□ 1.08
SOX17-201ENST00000297316 ZBP1Q9H171 429 aa21.8■■□□□ 1.08
SOX17-201ENST00000297316 MOCS1Q9NZB8 636 aa21.8■■□□□ 1.08
SOX17-201ENST00000297316 UBP1Q9NZI7 540 aa21.8■■□□□ 1.08
SOX17-201ENST00000297316 DNMT3LQ9UJW3 386 aa21.8■■□□□ 1.08
SOX17-201ENST00000297316 SDR42E2A6NKP2 422 aa21.79■■□□□ 1.08
SOX17-201ENST00000297316 GSTA2P09210 222 aa21.79■■□□□ 1.08
SOX17-201ENST00000297316 ADRA1DP25100 572 aa21.79■■□□□ 1.08
SOX17-201ENST00000297316 PPM1AP35813 382 aa21.79■■□□□ 1.08
SOX17-201ENST00000297316 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
SOX17-201ENST00000297316 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
SOX17-201ENST00000297316 SPRED2Q7Z698 418 aa21.79■■□□□ 1.08
SOX17-201ENST00000297316 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
SOX17-201ENST00000297316 BRD8Q9H0E9 1235 aa21.79■■□□□ 1.08
SOX17-201ENST00000297316 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
SOX17-201ENST00000297316 GBA3Q9H227 469 aa21.79■■□□□ 1.08
SOX17-201ENST00000297316 SAMD15Q9P1V8 674 aa21.79■■□□□ 1.08
SOX17-201ENST00000297316 INSL5Q9Y5Q6 135 aa21.79■■□□□ 1.08
SOX17-201ENST00000297316 TRIM49D1C9J1S8 452 aa21.79■■□□□ 1.08
SOX17-201ENST00000297316 PYGBP11216 843 aa21.79■■□□□ 1.08
SOX17-201ENST00000297316 ELF1P32519 619 aa21.79■■□□□ 1.08
SOX17-201ENST00000297316 HTR7P34969 479 aa21.79■■□□□ 1.08
SOX17-201ENST00000297316 HECTD3Q5T447 861 aa21.79■■□□□ 1.08
SOX17-201ENST00000297316 RFWD3Q6PCD5 774 aa21.79■■□□□ 1.08
SOX17-201ENST00000297316 OTOP3Q7RTS5 596 aa21.79■■□□□ 1.08
SOX17-201ENST00000297316 CHSY1Q86X52 802 aa21.79■■□□□ 1.08
SOX17-201ENST00000297316 WBP2Q969T9 261 aa21.79■■□□□ 1.08
SOX17-201ENST00000297316 ZYG11BQ9C0D3 744 aa21.79■■□□□ 1.08
SOX17-201ENST00000297316 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
SOX17-201ENST00000297316 HMX2A2RU54 273 aa21.78■■□□□ 1.08
SOX17-201ENST00000297316 KIAA0754O94854 1291 aa21.78■■□□□ 1.08
SOX17-201ENST00000297316 RING1Q06587 406 aa21.78■■□□□ 1.08
SOX17-201ENST00000297316 SNX30Q5VWJ9 437 aa21.78■■□□□ 1.08
SOX17-201ENST00000297316 AFMIDQ63HM1 303 aa21.78■■□□□ 1.08
SOX17-201ENST00000297316 KCTD11Q693B1 232 aa21.78■■□□□ 1.08
SOX17-201ENST00000297316 CES3Q6UWW8 571 aa21.78■■□□□ 1.08
SOX17-201ENST00000297316 FAM47EQ6ZV65 393 aa21.78■■□□□ 1.08
SOX17-201ENST00000297316 TMEM150AQ86TG1 271 aa21.78■■□□□ 1.08
SOX17-201ENST00000297316 CFAP52Q8N1V2 620 aa21.78■■□□□ 1.08
SOX17-201ENST00000297316 MYRFLQ96LU7 910 aa21.78■■□□□ 1.08
SOX17-201ENST00000297316 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
SOX17-201ENST00000297316 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
SOX17-201ENST00000297316 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa21.78■■□□□ 1.08
SOX17-201ENST00000297316 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa21.78■■□□□ 1.08
SOX17-201ENST00000297316 HSFX1Q9UBD0 423 aa21.78■■□□□ 1.08
SOX17-201ENST00000297316 OBSL1O75147 1896 aa21.78■■□□□ 1.08
SOX17-201ENST00000297316 AP2A1O95782 977 aa21.78■■□□□ 1.08
SOX17-201ENST00000297316 SLC6A4P31645 630 aa21.78■■□□□ 1.08
SOX17-201ENST00000297316 DNAJC3Q13217 504 aa21.78■■□□□ 1.08
SOX17-201ENST00000297316 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
SOX17-201ENST00000297316 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
SOX17-201ENST00000297316 PDZD8Q8NEN9 1154 aa21.78■■□□□ 1.08
SOX17-201ENST00000297316 TEKT5Q96M29 485 aa21.78■■□□□ 1.08
SOX17-201ENST00000297316 ZNF180Q9UJW8 692 aa21.78■■□□□ 1.08
SOX17-201ENST00000297316 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa21.77■■□□□ 1.08
SOX17-201ENST00000297316 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
SOX17-201ENST00000297316 TGM5O43548 720 aa21.77■■□□□ 1.08
SOX17-201ENST00000297316 CCNB1P14635 433 aa21.77■■□□□ 1.08
SOX17-201ENST00000297316 SLC18A2Q05940 514 aa21.77■■□□□ 1.08
SOX17-201ENST00000297316 TCEAL8Q8IYN2 117 aa21.77■■□□□ 1.08
SOX17-201ENST00000297316 LZTR1Q8N653 840 aa21.77■■□□□ 1.08
SOX17-201ENST00000297316 HMCESQ96FZ2 354 aa21.77■■□□□ 1.08
SOX17-201ENST00000297316 CEP295NLQ96MC4 621 aa21.77■■□□□ 1.08
SOX17-201ENST00000297316 TSGA13Q96PP4 275 aa21.77■■□□□ 1.08
SOX17-201ENST00000297316 CYP2S1Q96SQ9 504 aa21.77■■□□□ 1.08
SOX17-201ENST00000297316 APOL2Q9BQE5 337 aa21.77■■□□□ 1.08
SOX17-201ENST00000297316 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa21.77■■□□□ 1.08
SOX17-201ENST00000297316 INSL6Q9Y581 213 aa21.77■■□□□ 1.08
SOX17-201ENST00000297316 CHD9Q3L8U1 2897 aa21.77■■□□□ 1.07
SOX17-201ENST00000297316 ARHGAP42A6NI28 874 aa21.77■■□□□ 1.07
SOX17-201ENST00000297316 WASH4PA8MWX3 477 aa21.77■■□□□ 1.07
SOX17-201ENST00000297316 ALDH1A2O94788 518 aa21.77■■□□□ 1.07
SOX17-201ENST00000297316 SUN1O94901 812 aa21.77■■□□□ 1.07
SOX17-201ENST00000297316 ZWINTO95229 277 aa21.77■■□□□ 1.07
SOX17-201ENST00000297316 KLKB1P03952 638 aa21.77■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.5 ms