RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285681.6

USP25-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 5,216 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-202ENST00000285681 CXCL14O95715 111 aa20.56■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 OR1D2P34982 312 aa20.56■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 MATKP42679 507 aa20.56■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa20.56■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 PRDM12Q9H4Q4 367 aa20.56■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 PLK1P53350 603 aa20.55■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 ATAD3BQ5T9A4 648 aa20.55■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 LLGL2Q6P1M3 1020 aa20.55■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 C9orf57Q5W0N0 161 aa20.55■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 NECAB2Q7Z6G3 386 aa20.55■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 ZNF786Q8N393 782 aa20.55■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 NDUFAF1Q9Y375 327 aa20.55■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 DAB1O75553 588 aa20.55■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 CCNE2O96020 404 aa20.55■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 GPR15P49685 360 aa20.55■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa20.55■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 SEMA3CQ99985 751 aa20.55■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 HGH1Q9BTY7 390 aa20.55■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 GDF3Q9NR23 364 aa20.55■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 UBXN8O00124 270 aa20.55■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 FAM153BP0C7A2 387 aa20.55■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 VAC14Q08AM6 782 aa20.55■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 FUT2Q10981 343 aa20.55■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 ECM1Q16610 540 aa20.55■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 FAM153CQ494X1 144 aa20.55■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 AADACL2Q6P093 401 aa20.55■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 C12orf56Q8IXR9 622 aa20.55■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 POMKQ9H5K3 350 aa20.55■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 NOD2Q9HC29 1040 aa20.55■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 MOXD2PA6NHM9 499 aa20.54■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 EPHB6O15197 1021 aa20.54■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 VPS4BO75351 444 aa20.54■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 CCT8P50990 548 aa20.54■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa20.54■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 MON1AQ86VX9 555 aa20.54■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 TMEM245Q9H330 911 aa20.54■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 PTPRHQ9HD43 1115 aa20.54■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 A0A0B4J269 797 aa20.54■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 NDUFB5O43674 189 aa20.54■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 LIASO43766 372 aa20.54■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 GLUD1P00367 558 aa20.54■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 ZNF844Q08AG5 666 aa20.54■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 PAGE2BQ5JRK9 111 aa20.54■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 FAM126BQ8IXS8 530 aa20.54■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 SPPL2BQ8TCT7 592 aa20.54■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 CNBD2Q96M20 576 aa20.54■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 PIF1Q9H611 641 aa20.54■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa20.54■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 SELPP16109 830 aa20.54■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 ACADSP16219 412 aa20.54■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 DSG1Q02413 1049 aa20.54■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 HSPA14Q0VDF9 509 aa20.54■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 SPRYD7Q5W111 196 aa20.54■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa20.54■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 BBS4Q96RK4 519 aa20.54■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 COMMD8Q9NX08 183 aa20.54■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 FCGR1AP12314 374 aa20.54■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 POLNQ7Z5Q5 900 aa20.54■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 SEMA4DQ92854 862 aa20.54■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 BBS2Q9BXC9 721 aa20.54■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 PRRG3Q9BZD7 231 aa20.54■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 BATF3Q9NR55 127 aa20.54■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 A0A088AWK7 358 aa20.53■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 NCANO14594 1321 aa20.53■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 BUD23O43709 281 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 GOT1P17174 413 aa20.53■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 ERCC2P18074 760 aa20.53■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 BMP6P22004 513 aa20.53■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 PTPN4P29074 926 aa20.53■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 MARSP56192 900 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 PFKPQ01813 784 aa20.53■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 ACSM2AQ08AH3 577 aa20.53■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 ARSHQ5FYA8 562 aa20.53■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 ACSM2BQ68CK6 577 aa20.53■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 FOXR2Q6PJQ5 311 aa20.53■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 DEFB107AQ8IZN7 70 aa20.53■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 CNTNAP1P78357 1384 aa20.53■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 ERBB2P04626 1255 aa20.53■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 SMARCB1Q12824 385 aa20.53■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 STAG3L4Q8TBR4 150 aa20.53■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 ELMO1Q92556 727 aa20.53■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 ZBTB10Q96DT7 871 aa20.53■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.8 ms