RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265339.6

UBE2B-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2B, Length 2,515 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-201ENST00000265339 TMED2Q15363 201 aa20.79■□□□□ 0.92
UBE2B-201ENST00000265339 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa20.79■□□□□ 0.92
UBE2B-201ENST00000265339 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa20.79■□□□□ 0.92
UBE2B-201ENST00000265339 KREMEN2Q8NCW0 462 aa20.79■□□□□ 0.92
UBE2B-201ENST00000265339 NCSTNQ92542 709 aa20.79■□□□□ 0.92
UBE2B-201ENST00000265339 MYRFLQ96LU7 910 aa20.79■□□□□ 0.92
UBE2B-201ENST00000265339 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa20.79■□□□□ 0.92
UBE2B-201ENST00000265339 CLIC5Q9NZA1 410 aa20.79■□□□□ 0.92
UBE2B-201ENST00000265339 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa20.79■□□□□ 0.92
UBE2B-201ENST00000265339 MYO7AQ13402 2215 aa20.79■□□□□ 0.92
UBE2B-201ENST00000265339 MDM4O15151 490 aa20.79■□□□□ 0.92
UBE2B-201ENST00000265339 LPXNO60711 386 aa20.79■□□□□ 0.92
UBE2B-201ENST00000265339 ASMTLO95671 621 aa20.79■□□□□ 0.92
UBE2B-201ENST00000265339 GAS8O95995 478 aa20.79■□□□□ 0.92
UBE2B-201ENST00000265339 KDELR1P24390 212 aa20.79■□□□□ 0.92
UBE2B-201ENST00000265339 BMP8BP34820 402 aa20.79■□□□□ 0.92
UBE2B-201ENST00000265339 CDKN2BP42772 138 aa20.79■□□□□ 0.92
UBE2B-201ENST00000265339 ARSEP51690 589 aa20.79■□□□□ 0.92
UBE2B-201ENST00000265339 EPHB3P54753 998 aa20.79■□□□□ 0.92
UBE2B-201ENST00000265339 DBN1Q16643 649 aa20.79■□□□□ 0.92
UBE2B-201ENST00000265339 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
UBE2B-201ENST00000265339 KCTD6Q8NC69 237 aa20.79■□□□□ 0.92
UBE2B-201ENST00000265339 MIPOL1Q8TD10 442 aa20.79■□□□□ 0.92
UBE2B-201ENST00000265339 RNF139Q8WU17 664 aa20.79■□□□□ 0.92
UBE2B-201ENST00000265339 C9orf72Q96LT7 481 aa20.79■□□□□ 0.92
UBE2B-201ENST00000265339 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa20.79■□□□□ 0.92
UBE2B-201ENST00000265339 OSBPL8Q9BZF1 889 aa20.79■□□□□ 0.92
UBE2B-201ENST00000265339 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP20.79■□□□□ 0.92
UBE2B-201ENST00000265339 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa20.79■□□□□ 0.92
UBE2B-201ENST00000265339 CDH16O75309 829 aa20.78■□□□□ 0.92
UBE2B-201ENST00000265339 C8AP07357 584 aa20.78■□□□□ 0.92
UBE2B-201ENST00000265339 PLD1Q13393 1074 aa20.78■□□□□ 0.92
UBE2B-201ENST00000265339 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
UBE2B-201ENST00000265339 GSTA3Q16772 222 aa20.78■□□□□ 0.92
UBE2B-201ENST00000265339 MSANTD2Q6P1R3 559 aa20.78■□□□□ 0.92
UBE2B-201ENST00000265339 NLRP9Q7RTR0 991 aa20.78■□□□□ 0.92
UBE2B-201ENST00000265339 PRUNE1Q86TP1 453 aa20.78■□□□□ 0.92
UBE2B-201ENST00000265339 TDHQ8IZJ6 230 aa20.78■□□□□ 0.92
UBE2B-201ENST00000265339 ARNTL2Q8WYA1 636 aa20.78■□□□□ 0.92
UBE2B-201ENST00000265339 PSMG2Q969U7 264 aa20.78■□□□□ 0.92
UBE2B-201ENST00000265339 MAGEB5Q9BZ81 275 aa20.78■□□□□ 0.92
UBE2B-201ENST00000265339 RHBDL2Q9NX52 303 aa20.78■□□□□ 0.92
UBE2B-201ENST00000265339 AP4E1Q9UPM8 1137 aa20.78■□□□□ 0.92
UBE2B-201ENST00000265339 IRAK2O43187 625 aa20.78■□□□□ 0.92
UBE2B-201ENST00000265339 MSI1O43347 362 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
UBE2B-201ENST00000265339 ATP6V1G1O75348 118 aa20.78■□□□□ 0.92
UBE2B-201ENST00000265339 KRT10P13645 584 aa20.78■□□□□ 0.92
UBE2B-201ENST00000265339 CCNFP41002 786 aa20.78■□□□□ 0.92
UBE2B-201ENST00000265339 CDH6P55285 790 aa20.78■□□□□ 0.92
UBE2B-201ENST00000265339 LIN52Q52LA3 116 aa20.78■□□□□ 0.92
UBE2B-201ENST00000265339 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
UBE2B-201ENST00000265339 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
UBE2B-201ENST00000265339 CENPKQ9BS16 269 aa20.78■□□□□ 0.92
UBE2B-201ENST00000265339 ANLNQ9NQW6 1124 aa20.78■□□□□ 0.92
UBE2B-201ENST00000265339 FZD10Q9ULW2 581 aa20.78■□□□□ 0.92
UBE2B-201ENST00000265339 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
UBE2B-201ENST00000265339 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa20.77■□□□□ 0.92
UBE2B-201ENST00000265339 I6L893 689 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.92
UBE2B-201ENST00000265339 EDF1O60869 148 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
UBE2B-201ENST00000265339 F9P00740 461 aa20.77■□□□□ 0.92
UBE2B-201ENST00000265339 INHBCP55103 352 aa20.77■□□□□ 0.92
UBE2B-201ENST00000265339 LSAMPQ13449 338 aa20.77■□□□□ 0.92
UBE2B-201ENST00000265339 TAF12Q16514 161 aa20.77■□□□□ 0.92
UBE2B-201ENST00000265339 TFDP3Q5H9I0 405 aa20.77■□□□□ 0.92
UBE2B-201ENST00000265339 CEP128Q6ZU80 1094 aa20.77■□□□□ 0.92
UBE2B-201ENST00000265339 CCDC149Q6ZUS6 474 aa20.77■□□□□ 0.92
UBE2B-201ENST00000265339 CFAP61Q8NHU2 1237 aa20.77■□□□□ 0.92
UBE2B-201ENST00000265339 MCUR1Q96AQ8 359 aa20.77■□□□□ 0.92
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.92
UBE2B-201ENST00000265339 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.92
UBE2B-201ENST00000265339 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
UBE2B-201ENST00000265339 LGALS13Q9UHV8 139 aa20.77■□□□□ 0.92
UBE2B-201ENST00000265339 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa20.77■□□□□ 0.92
UBE2B-201ENST00000265339 TRANK1O15050 2925 aa20.77■□□□□ 0.92
UBE2B-201ENST00000265339 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa20.77■□□□□ 0.92
UBE2B-201ENST00000265339 CCDC22O60826 627 aa20.77■□□□□ 0.92
UBE2B-201ENST00000265339 PFDN1O60925 122 aa20.77■□□□□ 0.92
UBE2B-201ENST00000265339 TBX18O95935 607 aa20.77■□□□□ 0.92
UBE2B-201ENST00000265339 PTPN7P35236 360 aa20.77■□□□□ 0.92
UBE2B-201ENST00000265339 CXCR3P49682 368 aa20.77■□□□□ 0.92
UBE2B-201ENST00000265339 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.92
UBE2B-201ENST00000265339 TAZQ16635 292 aa20.77■□□□□ 0.92
UBE2B-201ENST00000265339 KAZNQ674X7 775 aa20.77■□□□□ 0.92
UBE2B-201ENST00000265339 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.92
UBE2B-201ENST00000265339 CLNKQ7Z7G1 428 aa20.77■□□□□ 0.92
UBE2B-201ENST00000265339 PDZD8Q8NEN9 1154 aa20.77■□□□□ 0.92
UBE2B-201ENST00000265339 GRK7Q8WTQ7 553 aa20.77■□□□□ 0.92
UBE2B-201ENST00000265339 WDR60Q8WVS4 1066 aa20.77■□□□□ 0.92
UBE2B-201ENST00000265339 OVCA2Q8WZ82 227 aa20.77■□□□□ 0.92
UBE2B-201ENST00000265339 BTBD10Q9BSF8 475 aa20.77■□□□□ 0.92
UBE2B-201ENST00000265339 CALN1Q9BXU9 219 aa20.77■□□□□ 0.92
UBE2B-201ENST00000265339 PCDH18Q9HCL0 1135 aa20.77■□□□□ 0.92
UBE2B-201ENST00000265339 WASF2Q9Y6W5 498 aa20.77■□□□□ 0.92
UBE2B-201ENST00000265339 EPOPA6NHQ4 379 aa20.76■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 MMRN1Q13201 1228 aa20.76■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 DPYSL3Q14195 570 aa20.76■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 SPARCL1Q14515 664 aa20.76■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 DPYSL2Q16555 572 aa20.76■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 SLC45A4Q5BKX6 768 aa20.76■□□□□ 0.91
UBE2B-201ENST00000265339 GDPD5Q8WTR4 605 aa20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.5 ms