RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243056.4

HOXC13-201, Transcript of homeobox C13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXC13, Length 2,423 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13-201ENST00000243056 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP20.26■□□□□ 0.83
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HOXC13-201ENST00000243056 PIGRP01833 764 aa20.26■□□□□ 0.83
HOXC13-201ENST00000243056 EPHA3P29320 983 aa20.26■□□□□ 0.83
HOXC13-201ENST00000243056 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
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HOXC13-201ENST00000243056 CCDC68Q9H2F9 335 aa20.26■□□□□ 0.83
HOXC13-201ENST00000243056 OLAHQ9NV23 265 aa20.26■□□□□ 0.83
HOXC13-201ENST00000243056 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
HOXC13-201ENST00000243056 HES2Q9Y543 173 aa20.26■□□□□ 0.83
HOXC13-201ENST00000243056 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
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HOXC13-201ENST00000243056 ZMPSTE24O75844 475 aa20.26■□□□□ 0.83
HOXC13-201ENST00000243056 TUBA4AP68366 448 aa20.26■□□□□ 0.83
HOXC13-201ENST00000243056 GNA12Q03113 381 aa20.26■□□□□ 0.83
HOXC13-201ENST00000243056 ZBED5Q49AG3 693 aa20.26■□□□□ 0.83
HOXC13-201ENST00000243056 FAM182AQ5T1J6 154 aa20.26■□□□□ 0.83
HOXC13-201ENST00000243056 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa20.26■□□□□ 0.83
HOXC13-201ENST00000243056 OR5B17Q8NGF7 314 aa20.26■□□□□ 0.83
HOXC13-201ENST00000243056 TAS1R2Q8TE23 839 aa20.26■□□□□ 0.83
HOXC13-201ENST00000243056 EGLN2Q96KS0 407 aa20.26■□□□□ 0.83
HOXC13-201ENST00000243056 MFSD14AQ96MC6 490 aa20.26■□□□□ 0.83
HOXC13-201ENST00000243056 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
HOXC13-201ENST00000243056 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
HOXC13-201ENST00000243056 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
HOXC13-201ENST00000243056 MYRFQ9Y2G1 1151 aa20.26■□□□□ 0.83
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HOXC13-201ENST00000243056 KLHL41O60662 606 aa20.25■□□□□ 0.83
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HOXC13-201ENST00000243056 TNNI1P19237 187 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXC13-201ENST00000243056 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
HOXC13-201ENST00000243056 SLC18A2Q05940 514 aa20.25■□□□□ 0.83
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HOXC13-201ENST00000243056 SV2AQ7L0J3 742 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXC13-201ENST00000243056 KLHDC9Q8NEP7 349 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXC13-201ENST00000243056 LILRB4Q8NHJ6 448 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXC13-201ENST00000243056 LMO3Q8TAP4 145 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXC13-201ENST00000243056 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
HOXC13-201ENST00000243056 PSD2Q9BQI7 771 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXC13-201ENST00000243056 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXC13-201ENST00000243056 C2orf40Q9H1Z8 148 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXC13-201ENST00000243056 CDT1Q9H211 546 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXC13-201ENST00000243056 ACSS3Q9H6R3 686 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXC13-201ENST00000243056 FETUBQ9UGM5 382 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXC13-201ENST00000243056 TPPPO94811 219 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXC13-201ENST00000243056 SGPL1O95470 568 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXC13-201ENST00000243056 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
HOXC13-201ENST00000243056 OXA1LQ15070 435 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXC13-201ENST00000243056 CHI3L2Q15782 390 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXC13-201ENST00000243056 TRIM72Q6ZMU5 477 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXC13-201ENST00000243056 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXC13-201ENST00000243056 IGFN1Q86VF2 1251 aa20.25■□□□□ 0.83
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HOXC13-201ENST00000243056 E2F7Q96AV8 911 aa20.25■□□□□ 0.83
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HOXC13-201ENST00000243056 UNC93B1Q9H1C4 597 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXC13-201ENST00000243056 PTPRHQ9HD43 1115 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXC13-201ENST00000243056 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
HOXC13-201ENST00000243056 IFT52Q9Y366 437 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXC13-201ENST00000243056 TSPAN1O60635 241 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXC13-201ENST00000243056 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
HOXC13-201ENST00000243056 WASHC5Q12768 1159 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXC13-201ENST00000243056 GPS1Q13098 491 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXC13-201ENST00000243056 SELENBP1Q13228 472 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXC13-201ENST00000243056 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
HOXC13-201ENST00000243056 FRMD7Q6ZUT3 714 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXC13-201ENST00000243056 CARM1Q86X55 608 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXC13-201ENST00000243056 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
HOXC13-201ENST00000243056 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXC13-201ENST00000243056 DAPK2Q9UIK4 370 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXC13-201ENST00000243056 UBL4AP11441 157 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXC13-201ENST00000243056 ARSEP51690 589 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXC13-201ENST00000243056 NRF1Q16656 503 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXC13-201ENST00000243056 MSS51Q4VC12 460 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXC13-201ENST00000243056 WDR45BQ5MNZ6 344 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXC13-201ENST00000243056 ZPBP2Q6X784 338 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXC13-201ENST00000243056 TMEM126BQ8IUX1 230 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXC13-201ENST00000243056 FIBCD1Q8N539 461 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXC13-201ENST00000243056 PDZD8Q8NEN9 1154 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXC13-201ENST00000243056 PXYLP1Q8TE99 480 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXC13-201ENST00000243056 KATNAL1Q9BW62 490 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXC13-201ENST00000243056 PDZD7Q9H5P4 517 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXC13-201ENST00000243056 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
HOXC13-201ENST00000243056 GTF3C4Q9UKN8 822 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXC13-201ENST00000243056 GIPC1O14908 333 aa20.23■□□□□ 0.83
HOXC13-201ENST00000243056 CXCL8P10145 99 aa20.23■□□□□ 0.83
HOXC13-201ENST00000243056 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
HOXC13-201ENST00000243056 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
HOXC13-201ENST00000243056 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
HOXC13-201ENST00000243056 MTM1Q13496 603 aa20.23■□□□□ 0.83
HOXC13-201ENST00000243056 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
HOXC13-201ENST00000243056 SIGIRRQ6IA17 410 aa20.23■□□□□ 0.83
HOXC13-201ENST00000243056 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa20.23■□□□□ 0.83
HOXC13-201ENST00000243056 SORCS3Q9UPU3 1222 aa20.23■□□□□ 0.83
HOXC13-201ENST00000243056 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa20.23■□□□□ 0.83
HOXC13-201ENST00000243056 CPQQ9Y646 472 aa20.23■□□□□ 0.83
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