RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 BECN1Q14457 450 aa16.94■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 NR0B2Q15466 257 aa16.94■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 FSCBQ5H9T9 825 aa16.94■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 RAB11FIP2Q7L804 512 aa16.94■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 DSG4Q86SJ6 1040 aa16.94■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 MYEOVQ96EZ4 313 aa16.94■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 SPAG5Q96R06 1193 aa16.94■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 TNMDQ9H2S6 317 aa16.94■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 KBTBD4Q9NVX7 518 aa16.94■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 STIM2Q9P246 746 aa16.94■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 IGLV3-27P01718 113 aa16.93■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 CSF2P04141 144 aa16.93■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 CLDN2P57739 230 aa16.93■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 FZD2Q14332 565 aa16.93■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa16.93■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 DEFB133Q30KQ1 61 aa16.93■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 PM20D1Q6GTS8 502 aa16.93■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 BORAQ6PGQ7 559 aa16.93■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 PIGZQ86VD9 579 aa16.93■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 DTX1Q86Y01 620 aa16.93■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 CCDC65Q8IXS2 484 aa16.93■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF507Q8TCN5 953 aa16.93■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 PARD3BQ8TEW8 1205 aa16.93■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 KLK6Q92876 244 aa16.93■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 CCDC3Q9BQI4 270 aa16.93■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 BOCQ9BWV1 1114 aa16.93■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 EPB41L5Q9HCM4 733 aa16.93■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 ZBED1O96006 694 aa16.92■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 RPS24P62847 133 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 STK38Q15208 465 aa16.92■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF284Q2VY69 593 aa16.92■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 ZACNQ401N2 412 aa16.92■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 KMT5BQ4FZB7 885 aa16.92■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 NADSYN1Q6IA69 706 aa16.92■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 SLC35F3Q8IY50 421 aa16.92■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 FRS2Q8WU20 508 aa16.92■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 TAF4BQ92750 862 aa16.92■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 NAT6Q93015 286 aa16.92■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 SLC12A9Q9BXP2 914 aa16.92■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 ULBP1Q9BZM6 244 aa16.92■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 UBXN6Q9BZV1 441 aa16.92■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 KLF15Q9UIH9 416 aa16.92■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 A0A1W2PQU0 124 aa16.91■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 TPP1O14773 563 aa16.91■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 SPTLC2O15270 562 aa16.91■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 AQP9O43315 295 aa16.91■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 PPP6R2O75170 966 aa16.91■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 AKT2P31751 481 aa16.91■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 TKTL1P51854 596 aa16.91■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP16.91■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 CDH18Q13634 790 aa16.91■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa16.91■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP16.91■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 OR6B2Q6IFH4 312 aa16.91■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 CNNM4Q6P4Q7 775 aa16.91■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 SHC4Q6S5L8 630 aa16.91■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 HORMAD1Q86X24 394 aa16.91■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 ZFAND4Q86XD8 727 aa16.91■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 C12orf56Q8IXR9 622 aa16.91■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 APCDD1Q8J025 514 aa16.91■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 CARNMT1Q8N4J0 409 aa16.91■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 SPATA20Q8TB22 786 aa16.91■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 EDEM1Q92611 657 aa16.91■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa16.91■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 PISDQ9UG56 409 aa16.91■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 CEP83Q9Y592 693 aa16.91■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa16.9■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 A6NNZ2 444 aa16.9■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 D6RAR5 112 aa16.9■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 H3BM21 787 aa16.9■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 ACSL4O60488 711 aa16.9■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 PRAMEF10O60809 474 aa16.9■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 YEATS4O95619 227 aa16.9■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 RPN1P04843 607 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 FAM46CQ5VWP2 391 aa16.9■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 Q6ZSR6 202 aa16.9■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP16.9■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 PARGQ86W56 976 aa16.9■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 RNF139Q8WU17 664 aa16.9■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 OR8D1Q8WZ84 308 aa16.9■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 DHX58Q96C10 678 aa16.9■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 FOXP3Q9BZS1 431 aa16.9■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa16.9■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 FOXJ2Q9P0K8 574 aa16.9■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 PPM1HQ9ULR3 514 aa16.9■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa16.9■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 SHANK1Q9Y566 2161 aa16.89■□□□□ 0.3
SPCS1-201ENST00000233025 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa16.89■□□□□ 0.29
SPCS1-201ENST00000233025 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP16.89■□□□□ 0.29
SPCS1-201ENST00000233025 MOCS3O95396 460 aa16.89■□□□□ 0.29
SPCS1-201ENST00000233025 CCKBRP32239 447 aa16.89■□□□□ 0.29
SPCS1-201ENST00000233025 SLC11A2P49281 568 aa16.89■□□□□ 0.29
SPCS1-201ENST00000233025 NEK5Q6P3R8 708 aa16.89■□□□□ 0.29
SPCS1-201ENST00000233025 TICAM1Q8IUC6 712 aa16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.9 ms