RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000222305.7

USF2-201, Transcript of upstream transcription factor 2, c-fos interacting, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USF2, Length 1,634 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2-201ENST00000222305 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
USF2-201ENST00000222305 CCDC89Q8N998 374 aa23.51■■□□□ 1.35
USF2-201ENST00000222305 TTC8Q8TAM2 541 aa23.51■■□□□ 1.35
USF2-201ENST00000222305 TSGA13Q96PP4 275 aa23.51■■□□□ 1.35
USF2-201ENST00000222305 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
USF2-201ENST00000222305 BRD8Q9H0E9 1235 aa23.51■■□□□ 1.35
USF2-201ENST00000222305 ECT2Q9H8V3 914 aa23.51■■□□□ 1.35
USF2-201ENST00000222305 SP110Q9HB58 689 aa23.51■■□□□ 1.35
USF2-201ENST00000222305 ATP13A1Q9HD20 1204 aa23.51■■□□□ 1.35
USF2-201ENST00000222305 FAM187AA6NFU0 413 aa23.5■■□□□ 1.35
USF2-201ENST00000222305 KRT14P02533 472 aa23.5■■□□□ 1.35
USF2-201ENST00000222305 CCNCP24863 283 aa23.5■■□□□ 1.35
USF2-201ENST00000222305 HLA-FP30511 346 aa23.5■■□□□ 1.35
USF2-201ENST00000222305 CLCN6P51797 869 aa23.5■■□□□ 1.35
USF2-201ENST00000222305 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
USF2-201ENST00000222305 CCDC70Q6NSX1 233 aa23.5■■□□□ 1.35
USF2-201ENST00000222305 ZNF783Q6ZMS7 281 aa23.5■■□□□ 1.35
USF2-201ENST00000222305 LEKR1Q6ZMV7 388 aa23.5■■□□□ 1.35
USF2-201ENST00000222305 FEM1AQ9BSK4 669 aa23.5■■□□□ 1.35
USF2-201ENST00000222305 TRIM31Q9BZY9 425 aa23.5■■□□□ 1.35
USF2-201ENST00000222305 ABCB8Q9NUT2 735 aa23.5■■□□□ 1.35
USF2-201ENST00000222305 GTSE1Q9NYZ3 720 aa23.5■■□□□ 1.35
USF2-201ENST00000222305 CHADO15335 359 aa23.49■■□□□ 1.35
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USF2-201ENST00000222305 IL9P15248 144 aa23.49■■□□□ 1.35
USF2-201ENST00000222305 STIP1P31948 543 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
USF2-201ENST00000222305 RUNX3Q13761 415 aa23.49■■□□□ 1.35
USF2-201ENST00000222305 PTK6Q13882 451 aa23.49■■□□□ 1.35
USF2-201ENST00000222305 C12orf40Q86WS4 652 aa23.49■■□□□ 1.35
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USF2-201ENST00000222305 APCDD1Q8J025 514 aa23.49■■□□□ 1.35
USF2-201ENST00000222305 RTP4Q96DX8 246 aa23.49■■□□□ 1.35
USF2-201ENST00000222305 ALG14Q96F25 216 aa23.49■■□□□ 1.35
USF2-201ENST00000222305 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
USF2-201ENST00000222305 LIMD1Q9UGP4 676 aa23.49■■□□□ 1.35
USF2-201ENST00000222305 VPS28Q9UK41 221 aa23.49■■□□□ 1.35
USF2-201ENST00000222305 OR51B4Q9Y5P0 310 aa23.49■■□□□ 1.35
USF2-201ENST00000222305 COL4A2P08572 1712 aa23.49■■□□□ 1.35
USF2-201ENST00000222305 RNF103O00237 685 aa23.48■■□□□ 1.35
USF2-201ENST00000222305 TRIM24O15164 1050 aa23.48■■□□□ 1.35
USF2-201ENST00000222305 OXCT1P55809 520 aa23.48■■□□□ 1.35
USF2-201ENST00000222305 ZNF33AQ06730 810 aa23.48■■□□□ 1.35
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USF2-201ENST00000222305 AAK1Q2M2I8 961 aa23.48■■□□□ 1.35
USF2-201ENST00000222305 GAB4Q2WGN9 574 aa23.48■■□□□ 1.35
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USF2-201ENST00000222305 CCDC110Q8TBZ0 833 aa23.48■■□□□ 1.35
USF2-201ENST00000222305 USP33Q8TEY7 942 aa23.48■■□□□ 1.35
USF2-201ENST00000222305 LMLNQ96KR4 655 aa23.48■■□□□ 1.35
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USF2-201ENST00000222305 ACTL7AQ9Y615 435 aa23.48■■□□□ 1.35
USF2-201ENST00000222305 CBX4O00257 560 aa23.48■■□□□ 1.35
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USF2-201ENST00000222305 PTPN3P26045 913 aa23.48■■□□□ 1.35
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USF2-201ENST00000222305 DPH5Q9H2P9 285 aa23.48■■□□□ 1.35
USF2-201ENST00000222305 PCDH9Q9HC56 1237 aa23.48■■□□□ 1.35
USF2-201ENST00000222305 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
USF2-201ENST00000222305 ASIC3Q9UHC3 531 aa23.48■■□□□ 1.35
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USF2-201ENST00000222305 ESYT3A0FGR9 886 aa23.47■■□□□ 1.35
USF2-201ENST00000222305 ARNTLO00327 626 aa23.47■■□□□ 1.35
USF2-201ENST00000222305 MATN3O15232 486 aa23.47■■□□□ 1.35
USF2-201ENST00000222305 KDELR3O43731 214 aa23.47■■□□□ 1.35
USF2-201ENST00000222305 PRAMEF11O60813 436 aa23.47■■□□□ 1.35
USF2-201ENST00000222305 PEX11BO96011 259 aa23.47■■□□□ 1.35
USF2-201ENST00000222305 CCNB1P14635 433 aa23.47■■□□□ 1.35
USF2-201ENST00000222305 RPL22P35268 128 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
USF2-201ENST00000222305 TERF1P54274 439 aa23.47■■□□□ 1.35
USF2-201ENST00000222305 GUCY2DQ02846 1103 aa23.47■■□□□ 1.35
USF2-201ENST00000222305 PLCD3Q8N3E9 789 aa23.47■■□□□ 1.35
USF2-201ENST00000222305 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
USF2-201ENST00000222305 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
USF2-201ENST00000222305 ERP44Q9BS26 406 aa23.47■■□□□ 1.35
USF2-201ENST00000222305 BRD9Q9H8M2 597 aa23.47■■□□□ 1.35
USF2-201ENST00000222305 KCNK12Q9HB15 430 aa23.47■■□□□ 1.35
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USF2-201ENST00000222305 TRADDQ15628 312 aa23.46■■□□□ 1.35
USF2-201ENST00000222305 ELF2Q15723 593 aa23.46■■□□□ 1.35
USF2-201ENST00000222305 PLEKHG6Q3KR16 790 aa23.46■■□□□ 1.35
USF2-201ENST00000222305 FUT11Q495W5 492 aa23.46■■□□□ 1.35
USF2-201ENST00000222305 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa23.46■■□□□ 1.35
USF2-201ENST00000222305 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa23.46■■□□□ 1.35
USF2-201ENST00000222305 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa23.46■■□□□ 1.35
USF2-201ENST00000222305 ZNF567Q8N184 647 aa23.46■■□□□ 1.35
USF2-201ENST00000222305 RAB17Q9H0T7 212 aa23.46■■□□□ 1.35
USF2-201ENST00000222305 EPB41L5Q9HCM4 733 aa23.46■■□□□ 1.35
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