RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000201031.2

TFAP2C-201, Transcript of transcription factor AP-2 gamma, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TFAP2C, Length 2,866 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAP2C-201ENST00000201031 VCXQ9H320 206 aa16■□□□□ 0.15
TFAP2C-201ENST00000201031 LRRC40Q9H9A6 602 aa16■□□□□ 0.15
TFAP2C-201ENST00000201031 BFARQ9NZS9 450 aa16■□□□□ 0.15
TFAP2C-201ENST00000201031 DERAQ9Y315 318 aa16■□□□□ 0.15
TFAP2C-201ENST00000201031 TXNDC9O14530 226 aa15.99■□□□□ 0.15
TFAP2C-201ENST00000201031 KLHL2O95198 593 aa15.99■□□□□ 0.15
TFAP2C-201ENST00000201031 AP2A1O95782 977 aa15.99■□□□□ 0.15
TFAP2C-201ENST00000201031 HARS2P49590 506 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
TFAP2C-201ENST00000201031 LIMK2P53671 638 aa15.99■□□□□ 0.15
TFAP2C-201ENST00000201031 SNAPC2Q13487 334 aa15.99■□□□□ 0.15
TFAP2C-201ENST00000201031 POU6F1Q14863 301 aa15.99■□□□□ 0.15
TFAP2C-201ENST00000201031 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
TFAP2C-201ENST00000201031 TRIP10Q15642 601 aa15.99■□□□□ 0.15
TFAP2C-201ENST00000201031 CYS1Q717R9 158 aa15.99■□□□□ 0.15
TFAP2C-201ENST00000201031 DHDDSQ86SQ9 333 aa15.99■□□□□ 0.15
TFAP2C-201ENST00000201031 HASPINQ8TF76 798 aa15.99■□□□□ 0.15
TFAP2C-201ENST00000201031 KCTD4Q8WVF5 259 aa15.99■□□□□ 0.15
TFAP2C-201ENST00000201031 NT5C3BQ969T7 300 aa15.99■□□□□ 0.15
TFAP2C-201ENST00000201031 PCED1BQ96HM7 432 aa15.99■□□□□ 0.15
TFAP2C-201ENST00000201031 VPS39Q96JC1 886 aa15.99■□□□□ 0.15
TFAP2C-201ENST00000201031 TNIP3Q96KP6 325 aa15.99■□□□□ 0.15
TFAP2C-201ENST00000201031 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
TFAP2C-201ENST00000201031 CDH19Q9H159 772 aa15.99■□□□□ 0.15
TFAP2C-201ENST00000201031 NMRAL1Q9HBL8 299 aa15.99■□□□□ 0.15
TFAP2C-201ENST00000201031 GDAP2Q9NXN4 497 aa15.99■□□□□ 0.15
TFAP2C-201ENST00000201031 ASB3Q9Y575 518 aa15.99■□□□□ 0.15
TFAP2C-201ENST00000201031 NRCAMQ92823 1304 aa15.99■□□□□ 0.15
TFAP2C-201ENST00000201031 SBK3P0C264 359 aa15.99■□□□□ 0.15
TFAP2C-201ENST00000201031 ETS2P15036 469 aa15.99■□□□□ 0.15
TFAP2C-201ENST00000201031 SPRP35270 261 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
TFAP2C-201ENST00000201031 NUDT2P50583 147 aa15.99■□□□□ 0.15
TFAP2C-201ENST00000201031 NAGLUP54802 743 aa15.99■□□□□ 0.15
TFAP2C-201ENST00000201031 CCNA1P78396 465 aa15.99■□□□□ 0.15
TFAP2C-201ENST00000201031 MPP1Q00013 466 aa15.99■□□□□ 0.15
TFAP2C-201ENST00000201031 KLF10Q13118 480 aa15.99■□□□□ 0.15
TFAP2C-201ENST00000201031 GRTP1Q5TC63 336 aa15.99■□□□□ 0.15
TFAP2C-201ENST00000201031 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
TFAP2C-201ENST00000201031 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa15.99■□□□□ 0.15
TFAP2C-201ENST00000201031 FAM156AQ8NDB6 213 aa15.99■□□□□ 0.15
TFAP2C-201ENST00000201031 GDPD5Q8WTR4 605 aa15.99■□□□□ 0.15
TFAP2C-201ENST00000201031 IFT43Q96FT9 208 aa15.99■□□□□ 0.15
TFAP2C-201ENST00000201031 SCYL1Q96KG9 808 aa15.99■□□□□ 0.15
TFAP2C-201ENST00000201031 TINF2Q9BSI4 451 aa15.99■□□□□ 0.15
TFAP2C-201ENST00000201031 TKTL2Q9H0I9 626 aa15.99■□□□□ 0.15
TFAP2C-201ENST00000201031 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
TFAP2C-201ENST00000201031 IGSF9Q9P2J2 1179 aa15.99■□□□□ 0.15
TFAP2C-201ENST00000201031 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa15.99■□□□□ 0.15
TFAP2C-201ENST00000201031 MAGEA13PA6NCF6 341 aa15.98■□□□□ 0.15
TFAP2C-201ENST00000201031 DFFAO00273 331 aa15.98■□□□□ 0.15
TFAP2C-201ENST00000201031 CD4P01730 458 aa15.98■□□□□ 0.15
TFAP2C-201ENST00000201031 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
TFAP2C-201ENST00000201031 GRK2P25098 689 aa15.98■□□□□ 0.15
TFAP2C-201ENST00000201031 GABRB3P28472 473 aa15.98■□□□□ 0.15
TFAP2C-201ENST00000201031 MPP3Q13368 585 aa15.98■□□□□ 0.15
TFAP2C-201ENST00000201031 NOMO2Q5JPE7 1267 aa15.98■□□□□ 0.15
TFAP2C-201ENST00000201031 SPANXN3Q5MJ09 141 aa15.98■□□□□ 0.15
TFAP2C-201ENST00000201031 NXNQ6DKJ4 435 aa15.98■□□□□ 0.15
TFAP2C-201ENST00000201031 EPGNQ6UW88 154 aa15.98■□□□□ 0.15
TFAP2C-201ENST00000201031 TMEM135Q86UB9 458 aa15.98■□□□□ 0.15
TFAP2C-201ENST00000201031 SNX32Q86XE0 403 aa15.98■□□□□ 0.15
TFAP2C-201ENST00000201031 ZNF560Q96MR9 790 aa15.98■□□□□ 0.15
TFAP2C-201ENST00000201031 CATSPER2Q96P56 530 aa15.98■□□□□ 0.15
TFAP2C-201ENST00000201031 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
TFAP2C-201ENST00000201031 DNAJC28Q9NX36 388 aa15.98■□□□□ 0.15
TFAP2C-201ENST00000201031 OR12D3Q9UGF7 316 aa15.98■□□□□ 0.15
TFAP2C-201ENST00000201031 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa15.98■□□□□ 0.15
TFAP2C-201ENST00000201031 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa15.98■□□□□ 0.15
TFAP2C-201ENST00000201031 STAP1Q9ULZ2 295 aa15.98■□□□□ 0.15
TFAP2C-201ENST00000201031 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa15.98■□□□□ 0.15
TFAP2C-201ENST00000201031 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP15.98■□□□□ 0.15
TFAP2C-201ENST00000201031 CYP2B6P20813 491 aa15.98■□□□□ 0.15
TFAP2C-201ENST00000201031 GARSP41250 739 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
TFAP2C-201ENST00000201031 SERPINB8P50452 374 aa15.98■□□□□ 0.15
TFAP2C-201ENST00000201031 CLCNKBP51801 687 aa15.98■□□□□ 0.15
TFAP2C-201ENST00000201031 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
TFAP2C-201ENST00000201031 TMCO4Q5TGY1 634 aa15.98■□□□□ 0.15
TFAP2C-201ENST00000201031 CNTD1Q8N815 330 aa15.98■□□□□ 0.15
TFAP2C-201ENST00000201031 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
TFAP2C-201ENST00000201031 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
TFAP2C-201ENST00000201031 MIOSQ9NXC5 875 aa15.98■□□□□ 0.15
TFAP2C-201ENST00000201031 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
TFAP2C-201ENST00000201031 CASTOR2A6NHX0 329 aa15.97■□□□□ 0.15
TFAP2C-201ENST00000201031 LRIG2O94898 1065 aa15.97■□□□□ 0.15
TFAP2C-201ENST00000201031 PIGNO95427 931 aa15.97■□□□□ 0.15
TFAP2C-201ENST00000201031 FAM200BP0CF97 657 aa15.97■□□□□ 0.15
TFAP2C-201ENST00000201031 CRABP2P29373 138 aa15.97■□□□□ 0.15
TFAP2C-201ENST00000201031 GRIA4P48058 902 aa15.97■□□□□ 0.15
TFAP2C-201ENST00000201031 PGFP49763 221 aa15.97■□□□□ 0.15
TFAP2C-201ENST00000201031 SV2CQ496J9 727 aa15.97■□□□□ 0.15
TFAP2C-201ENST00000201031 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
TFAP2C-201ENST00000201031 PGM2L1Q6PCE3 622 aa15.97■□□□□ 0.15
TFAP2C-201ENST00000201031 MFSD6LQ8IWD5 586 aa15.97■□□□□ 0.15
TFAP2C-201ENST00000201031 OR6Y1Q8NGX8 325 aa15.97■□□□□ 0.15
TFAP2C-201ENST00000201031 GCNAQ96QF7 691 aa15.97■□□□□ 0.15
TFAP2C-201ENST00000201031 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
TFAP2C-201ENST00000201031 NEMP2A6NFY4 417 aa15.97■□□□□ 0.15
TFAP2C-201ENST00000201031 AURKAO14965 403 aa15.97■□□□□ 0.15
TFAP2C-201ENST00000201031 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
TFAP2C-201ENST00000201031 TBCCQ15814 346 aa15.97■□□□□ 0.15
TFAP2C-201ENST00000201031 GRAMD1BQ3KR37 738 aa15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 96.5 ms