RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000040877.1

TARBP1-201, Transcript of TAR (HIV-1) RNA binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TARBP1, Length 5,130 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARBP1-201ENST00000040877 NSMCE2Q96MF7 247 aa23.53■■□□□ 1.36
TARBP1-201ENST00000040877 QRFPRQ96P65 431 aa23.53■■□□□ 1.36
TARBP1-201ENST00000040877 SLC25A23Q9BV35 468 aa23.53■■□□□ 1.36
TARBP1-201ENST00000040877 EPS8L2Q9H6S3 715 aa23.53■■□□□ 1.36
TARBP1-201ENST00000040877 MORF4L1Q9UBU8 362 aa23.53■■□□□ 1.36
TARBP1-201ENST00000040877 GUCY1B2O75343 617 aa23.52■■□□□ 1.36
TARBP1-201ENST00000040877 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
TARBP1-201ENST00000040877 PSMB4P28070 264 aa23.52■■□□□ 1.36
TARBP1-201ENST00000040877 ATAD3BQ5T9A4 648 aa23.52■■□□□ 1.36
TARBP1-201ENST00000040877 RSPH1Q8WYR4 309 aa23.52■■□□□ 1.36
TARBP1-201ENST00000040877 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
TARBP1-201ENST00000040877 MSRAQ9UJ68 235 aa23.52■■□□□ 1.36
TARBP1-201ENST00000040877 FCHO1O14526 889 aa23.52■■□□□ 1.36
TARBP1-201ENST00000040877 TGFB1I1O43294 461 aa23.52■■□□□ 1.36
TARBP1-201ENST00000040877 B4GALT4O60513 344 aa23.52■■□□□ 1.36
TARBP1-201ENST00000040877 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
TARBP1-201ENST00000040877 TNFRSF25Q93038 417 aa23.52■■□□□ 1.36
TARBP1-201ENST00000040877 CD52P31358 61 aa23.52■■□□□ 1.36
TARBP1-201ENST00000040877 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
TARBP1-201ENST00000040877 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
TARBP1-201ENST00000040877 FAM45BPQ6NSW5 357 aa23.52■■□□□ 1.36
TARBP1-201ENST00000040877 DEFB107AQ8IZN7 70 aa23.52■■□□□ 1.36
TARBP1-201ENST00000040877 ZNF614Q8N883 585 aa23.52■■□□□ 1.36
TARBP1-201ENST00000040877 FAM45AQ8TCE6 357 aa23.52■■□□□ 1.36
TARBP1-201ENST00000040877 ATL1Q8WXF7 558 aa23.52■■□□□ 1.36
TARBP1-201ENST00000040877 DUSP16Q9BY84 665 aa23.52■■□□□ 1.36
TARBP1-201ENST00000040877 LHX5Q9H2C1 402 aa23.52■■□□□ 1.36
TARBP1-201ENST00000040877 PALMDQ9NP74 551 aa23.52■■□□□ 1.36
TARBP1-201ENST00000040877 FAM153BP0C7A2 387 aa23.52■■□□□ 1.36
TARBP1-201ENST00000040877 CCNB1P14635 433 aa23.52■■□□□ 1.36
TARBP1-201ENST00000040877 TUSC3Q13454 348 aa23.52■■□□□ 1.36
TARBP1-201ENST00000040877 CRY1Q16526 586 aa23.52■■□□□ 1.36
TARBP1-201ENST00000040877 UGCGQ16739 394 aa23.52■■□□□ 1.36
TARBP1-201ENST00000040877 FAM153CQ494X1 144 aa23.52■■□□□ 1.36
TARBP1-201ENST00000040877 CATSPER2Q96P56 530 aa23.52■■□□□ 1.36
TARBP1-201ENST00000040877 GPR20Q99678 358 aa23.52■■□□□ 1.36
TARBP1-201ENST00000040877 SH3BP4Q9P0V3 963 aa23.52■■□□□ 1.36
TARBP1-201ENST00000040877 A0A0B4J269 797 aa23.51■■□□□ 1.35
TARBP1-201ENST00000040877 ATP6V1B2P21281 511 aa23.51■■□□□ 1.35
TARBP1-201ENST00000040877 BMP6P22004 513 aa23.51■■□□□ 1.35
TARBP1-201ENST00000040877 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
TARBP1-201ENST00000040877 SLC16A1P53985 500 aa23.51■■□□□ 1.35
TARBP1-201ENST00000040877 TRIM60Q495X7 471 aa23.51■■□□□ 1.35
TARBP1-201ENST00000040877 WASHC2DQ5SRD0 308 aa23.51■■□□□ 1.35
TARBP1-201ENST00000040877 EEF1DP3Q658K8 133 aa23.51■■□□□ 1.35
TARBP1-201ENST00000040877 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
TARBP1-201ENST00000040877 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa23.51■■□□□ 1.35
TARBP1-201ENST00000040877 SEC22BO75396 215 aa23.51■■□□□ 1.35
TARBP1-201ENST00000040877 FMO4P31512 558 aa23.51■■□□□ 1.35
TARBP1-201ENST00000040877 RFX3P48380 749 aa23.51■■□□□ 1.35
TARBP1-201ENST00000040877 UBE2E3Q969T4 207 aa23.51■■□□□ 1.35
TARBP1-201ENST00000040877 CNBD2Q96M20 576 aa23.51■■□□□ 1.35
TARBP1-201ENST00000040877 ANKRD27Q96NW4 1050 aa23.51■■□□□ 1.35
TARBP1-201ENST00000040877 ZNF112Q9UJU3 913 aa23.51■■□□□ 1.35
TARBP1-201ENST00000040877 NUDT5Q9UKK9 219 aa23.51■■□□□ 1.35
TARBP1-201ENST00000040877 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
TARBP1-201ENST00000040877 FASP25445 335 aa23.51■■□□□ 1.35
TARBP1-201ENST00000040877 TREML2Q5T2D2 321 aa23.51■■□□□ 1.35
TARBP1-201ENST00000040877 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa23.51■■□□□ 1.35
TARBP1-201ENST00000040877 CES3Q6UWW8 571 aa23.51■■□□□ 1.35
TARBP1-201ENST00000040877 MTMR14Q8NCE2 650 aa23.51■■□□□ 1.35
TARBP1-201ENST00000040877 ZBTB10Q96DT7 871 aa23.51■■□□□ 1.35
TARBP1-201ENST00000040877 KLHL4Q9C0H6 718 aa23.51■■□□□ 1.35
TARBP1-201ENST00000040877 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP23.51■■□□□ 1.35
TARBP1-201ENST00000040877 TRPC4Q9UBN4 977 aa23.51■■□□□ 1.35
TARBP1-201ENST00000040877 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa23.51■■□□□ 1.35
TARBP1-201ENST00000040877 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
TARBP1-201ENST00000040877 CENPAP49450 140 aa23.51■■□□□ 1.35
TARBP1-201ENST00000040877 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
TARBP1-201ENST00000040877 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
TARBP1-201ENST00000040877 FAM126BQ8IXS8 530 aa23.51■■□□□ 1.35
TARBP1-201ENST00000040877 TERB1Q8NA31 727 aa23.51■■□□□ 1.35
TARBP1-201ENST00000040877 GNPTGQ9UJJ9 305 aa23.51■■□□□ 1.35
TARBP1-201ENST00000040877 TTPAP49638 278 aa23.5■■□□□ 1.35
TARBP1-201ENST00000040877 AFTPHQ6ULP2 937 aa23.5■■□□□ 1.35
TARBP1-201ENST00000040877 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa23.5■■□□□ 1.35
TARBP1-201ENST00000040877 ACMSDQ8TDX5 336 aa23.5■■□□□ 1.35
TARBP1-201ENST00000040877 SAR1AQ9NR31 198 aa23.5■■□□□ 1.35
TARBP1-201ENST00000040877 GPR15P49685 360 aa23.5■■□□□ 1.35
TARBP1-201ENST00000040877 XRCC4Q13426 336 aa23.5■■□□□ 1.35
TARBP1-201ENST00000040877 PSMD5Q16401 504 aa23.5■■□□□ 1.35
TARBP1-201ENST00000040877 KIAA2013Q8IYS2 634 aa23.5■■□□□ 1.35
TARBP1-201ENST00000040877 POMKQ9H5K3 350 aa23.5■■□□□ 1.35
TARBP1-201ENST00000040877 SORCS3Q9UPU3 1222 aa23.5■■□□□ 1.35
TARBP1-201ENST00000040877 TBC1D3BA6NDS4 549 aa23.5■■□□□ 1.35
TARBP1-201ENST00000040877 VAC14Q08AM6 782 aa23.5■■□□□ 1.35
TARBP1-201ENST00000040877 CCDC81Q6ZN84 652 aa23.5■■□□□ 1.35
TARBP1-201ENST00000040877 CHMP1BQ7LBR1 199 aa23.5■■□□□ 1.35
TARBP1-201ENST00000040877 CDK20Q8IZL9 346 aa23.5■■□□□ 1.35
TARBP1-201ENST00000040877 SPPL2BQ8TCT7 592 aa23.5■■□□□ 1.35
TARBP1-201ENST00000040877 CERS2Q96G23 380 aa23.5■■□□□ 1.35
TARBP1-201ENST00000040877 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
TARBP1-201ENST00000040877 ZNF510Q9Y2H8 683 aa23.5■■□□□ 1.35
TARBP1-201ENST00000040877 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
TARBP1-201ENST00000040877 TPGS1Q6ZTW0 290 aa23.5■■□□□ 1.35
TARBP1-201ENST00000040877 FAM35AQ86V20 835 aa23.5■■□□□ 1.35
TARBP1-201ENST00000040877 MON1AQ86VX9 555 aa23.5■■□□□ 1.35
TARBP1-201ENST00000040877 C4orf32Q8N8J7 132 aa23.5■■□□□ 1.35
TARBP1-201ENST00000040877 OR52K1Q8NGK4 314 aa23.5■■□□□ 1.35
TARBP1-201ENST00000040877 HIC2Q96JB3 615 aa23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms