RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025522.10

Pdgfrb-201, Transcript of Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pdgfrb, Length 5,407 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Cct8P42932 548 aa11.14□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Nol4P60954 483 aa11.14□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Mageb5Q14AN0 366 aa11.14□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Map3k3Q61084 626 aa11.14□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Pacsin1Q61644 441 aa11.14□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ift52Q62559 426 aa11.14□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Dna2Q6ZQJ5 1062 aa11.14□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 RragdQ7TT45 449 aa11.14□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Pcid2Q8BFV2 399 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ubash3bQ8BGG7 638 aa11.14□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Cpsf4Q8BQZ5 211 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Unc5bQ8K1S3 945 aa11.14□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Nsl1Q8K305 281 aa11.14□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 RergQ8R367 199 aa11.14□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Asz1Q8VD46 475 aa11.14□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Nphs2Q91X05 385 aa11.14□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Atp6ap1Q9R1Q9 463 aa11.14□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Chek2Q9Z265 546 aa11.14□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 RictorQ6QI06 1708 aa11.14□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Kcnj5P48545 419 aa11.13□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Flt3Q00342 1000 aa11.13□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 ErfeQ6PGN1 340 aa11.13□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 SnphQ80U23 495 aa11.13□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Elmo1Q8BPU7 727 aa11.13□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Dync1li1Q8R1Q8 523 aa11.13□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Impg1Q8R1W8 798 aa11.13□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Rprd1bQ9CSU0 326 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Tbk1Q9WUN2 729 aa11.13□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Esp31A8R0W3 114 aa11.13□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm8267E9Q207 261 aa11.13□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm21293E9Q4G9 266 aa11.13□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Lrrc23O35125 340 aa11.13□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Cd151O35566 253 aa11.13□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Cdk16Q04735 496 aa11.13□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 GmncQ3URY2 333 aa11.13□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Tm4sf1Q64302 202 aa11.13□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 KmoQ91WN4 479 aa11.13□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Def8Q99J78 448 aa11.13□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Syt5Q9R0N5 386 aa11.13□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 PygmQ9WUB3 842 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Zscan12Q9Z1D7 501 aa11.13□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Serpinb6cW4VSP4 379 aa11.13□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Unc13bQ9Z1N9 1602 aa11.13□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Tsc22d2E9Q7M2 769 aa11.13□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Rhox13F6YCR7 232 aa11.13□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Slc22a2O70577 553 aa11.13□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Mrpl10Q3TBW2 262 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Pbxip1Q3TVI8 727 aa11.13□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 C1orf109Q499E6 217 aa11.13□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Nr0b1Q61066 472 aa11.13□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Soat1Q61263 540 aa11.13□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Znf473Q8BI67 892 aa11.13□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 HnrnplQ8R081 586 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 E2f4Q8R0K9 410 aa11.13□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 FggQ8VCM7 436 aa11.13□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Spats2lQ91WJ7 558 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ankrd54Q91WK7 299 aa11.13□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Hddc3Q9D114 179 aa11.13□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Vav3Q9R0C8 847 aa11.13□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Nfs1Q9Z1J3 459 aa11.13□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm28168A0A087WNP1 180 aa11.13□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Axin1O35625 863 aa11.13□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Msh3P13705 1091 aa11.13□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Mc4rP56450 332 aa11.13□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Arf4P61750 180 aa11.13□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Pros1Q08761 675 aa11.13□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Lrrc8bQ5DU41 803 aa11.13□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Fastkd5Q7TMV3 762 aa11.13□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Slc18a2Q8BRU6 517 aa11.13□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ddx52Q8K301 598 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Kctd5Q8VC57 234 aa11.13□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Znf622Q91VY9 476 aa11.13□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 GldcQ91W43 1025 aa11.13□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Cybrd1Q925G2 290 aa11.13□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Sdcbp2Q99JZ0 292 aa11.13□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Prdm5Q9CXE0 599 aa11.13□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Slc15a2Q9ES07 729 aa11.13□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ptf1aQ9QX98 324 aa11.13□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Sae1Q9R1T2 350 aa11.13□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ttll6A4Q9E8 822 aa11.12□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Kif28pD3YXS5 1028 aa11.12□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm6685D3YYP3 228 aa11.12□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Dync1i2O88487 612 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ddx4Q61496 702 aa11.12□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Pyhin1Q8BV49 420 aa11.12□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Mab21L3Q8CI17 429 aa11.12□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Cgref1Q8R1U2 281 aa11.12□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Tcf25Q8R3L2 676 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Pcdhga9Q91XX9 932 aa11.12□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Kremen1Q99N43 473 aa11.12□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Pbld2Q9CXN7 288 aa11.12□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 AcadsbQ9DBL1 432 aa11.12□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Piwil1Q9JMB7 862 aa11.12□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ubr1O70481 1757 aa11.12□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Dpy19l4A2AJQ3 722 aa11.12□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Pabpc4lG5E8X2 370 aa11.12□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ptpn12P35831 775 aa11.12□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Clec12aQ504P2 267 aa11.12□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Bcap29Q61334 240 aa11.12□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Runx1t1Q61909 577 aa11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 26.4 ms