RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmem202Q80W35 275 aa12.91□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Thnsl1Q8BH55 747 aa12.91□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 SgczQ8BX51 311 aa12.91□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Il36gQ8R460 164 aa12.91□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hip1Q8VD75 1029 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Wrnip1Q91XU0 660 aa12.91□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nde1Q9CZA6 344 aa12.91□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Spatc1lQ9D9W0 342 aa12.91□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm6205E9PZS2 359 aa12.91□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm21293E9Q4G9 266 aa12.91□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ebf3O08791 596 aa12.91□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nedd9O35177 833 aa12.91□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gpr142Q7TQN9 365 aa12.91□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr538Q7TRT5 310 aa12.91□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ip6k2Q80V72 448 aa12.91□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PdhxQ8BKZ9 501 aa12.91□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nat14Q8BVG8 206 aa12.91□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ldhal6bQ8BVP2 382 aa12.91□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dcun1d2Q8BZJ7 259 aa12.91□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Robo4Q8C310 1012 aa12.91□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 TdrpQ8C5P7 182 aa12.91□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm6367Q8C6L9 287 aa12.91□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Prpsap2Q8R574 369 aa12.91□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pglyrp2Q8VCS0 530 aa12.91□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Necab2Q91ZP9 389 aa12.91□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tpd52l2Q9CYZ2 220 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 MajinQ9D992 256 aa12.91□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmem265E9Q8G3 109 aa12.9□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Foxm1O08696 760 aa12.9□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Soat2O88908 525 aa12.9□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Itm2bO89051 266 aa12.9□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cyp2a4P15392 494 aa12.9□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cyp2a5P20852 494 aa12.9□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fen1P39749 378 aa12.9□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Apobec1P51908 229 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Serac1Q3U213 654 aa12.9□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PkdccQ5RJI4 492 aa12.9□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CcnyQ8BGU5 341 aa12.9□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rbbp5Q8BX09 538 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Podxl2Q8CAE9 603 aa12.9□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sept8Q8CHH9 429 aa12.9□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tas1r2Q925I4 843 aa12.9□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 MutyhQ99P21 515 aa12.9□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ttc9bQ9D6E4 239 aa12.9□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ccdc103Q9D9P2 237 aa12.9□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 ClcnkbQ9WUB6 687 aa12.9□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Myo18aQ9JMH9 2050 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kif26aQ52KG5 1881 aa12.9□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ccl26F8VQM2 93 aa12.9□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rpl10aP53026 217 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Usp46P62069 366 aa12.9□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Timm13P62075 95 aa12.9□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fmo3P97501 534 aa12.9□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Krt80Q0VBK2 452 aa12.9□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Marveld2Q3UZP0 555 aa12.9□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmem237Q3V0J1 427 aa12.9□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmem45aQ60774 273 aa12.9□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hif1aQ61221 836 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dnajc1Q61712 552 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 ScapQ6GQT6 1276 aa12.9□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sp140Q6NSQ5 534 aa12.9□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Shkbp1Q6P7W2 704 aa12.9□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Prrt3Q6PE13 971 aa12.9□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sytl5Q80T23 753 aa12.9□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Clec2eQ80XD9 204 aa12.9□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Colgalt1Q8K297 617 aa12.9□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Spag16Q8K450 639 aa12.9□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Myoz3Q8R4E4 245 aa12.9□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ddx1Q91VR5 740 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc13a3Q91Y63 600 aa12.9□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Taf11Q99JX1 211 aa12.9□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trmt11Q9CWH5 460 aa12.9□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Eef1akmt2Q9D853 244 aa12.9□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Syde1Q9DBZ9 737 aa12.9□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PalmdQ9JHU2 551 aa12.9□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Map3k14Q9WUL6 942 aa12.9□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mapk13Q9Z1B7 366 aa12.9□□□□□ -0.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 AcrP23578 436 aa12.9□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tfap2aP34056 437 aa12.9□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Alox15P39654 663 aa12.9□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Matn1P51942 500 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Arl4aP61213 200 aa12.9□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Col19a1Q0VF58 1136 aa12.9□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tatdn1Q6P8M1 295 aa12.9□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rnf220Q6PDX6 566 aa12.9□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lrrc27Q80YS5 523 aa12.9□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gpr20Q8BYC4 358 aa12.9□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp62Q8C827 914 aa12.9□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 C1qtnf12Q8R2Z0 308 aa12.9□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Clptm1Q8VBZ3 664 aa12.9□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Actr3Q99JY9 418 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 SgshQ9EQ08 502 aa12.9□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PolhQ9JJN0 694 aa12.9□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Magel2Q9QZ04 1284 aa12.9□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sept5Q9Z2Q6 369 aa12.9□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Unc80Q8BLN6 3261 aa12.89□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm8444F6XS56 118 aa12.89□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Calhm3J3QMI4 347 aa12.89□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rgs2O08849 211 aa12.89□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pik3r2O08908 722 aa12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 35.7 ms