RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000008088.8

Ttc9b-201, Transcript of Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ttc9b, Length 2,052 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Mkrn2Q9ERV1 416 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 C1qtnf1Q9QXP7 281 aa20.18■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Galk1Q9R0N0 392 aa20.18■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Alpk2Q91ZB0 2144 aa20.17■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Zfp963D3Z2T8 383 aa20.17■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 PrkcdP28867 674 aa20.17■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Foxred2Q3USW5 665 aa20.17■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Asb14Q8C6Y6 587 aa20.17■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 CherpQ8CGZ0 936 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Sept8Q8CHH9 429 aa20.17■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Glis1Q8K1M4 789 aa20.17■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 C1qtnf12Q8R2Z0 308 aa20.17■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Pcdhb13Q91Y06 796 aa20.17■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Setd6Q9CWY3 473 aa20.17■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 GmprQ9DCZ1 345 aa20.17■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 D7h11orf16Q9JJR6 402 aa20.17■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Zscan5bB2RTN3 468 aa20.17■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Sbk3P0C5K0 361 aa20.17■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cd72P21855 354 aa20.17■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 CblP22682 913 aa20.17■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Vps4bP46467 444 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Lhx3P50481 400 aa20.17■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Mc1rQ01727 315 aa20.17■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Uba1Q02053 1058 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Atxn7l3bQ3UD01 97 aa20.17■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Krt32Q62168 407 aa20.17■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Hbs1lQ69ZS7 682 aa20.17■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gm5414Q6IFZ8 552 aa20.17■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Mib1Q80SY4 1006 aa20.17■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ccdc40Q8BI79 1192 aa20.17■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ticam2Q8BJQ4 232 aa20.17■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cgrrf1Q8BMJ7 332 aa20.17■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Pcdhb19Q91Y01 801 aa20.17■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tfap2dQ91ZK0 452 aa20.17■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Rwdd4Q9CPR1 188 aa20.17■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Dusp6Q9DBB1 381 aa20.17■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ism1A2ATD1 454 aa20.16■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Kifc5bE9PUA5 672 aa20.16■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Kifc3O35231 824 aa20.16■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Eef1bO70251 225 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 UmpsP13439 481 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 DesP31001 469 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 YwhaqP68254 245 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Hnrnph2P70333 449 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 HmgcrQ01237 887 aa20.16■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Slc22a16Q497L8 649 aa20.16■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Arl13bQ640N2 427 aa20.16■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Exoc3l4Q6DIA2 721 aa20.16■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ric8bQ80XE1 520 aa20.16■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Q8BGA7 448 aa20.16■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ppp6r2Q8R3Q2 923 aa20.16■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Mgat5Q8R4G6 740 aa20.16■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Nsmce3Q9CPR8 279 aa20.16■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Spatc1lQ9D9W0 342 aa20.16■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 PignQ9R1S3 931 aa20.16■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Rabgap1lA6H6A9 815 aa20.15■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2310061I04RikB8JJ69 315 aa20.15■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 P01670 111 aa20.15■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 P01671 111 aa20.15■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 P01672 111 aa20.15■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 PdgfrbP05622 1098 aa20.15■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Flt3lgP49772 232 aa20.15■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Wbp2P97765 261 aa20.15■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 AxlQ00993 888 aa20.15■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Adcy6Q01341 1165 aa20.15■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gbp1Q01514 589 aa20.15■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Arhgap45Q3TBD2 1116 aa20.15■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 ADGRF3Q58Y75 991 aa20.15■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Nemp1Q6ZQE4 437 aa20.15■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Npas4Q8BGD7 802 aa20.15■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ofcc1Q8BGX4 166 aa20.15■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Csnk1g3Q8C4X2 424 aa20.15■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Smoc2Q8CD91 447 aa20.15■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Taf10Q8K0H5 218 aa20.15■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Znf622Q91VY9 476 aa20.15■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 LrgukQ9D5S7 820 aa20.15■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Olfr1049A2ARZ0 308 aa20.15■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Fgf10O35565 209 aa20.15■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 CrymO54983 313 aa20.15■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Grem1O70326 184 aa20.15■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Dnmt3cP0DOY1 709 aa20.15■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Rplp2P99027 115 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ccdc61Q3UJV1 511 aa20.15■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Crhr2Q60748 411 aa20.15■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tbc1d1Q60949 1255 aa20.15■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Fzd6Q61089 709 aa20.15■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tmcc1Q69ZZ6 649 aa20.15■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Deup1Q7M6Y5 601 aa20.15■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Phf24Q80TL4 400 aa20.15■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Hmgxb4Q80Y32 594 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Msantd1Q8BIL2 278 aa20.15■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cypt1Q8CH20 168 aa20.15■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gspt1Q8R050 636 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Rps6kl1Q8R2S1 544 aa20.15■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 HgsQ99LI8 775 aa20.15■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 LiasQ99M04 373 aa20.15■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cacng3Q9JJV5 315 aa20.15■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Chrac1Q9JKP8 129 aa20.15■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Kif26aQ52KG5 1881 aa20.15■□□□□ 0.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Aldoart1A6ZI46 419 aa20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 28.7 ms