RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638160.1

CHML-205, Transcript of CHM like, Rab escort protein 2, human

TSL 3 BASIC

Gene CHML, Length 705 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHML-205	ENST00000638160	DGLUCY	Q7Z3D6	616 aa		27.59	■■■□□ 2.01
CHML-205	ENST00000638160	SYN2	Q92777	582 aa	Predicted RBP	27.59	■■■□□ 2.01
CHML-205	ENST00000638160	MCEE	Q96PE7	176 aa		27.59	■■■□□ 2.01
CHML-205	ENST00000638160	GPR174	Q9BXC1	333 aa		27.59	■■■□□ 2.01
CHML-205	ENST00000638160	ZYG11B	Q9C0D3	744 aa		27.59	■■■□□ 2.01
CHML-205	ENST00000638160	RAB6C	Q9H0N0	254 aa		27.59	■■■□□ 2.01
CHML-205	ENST00000638160	PCED1A	Q9H1Q7	454 aa		27.59	■■■□□ 2.01
CHML-205	ENST00000638160	RETREG1	Q9H6L5	497 aa		27.59	■■■□□ 2.01
CHML-205	ENST00000638160	RXFP3	Q9NSD7	469 aa		27.59	■■■□□ 2.01
CHML-205	ENST00000638160	IFNK	Q9P0W0	207 aa		27.59	■■■□□ 2.01
CHML-205	ENST00000638160	SLC25A13	Q9UJS0	675 aa		27.59	■■■□□ 2.01
CHML-205	ENST00000638160	BZW2	Q9Y6E2	419 aa	Known RBP	27.59	■■■□□ 2.01
CHML-205	ENST00000638160	TMCO5B	A8MYB1	307 aa		27.58	■■■□□ 2.01
CHML-205	ENST00000638160	DES	P17661	470 aa		27.58	■■■□□ 2.01
CHML-205	ENST00000638160	RPL7A	P62424	266 aa	Known RBP	27.58	■■■□□ 2.01
CHML-205	ENST00000638160	IRX4	P78413	519 aa		27.58	■■■□□ 2.01
CHML-205	ENST00000638160	DUOXA1	Q1HG43	343 aa		27.58	■■■□□ 2.01
CHML-205	ENST00000638160	TRIM61	Q5EBN2	209 aa		27.58	■■■□□ 2.01
CHML-205	ENST00000638160	WDR45B	Q5MNZ6	344 aa		27.58	■■■□□ 2.01
CHML-205	ENST00000638160	ZNF783	Q6ZMS7	281 aa		27.58	■■■□□ 2.01
CHML-205	ENST00000638160	TFAP2D	Q7Z6R9	452 aa		27.58	■■■□□ 2.01
CHML-205	ENST00000638160	PTPRN2	Q92932	1015 aa		27.58	■■■□□ 2.01
CHML-205	ENST00000638160	NTAN1	Q96AB6	310 aa		27.58	■■■□□ 2.01
CHML-205	ENST00000638160	CNPY3	Q9BT09	278 aa		27.58	■■■□□ 2.01
CHML-205	ENST00000638160	C2orf49	Q9BVC5	232 aa	Predicted RBP	27.58	■■■□□ 2.01
CHML-205	ENST00000638160	NUSAP1	Q9BXS6	441 aa	Known RBP	27.58	■■■□□ 2.01
CHML-205	ENST00000638160	PARVA	Q9NVD7	372 aa		27.58	■■■□□ 2.01
CHML-205	ENST00000638160	PATE3	B3GLJ2	98 aa		27.57	■■■□□ 2
CHML-205	ENST00000638160	ATP9B	O43861	1147 aa		27.57	■■■□□ 2
CHML-205	ENST00000638160	FTL	P02792	175 aa	Predicted RBP	27.57	■■■□□ 2
CHML-205	ENST00000638160	TPM3	P06753	285 aa		27.57	■■■□□ 2
CHML-205	ENST00000638160	ZBED6	P86452	979 aa		27.57	■■■□□ 2
CHML-205	ENST00000638160	SLC23A3	Q6PIS1	610 aa		27.57	■■■□□ 2
CHML-205	ENST00000638160	FRS2	Q8WU20	508 aa		27.57	■■■□□ 2
CHML-205	ENST00000638160	FAM129B	Q96TA1	746 aa		27.57	■■■□□ 2
CHML-205	ENST00000638160	CAPN11	Q9UMQ6	739 aa		27.57	■■■□□ 2
CHML-205	ENST00000638160	NCKAP1	Q9Y2A7	1128 aa		27.57	■■■□□ 2
CHML-205	ENST00000638160	DCHS1	Q96JQ0	3298 aa		27.56	■■■□□ 2
CHML-205	ENST00000638160	LNP1	A1A4G5	178 aa		27.56	■■■□□ 2
CHML-205	ENST00000638160	ILVBL	A1L0T0	632 aa		27.56	■■■□□ 2
CHML-205	ENST00000638160	METTL12	A8MUP2	240 aa		27.56	■■■□□ 2
CHML-205	ENST00000638160	DDX3X	O00571	662 aa	Known RBP eCLIP	27.56	■■■□□ 2	1e-10	■■■■□ 22.5
CHML-205	ENST00000638160	RTN2	O75298	545 aa		27.56	■■■□□ 2
CHML-205	ENST00000638160	SKIL	P12757	684 aa		27.56	■■■□□ 2
CHML-205	ENST00000638160	NUMB	P49757	651 aa		27.56	■■■□□ 2
CHML-205	ENST00000638160	MAMLD1	Q13495	774 aa		27.56	■■■□□ 2
CHML-205	ENST00000638160	STPG1	Q5TH74	334 aa		27.56	■■■□□ 2
CHML-205	ENST00000638160	PLEKHA7	Q6IQ23	1121 aa		27.56	■■■□□ 2
CHML-205	ENST00000638160	USP30	Q70CQ3	517 aa		27.56	■■■□□ 2
CHML-205	ENST00000638160	FAM124A	Q86V42	546 aa		27.56	■■■□□ 2
CHML-205	ENST00000638160	RGL4	Q8IZJ4	473 aa		27.56	■■■□□ 2
CHML-205	ENST00000638160	DNASE2B	Q8WZ79	361 aa		27.56	■■■□□ 2
CHML-205	ENST00000638160	EDEM2	Q9BV94	578 aa		27.56	■■■□□ 2
CHML-205	ENST00000638160	BTBD1	Q9H0C5	482 aa		27.56	■■■□□ 2
CHML-205	ENST00000638160	PABPC3	Q9H361	631 aa	Known RBP	27.56	■■■□□ 2
CHML-205	ENST00000638160	ZNF212	Q9UDV6	495 aa		27.56	■■■□□ 2
CHML-205	ENST00000638160	CCP110	O43303	1012 aa		27.55	■■■□□ 2
CHML-205	ENST00000638160	PLEK	P08567	350 aa	Predicted RBP	27.55	■■■□□ 2
CHML-205	ENST00000638160	SCAP	Q12770	1279 aa		27.55	■■■□□ 2
CHML-205	ENST00000638160	ELAVL3	Q14576	367 aa	Known RBP	27.55	■■■□□ 2
CHML-205	ENST00000638160	CST6	Q15828	149 aa		27.55	■■■□□ 2
CHML-205	ENST00000638160	ACCSL	Q4AC99	568 aa		27.55	■■■□□ 2
CHML-205	ENST00000638160	MANEAL	Q5VSG8	457 aa		27.55	■■■□□ 2
CHML-205	ENST00000638160	IL31	Q6EBC2	164 aa		27.55	■■■□□ 2
CHML-205	ENST00000638160	SLFN11	Q7Z7L1	901 aa		27.55	■■■□□ 2
CHML-205	ENST00000638160	MMAA	Q8IVH4	418 aa	Known RBP	27.55	■■■□□ 2
CHML-205	ENST00000638160	STK40	Q8N2I9	435 aa		27.55	■■■□□ 2
CHML-205	ENST00000638160	CCDC185	Q8N715	623 aa		27.55	■■■□□ 2
CHML-205	ENST00000638160	DCAF4L2	Q8NA75	395 aa		27.55	■■■□□ 2
CHML-205	ENST00000638160	CPLX3	Q8WVH0	158 aa		27.55	■■■□□ 2
CHML-205	ENST00000638160	PSMB7	Q99436	277 aa		27.55	■■■□□ 2
CHML-205	ENST00000638160	TSPY26P	Q9H489	355 aa		27.55	■■■□□ 2
CHML-205	ENST00000638160	SGK2	Q9HBY8	427 aa		27.55	■■■□□ 2
CHML-205	ENST00000638160	SUSD2	Q9UGT4	822 aa		27.55	■■■□□ 2
CHML-205	ENST00000638160	SLC6A14	Q9UN76	642 aa		27.55	■■■□□ 2
CHML-205	ENST00000638160	HS3ST2	Q9Y278	367 aa		27.55	■■■□□ 2
CHML-205	ENST00000638160	LUC7L2	Q9Y383	392 aa	Known RBP	27.55	■■■□□ 2
CHML-205	ENST00000638160	ATXN2	Q99700	1313 aa	Known RBP	27.55	■■■□□ 2
CHML-205	ENST00000638160	MEI4	A8MW99	385 aa		27.54	■■■□□ 2
CHML-205	ENST00000638160	SERPINF2	P08697	491 aa		27.54	■■■□□ 2
CHML-205	ENST00000638160	GNS	P15586	552 aa		27.54	■■■□□ 2
CHML-205	ENST00000638160	AIF1	P55008	147 aa		27.54	■■■□□ 2
CHML-205	ENST00000638160	FOXK2	Q01167	660 aa		27.54	■■■□□ 2
CHML-205	ENST00000638160	DLG2	Q15700	870 aa		27.54	■■■□□ 2
CHML-205	ENST00000638160	SCYL2	Q6P3W7	929 aa		27.54	■■■□□ 2
CHML-205	ENST00000638160	SH2D3C	Q8N5H7	860 aa		27.54	■■■□□ 2
CHML-205	ENST00000638160	VPS51	Q9UID3	782 aa		27.54	■■■□□ 2
CHML-205	ENST00000638160	CEP192	Q8TEP8	1941 aa		27.53	■■■□□ 2
CHML-205	ENST00000638160		A0A0D9SEW6	157 aa		27.53	■■■□□ 2
CHML-205	ENST00000638160	CFI	P05156	583 aa		27.53	■■■□□ 2
CHML-205	ENST00000638160	RHOQ	P17081	205 aa		27.53	■■■□□ 2
CHML-205	ENST00000638160	SLC8A1	P32418	973 aa		27.53	■■■□□ 2
CHML-205	ENST00000638160	ACSL1	P33121	698 aa		27.53	■■■□□ 2
CHML-205	ENST00000638160	DCAF12L1	Q5VU92	463 aa		27.53	■■■□□ 2
CHML-205	ENST00000638160	RWDD4	Q6NW29	188 aa	Known RBP	27.53	■■■□□ 2
CHML-205	ENST00000638160	VPS36	Q86VN1	386 aa		27.53	■■■□□ 2
CHML-205	ENST00000638160	GANC	Q8TET4	914 aa		27.53	■■■□□ 2
CHML-205	ENST00000638160	TRIM11	Q96F44	468 aa		27.53	■■■□□ 2
CHML-205	ENST00000638160	XPO4	Q9C0E2	1151 aa	Known RBP	27.53	■■■□□ 2
CHML-205	ENST00000638160	FBXL12	Q9NXK8	326 aa		27.53	■■■□□ 2

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