RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
CAPNS1-217ENST00000629983 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
CAPNS1-217ENST00000629983 SULT2A1Q06520 285 aa28.21■■■□□ 2.11
CAPNS1-217ENST00000629983 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
CAPNS1-217ENST00000629983 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
CAPNS1-217ENST00000629983 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
CAPNS1-217ENST00000629983 KLHDC7BQ96G42 594 aa28.21■■■□□ 2.11
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC34Q96HJ3 373 aa28.21■■■□□ 2.11
CAPNS1-217ENST00000629983 CAPN8A6NHC0 703 aa28.2■■■□□ 2.1
CAPNS1-217ENST00000629983 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa28.2■■■□□ 2.1
CAPNS1-217ENST00000629983 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa28.2■■■□□ 2.1
CAPNS1-217ENST00000629983 FFAR2O15552 330 aa28.2■■■□□ 2.1
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF18P17022 549 aa28.2■■■□□ 2.1
CAPNS1-217ENST00000629983 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.1
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP28.2■■■□□ 2.1
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC12A1Q13621 1099 aa28.2■■■□□ 2.1
CAPNS1-217ENST00000629983 TMC6Q7Z403 805 aa28.2■■■□□ 2.1
CAPNS1-217ENST00000629983 TRIM69Q86WT6 500 aa28.2■■■□□ 2.1
CAPNS1-217ENST00000629983 BTN2A3PQ96KV6 586 aa28.2■■■□□ 2.1
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa28.19■■■□□ 2.1
CAPNS1-217ENST00000629983 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
CAPNS1-217ENST00000629983 ERVH48-1M5A8F1 160 aa28.19■■■□□ 2.1
CAPNS1-217ENST00000629983 BNIP3LO60238 219 aa28.19■■■□□ 2.1
CAPNS1-217ENST00000629983 CNTN1Q12860 1018 aa28.19■■■□□ 2.1
CAPNS1-217ENST00000629983 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
CAPNS1-217ENST00000629983 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa28.19■■■□□ 2.1
CAPNS1-217ENST00000629983 KAT5Q92993 513 aa28.19■■■□□ 2.1
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC35C1Q96A29 364 aa28.19■■■□□ 2.1
CAPNS1-217ENST00000629983 TRIM62Q9BVG3 475 aa28.19■■■□□ 2.1
CAPNS1-217ENST00000629983 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa28.19■■■□□ 2.1
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC25A13Q9UJS0 675 aa28.19■■■□□ 2.1
CAPNS1-217ENST00000629983 SARDHQ9UL12 918 aa28.19■■■□□ 2.1
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF462Q96JM2 2506 aa28.19■■■□□ 2.1
CAPNS1-217ENST00000629983 J3QKU1 62 aa28.18■■■□□ 2.1
CAPNS1-217ENST00000629983 MPOP05164 745 aa28.18■■■□□ 2.1
CAPNS1-217ENST00000629983 THEGLP0DJG4 465 aa28.18■■■□□ 2.1
CAPNS1-217ENST00000629983 PRCPP42785 496 aa28.18■■■□□ 2.1
CAPNS1-217ENST00000629983 SYPL2Q5VXT5 272 aa28.18■■■□□ 2.1
CAPNS1-217ENST00000629983 RMND1Q9NWS8 449 aa28.18■■■□□ 2.1
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa28.18■■■□□ 2.1
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF202O95125 648 aa28.17■■■□□ 2.1
CAPNS1-217ENST00000629983 FMO5P49326 533 aa28.17■■■□□ 2.1
CAPNS1-217ENST00000629983 TMPRSS3P57727 454 aa28.17■■■□□ 2.1
CAPNS1-217ENST00000629983 GABREP78334 506 aa28.17■■■□□ 2.1
CAPNS1-217ENST00000629983 RABGAP1LQ5R372 815 aa28.17■■■□□ 2.1
CAPNS1-217ENST00000629983 ARHGAP40Q5TG30 622 aa28.17■■■□□ 2.1
CAPNS1-217ENST00000629983 AGBL4Q5VU57 503 aa28.17■■■□□ 2.1
CAPNS1-217ENST00000629983 ANKRD40Q6AI12 368 aa28.17■■■□□ 2.1
CAPNS1-217ENST00000629983 PCSK4Q6UW60 755 aa28.17■■■□□ 2.1
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC25A45Q8N413 288 aa28.17■■■□□ 2.1
CAPNS1-217ENST00000629983 OR4C6Q8NH72 309 aa28.17■■■□□ 2.1
CAPNS1-217ENST00000629983 FRS2Q8WU20 508 aa28.17■■■□□ 2.1
CAPNS1-217ENST00000629983 KLK6Q92876 244 aa28.17■■■□□ 2.1
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
CAPNS1-217ENST00000629983 UCKL1Q9NWZ5 548 aa28.17■■■□□ 2.1
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC31A1O15431 190 aa28.16■■■□□ 2.1
CAPNS1-217ENST00000629983 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
CAPNS1-217ENST00000629983 PRLRP16471 622 aa28.16■■■□□ 2.1
CAPNS1-217ENST00000629983 DGKAP23743 735 aa28.16■■■□□ 2.1
CAPNS1-217ENST00000629983 ACADSBP45954 432 aa28.16■■■□□ 2.1
CAPNS1-217ENST00000629983 UCNP55089 124 aa28.16■■■□□ 2.1
CAPNS1-217ENST00000629983 Q6ZVU0 165 aa28.16■■■□□ 2.1
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM131CQ96AQ9 280 aa28.16■■■□□ 2.1
CAPNS1-217ENST00000629983 DEPDC7Q96QD5 511 aa28.16■■■□□ 2.1
CAPNS1-217ENST00000629983 CALN1Q9BXU9 219 aa28.16■■■□□ 2.1
CAPNS1-217ENST00000629983 CPNE5Q9HCH3 593 aa28.16■■■□□ 2.1
CAPNS1-217ENST00000629983 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa28.15■■■□□ 2.1
CAPNS1-217ENST00000629983 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
CAPNS1-217ENST00000629983 ALPPL2P10696 532 aa28.15■■■□□ 2.1
CAPNS1-217ENST00000629983 OXCT1P55809 520 aa28.15■■■□□ 2.1
CAPNS1-217ENST00000629983 RHDQ02161 417 aa28.15■■■□□ 2.1
CAPNS1-217ENST00000629983 PNOCQ13519 176 aa28.15■■■□□ 2.1
CAPNS1-217ENST00000629983 RRAGAQ7L523 313 aa28.15■■■□□ 2.1
CAPNS1-217ENST00000629983 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
CAPNS1-217ENST00000629983 RNF34Q969K3 372 aa28.15■■■□□ 2.1
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM204AQ9H8W3 233 aa28.15■■■□□ 2.1
CAPNS1-217ENST00000629983 PREBQ9HCU5 417 aa28.15■■■□□ 2.1
CAPNS1-217ENST00000629983 COX16Q9P0S2 106 aa28.15■■■□□ 2.1
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A1B0GVM2 712 aa28.14■■■□□ 2.1
CAPNS1-217ENST00000629983 TRIM49BA6NDI0 452 aa28.14■■■□□ 2.1
CAPNS1-217ENST00000629983 TCAF2A6NFQ2 919 aa28.14■■■□□ 2.1
CAPNS1-217ENST00000629983 OPA1O60313 960 aa28.14■■■□□ 2.1
CAPNS1-217ENST00000629983 USP12O75317 370 aa28.14■■■□□ 2.1
CAPNS1-217ENST00000629983 PMS1P54277 932 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.1
CAPNS1-217ENST00000629983 KCNMA1Q12791 1236 aa28.14■■■□□ 2.1
CAPNS1-217ENST00000629983 CETN1Q12798 172 aa28.14■■■□□ 2.1
CAPNS1-217ENST00000629983 DLG2Q15700 870 aa28.14■■■□□ 2.1
CAPNS1-217ENST00000629983 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.1
CAPNS1-217ENST00000629983 LSMEM2Q8N112 164 aa28.14■■■□□ 2.1
CAPNS1-217ENST00000629983 KCNE4Q8WWG9 221 aa28.14■■■□□ 2.1
CAPNS1-217ENST00000629983 PPP1R9BQ96SB3 815 aa28.14■■■□□ 2.1
CAPNS1-217ENST00000629983 ABCG4Q9H172 646 aa28.14■■■□□ 2.1
CAPNS1-217ENST00000629983 POPDC2Q9HBU9 364 aa28.14■■■□□ 2.1
CAPNS1-217ENST00000629983 KLHL11Q9NVR0 708 aa28.14■■■□□ 2.1
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A1W2PQ27 194 aa28.13■■■□□ 2.09
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A1W2PQ64 194 aa28.13■■■□□ 2.09
CAPNS1-217ENST00000629983 KCNU1A8MYU2 1149 aa28.13■■■□□ 2.09
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC40Q4G0X9 1142 aa28.13■■■□□ 2.09
CAPNS1-217ENST00000629983 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
CAPNS1-217ENST00000629983 OSBPL2Q9H1P3 480 aa28.13■■■□□ 2.09
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