RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000610404.4

TTR-204, Transcript of transthyretin, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TTR, Length 1,040 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTR-204ENST00000610404 BTBD1Q9H0C5 482 aa9.14□□□□□ -0.95
TTR-204ENST00000610404 BLZF1Q9H2G9 400 aa9.14□□□□□ -0.95
TTR-204ENST00000610404 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
TTR-204ENST00000610404 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
TTR-204ENST00000610404 PLXNA2O75051 1894 aa9.13□□□□□ -0.95
TTR-204ENST00000610404 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
TTR-204ENST00000610404 SLC12A8A0AV02 714 aa9.13□□□□□ -0.95
TTR-204ENST00000610404 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
TTR-204ENST00000610404 ENC1O14682 589 aa9.13□□□□□ -0.95
TTR-204ENST00000610404 TIMM44O43615 452 aa9.13□□□□□ -0.95
TTR-204ENST00000610404 STX6O43752 255 aa9.13□□□□□ -0.95
TTR-204ENST00000610404 WISP1O95388 367 aa9.13□□□□□ -0.95
TTR-204ENST00000610404 HLA-DRAP01903 254 aa9.13□□□□□ -0.95
TTR-204ENST00000610404 WNT1P04628 370 aa9.13□□□□□ -0.95
TTR-204ENST00000610404 CYBBP04839 570 aa9.13□□□□□ -0.95
TTR-204ENST00000610404 JUPP14923 745 aa9.13□□□□□ -0.95
TTR-204ENST00000610404 SYT1P21579 422 aa9.13□□□□□ -0.95
TTR-204ENST00000610404 SCNN1AP37088 669 aa9.13□□□□□ -0.95
TTR-204ENST00000610404 NASPP49321 788 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
TTR-204ENST00000610404 ACADVLP49748 655 aa9.13□□□□□ -0.95
TTR-204ENST00000610404 ATP11AP98196 1134 aa9.13□□□□□ -0.95
TTR-204ENST00000610404 ARID5AQ03989 594 aa9.13□□□□□ -0.95
TTR-204ENST00000610404 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP9.13□□□□□ -0.95
TTR-204ENST00000610404 CUL4AQ13619 759 aa9.13□□□□□ -0.95
TTR-204ENST00000610404 INAVAQ3KP66 663 aa9.13□□□□□ -0.95
TTR-204ENST00000610404 KIAA0895LQ68EN5 471 aa9.13□□□□□ -0.95
TTR-204ENST00000610404 SHC4Q6S5L8 630 aa9.13□□□□□ -0.95
TTR-204ENST00000610404 CHST9Q7L1S5 443 aa9.13□□□□□ -0.95
TTR-204ENST00000610404 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
TTR-204ENST00000610404 TADA2BQ86TJ2 420 aa9.13□□□□□ -0.95
TTR-204ENST00000610404 ADIPOR2Q86V24 386 aa9.13□□□□□ -0.95
TTR-204ENST00000610404 ARMC10Q8N2F6 343 aa9.13□□□□□ -0.95
TTR-204ENST00000610404 LINC00301Q8NCQ3 95 aa9.13□□□□□ -0.95
TTR-204ENST00000610404 ENGASEQ8NFI3 743 aa9.13□□□□□ -0.95
TTR-204ENST00000610404 TAF4BQ92750 862 aa9.13□□□□□ -0.95
TTR-204ENST00000610404 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
TTR-204ENST00000610404 SLC6A18Q96N87 628 aa9.13□□□□□ -0.95
TTR-204ENST00000610404 ARID3AQ99856 593 aa9.13□□□□□ -0.95
TTR-204ENST00000610404 NT5C1AQ9BXI3 368 aa9.13□□□□□ -0.95
TTR-204ENST00000610404 DUSP16Q9BY84 665 aa9.13□□□□□ -0.95
TTR-204ENST00000610404 SLC2A11Q9BYW1 496 aa9.13□□□□□ -0.95
TTR-204ENST00000610404 CUEDC2Q9H467 287 aa9.13□□□□□ -0.95
TTR-204ENST00000610404 MTG2Q9H4K7 406 aa9.13□□□□□ -0.95
TTR-204ENST00000610404 EBF2Q9HAK2 575 aa9.13□□□□□ -0.95
TTR-204ENST00000610404 PRSS16Q9NQE7 514 aa9.13□□□□□ -0.95
TTR-204ENST00000610404 DMAC2Q9NW81 257 aa9.13□□□□□ -0.95
TTR-204ENST00000610404 MARCH2Q9P0N8 246 aa9.13□□□□□ -0.95
TTR-204ENST00000610404 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
TTR-204ENST00000610404 SERGEFQ9UGK8 458 aa9.13□□□□□ -0.95
TTR-204ENST00000610404 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa9.13□□□□□ -0.95
TTR-204ENST00000610404 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
TTR-204ENST00000610404 WNT9AO14904 365 aa9.12□□□□□ -0.95
TTR-204ENST00000610404 VILLO15195 856 aa9.12□□□□□ -0.95
TTR-204ENST00000610404 RFPL3O75679 317 aa9.12□□□□□ -0.95
TTR-204ENST00000610404 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
TTR-204ENST00000610404 DNTTP04053 509 aa9.12□□□□□ -0.95
TTR-204ENST00000610404 RPN1P04843 607 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
TTR-204ENST00000610404 CD58P19256 250 aa9.12□□□□□ -0.95
TTR-204ENST00000610404 PDCP20941 246 aa9.12□□□□□ -0.95
TTR-204ENST00000610404 HNF1BP35680 557 aa9.12□□□□□ -0.95
TTR-204ENST00000610404 PIK3CAP42336 1068 aa9.12□□□□□ -0.95
TTR-204ENST00000610404 SGSHP51688 502 aa9.12□□□□□ -0.95
TTR-204ENST00000610404 BCAT1P54687 386 aa9.12□□□□□ -0.95
TTR-204ENST00000610404 C21orf59P57076 290 aa9.12□□□□□ -0.95
TTR-204ENST00000610404 RACK1P63244 317 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
TTR-204ENST00000610404 AMPD3Q01432 767 aa9.12□□□□□ -0.95
TTR-204ENST00000610404 ZBTB16Q05516 673 aa9.12□□□□□ -0.95
TTR-204ENST00000610404 CUL4BQ13620 913 aa9.12□□□□□ -0.95
TTR-204ENST00000610404 RTP5Q14D33 572 aa9.12□□□□□ -0.95
TTR-204ENST00000610404 STK38Q15208 465 aa9.12□□□□□ -0.95
TTR-204ENST00000610404 E2F5Q15329 346 aa9.12□□□□□ -0.95
TTR-204ENST00000610404 HES3Q5TGS1 186 aa9.12□□□□□ -0.95
TTR-204ENST00000610404 FBXL19Q6PCT2 694 aa9.12□□□□□ -0.95
TTR-204ENST00000610404 BHLHA9Q7RTU4 235 aa9.12□□□□□ -0.95
TTR-204ENST00000610404 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
TTR-204ENST00000610404 ZNF605Q86T29 641 aa9.12□□□□□ -0.95
TTR-204ENST00000610404 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa9.12□□□□□ -0.95
TTR-204ENST00000610404 WFDC5Q8TCV5 224 aa9.12□□□□□ -0.95
TTR-204ENST00000610404 SAP25Q8TEE9 199 aa9.12□□□□□ -0.95
TTR-204ENST00000610404 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa9.12□□□□□ -0.95
TTR-204ENST00000610404 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
TTR-204ENST00000610404 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
TTR-204ENST00000610404 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
TTR-204ENST00000610404 BACH2Q9BYV9 841 aa9.12□□□□□ -0.95
TTR-204ENST00000610404 SGK2Q9HBY8 427 aa9.12□□□□□ -0.95
TTR-204ENST00000610404 ABCB8Q9NUT2 735 aa9.12□□□□□ -0.95
TTR-204ENST00000610404 GGA2Q9UJY4 613 aa9.12□□□□□ -0.95
TTR-204ENST00000610404 MTMR6Q9Y217 621 aa9.12□□□□□ -0.95
TTR-204ENST00000610404 AK5Q9Y6K8 562 aa9.12□□□□□ -0.95
TTR-204ENST00000610404 MYLKQ15746 1914 aa9.11□□□□□ -0.95
TTR-204ENST00000610404 TENM4Q6N022 2769 aa9.11□□□□□ -0.95
TTR-204ENST00000610404 A0A1W2PPC4 97 aa9.11□□□□□ -0.95
TTR-204ENST00000610404 A0A1W2PR77 199 aa9.11□□□□□ -0.95
TTR-204ENST00000610404 FAM47DPA6NHR8 397 aa9.11□□□□□ -0.95
TTR-204ENST00000610404 SPTLC2O15270 562 aa9.11□□□□□ -0.95
TTR-204ENST00000610404 DFNA5O60443 496 aa9.11□□□□□ -0.95
TTR-204ENST00000610404 MED26O95402 600 aa9.11□□□□□ -0.95
TTR-204ENST00000610404 TGFB1P01137 390 aa9.11□□□□□ -0.95
TTR-204ENST00000610404 ITGAVP06756 1048 aa9.11□□□□□ -0.95
TTR-204ENST00000610404 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.1 ms